возобновить прерванный расчёт в priroda/orca

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
C10H16
Сообщения: 733
Зарегистрирован: Ср мар 14, 2007 3:12 pm

возобновить прерванный расчёт в priroda/orca

Сообщение C10H16 » Ср сен 28, 2011 12:23 pm

Здравствуйте коллеги! Подскажите пожалуйста: как возобновить прерванную оптимизацию геометрии в программах priroda и orca2.7? Мануал орки смотрел, но бегло, с первого взгляда не обнаружил. Вчитываться к сожалению времени не хватает, а результаты расчётов тоже ой как срочно нужны. Пройдёт ли в таком случае вариант: беру последнюю (до обрыва) геометрию с минимальной энергией и стартую оптимизацию с неё?
Бог даёт лучшее тому, кто оставляет выбор за Ним

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1667
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: возобновить прерванный расчёт в priroda/orca

Сообщение sanya1024 » Ср сен 28, 2011 3:05 pm

Этот метод вполне годится, обычно так и делают.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Аватара пользователя
C10H16
Сообщения: 733
Зарегистрирован: Ср мар 14, 2007 3:12 pm

Re: возобновить прерванный расчёт в priroda/orca

Сообщение C10H16 » Ср сен 28, 2011 4:39 pm

Спасибо.

Смутил тот факт, что в гауссиане есть опция restart в ключевом слове opt. Или она по сути выполняет ту же последовательность действий (берёт последнюю перед разрывом геометрию) но автоматически?
Бог даёт лучшее тому, кто оставляет выбор за Ним

o-oxhem
Сообщения: 425
Зарегистрирован: Вт июл 08, 2008 10:33 pm

Re: возобновить прерванный расчёт в priroda/orca

Сообщение o-oxhem » Ср сен 28, 2011 8:44 pm

Автоматически считывает последнюю геометрию и результат SCF (если было выполнено)

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1667
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: возобновить прерванный расчёт в priroda/orca

Сообщение sanya1024 » Чт сен 29, 2011 12:59 am

Может быть, еще градиент и приближенный гессиан. Но обычно этого не нужно: если просто стартовать с последней геометрии, на 1 шагу будет пересчитано ССП, градиент и приближенный гессиан -- и все пойдет оптимизироваться дальше.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Аватара пользователя
C10H16
Сообщения: 733
Зарегистрирован: Ср мар 14, 2007 3:12 pm

Re: возобновить прерванный расчёт в priroda/orca

Сообщение C10H16 » Чт сен 29, 2011 4:00 pm

Спасибо! Теперь всё понятно.
Бог даёт лучшее тому, кто оставляет выбор за Ним

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 3 гостя