Лишние электроны. Что делать?

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Wishmaster*
Сообщения: 11
Зарегистрирован: Вт авг 23, 2011 3:41 am

Лишние электроны. Что делать?

Сообщение Wishmaster* » Вт авг 23, 2011 3:58 am

Здравствуйте. Я оптимизирую геометрию системы "положительно заряженный катион и молекула воды". Работаю в Firefly. Столкнулся с такой проблемой: моя система в целом должна быть нейтральна (это своего рода переходное состояние (P.S боже, как нас много)) но программа упорно насчитывает лишние 2 электрона, т.е рассматривает катион как нейтральную молекулу, не учитывая того, что в ходе реакции вещество уже окислилось. в моей системе электронов 229, но мне упорно выдаются 231. Посоветуйте, что можно сделать в этой ситуации.

И еще, при расчете гессиана молекулы можно указать свою температуру. А можно как-то указать сразу несколько температур, чтоб 20 раз гессиан не пересчитывать? Я делаю так: temp=100,200,300
Но убедился в том, что это бесполезно...
Заранее спасибо.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1667
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Лишние электроны. Что делать?

Сообщение sanya1024 » Вт авг 23, 2011 1:11 pm

Есть такая опция $CONTRL ICHARG=<число> $END
Пока не поставите правильный заряд, все результаты, к-рые получаете, можете смело выкидывать. Поэтому сначала очень хорошо подумайте, какой на самом деле у Вас заряд. Если это катион + нейтральная молекула, то никакой нейтральности суммарной системы не может быть, суммарный заряд = заряду катиона. Если система в целом нейтральна, то ее суммарный заряд 0, а как он распределится по подсистемам -- ССП покажет. Если у Вас все-таки катион, но система должна быть нейтральной, подумайте о противоионе.
Короче, думайте.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 2 гостя