Компьютеры для квантовохимических расчетов
Компьютеры для квантовохимических расчетов
Предлагаю обсудить железо для расчетов.
Вопрос по Bulldozer от AMD с его "хитрыми" 8 ядрами (у него 2 ядра с командами х86 на один блок MMX и др. расширения). Как параллелятся задачи? Ускорение такое же как на полноценных ядрах? В частности интересует Priroda.
Вопрос по Bulldozer от AMD с его "хитрыми" 8 ядрами (у него 2 ядра с командами х86 на один блок MMX и др. расширения). Как параллелятся задачи? Ускорение такое же как на полноценных ядрах? В частности интересует Priroda.
-
- Сообщения: 50
- Зарегистрирован: Ср июн 28, 2006 1:17 pm
- Контактная информация:
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Я тестирую эти процессоры вот уже месяц. Хотя про Природу ничего сказать не могу, могу уже достаточно уверенно сказать про Firefly и про общие ощущения. Микроархитектура и сами процессоры - крайне неудачные. Никому не советую покупать и использовать системы на базе Бульдозеров. Да и кодовое название какое неэстетичное, чего от таких ожидать В силу разных причин, я пока не проводил полностью систематического исследования на наших стандартных наборах тестов, поэтому на сайте ff, наверное, детальная информация появится несколько позже. Но есть большой соблазн просто там написать, что Firefly не поддерживает эти процессоры.
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Спасибо за ответ, а то уже собрался на нём комп собирать.
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Распаралеливание процессов зависит от проги. На счет Природы не в курсах. Gamess автоматически паралелится, гауссина при повощи параметра "Shared processors" ....остальные не паралелятся, насколько я заню. Работаю На Dual CORE E5400
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Все будет зависеть от компилятора.asp писал(а):Предлагаю обсудить железо для расчетов.
Вопрос по Bulldozer от AMD с его "хитрыми" 8 ядрами (у него 2 ядра с командами х86 на один блок MMX и др. расширения). Как параллелятся задачи? Ускорение такое же как на полноценных ядрах? В частности интересует Priroda.
http://opennet.ru/opennews/art.shtml?num=32245
Ресурс Phoronix провёл тестирование производительности кода, сгенерированного компиляторами GCC 4.6.2, LLVM/Clang 3.0-RC1 и AMD Open64 4.2.5.2 на платформах Intel Sandy Bridge и AMD Shanghai. Отдельно представлены результаты тестирования на платформе AMD Bulldozer.
Компилятор AMD Open64 продемонстрировал отличную производительность на платформах компании AMD, почти в два раза обогнав конкурентов в тесте C-Ray....
If you are not part of the solution, you are part of the precipitate.
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
а про nvidia cuda для dft методов пока ничего не слышно? в фф вроде как было для mp4..
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Что-то тестировали.VIPer писал(а):а про nvidia cuda для dft методов пока ничего не слышно? в фф вроде как было для mp4..
http://www.nvidia.ru/object/computation ... ry_ru.html
Но судя по названиям "Бакиболл", "Холестерол" это были не специалисты в химии.
If you are not part of the solution, you are part of the precipitate.
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Уважаемые форумчане!
Считаю катализаторы на основе переходных металлов в основном DFT, MP2(3,4) в PC GAMESS, GAMESS-US, редко в Gaussian 09W из-под Windows 7 x64 и OpenSuse 12.1.
Хочу собрать расчетную машину, помогите выбрать процессор.
1. AMD Phenom II X6 1100T 3.3 GHz
2. AMD FX-6100 3.3GHz
3. AMD FX-8150 3.6GHz
4. Intel Core i7-2600K 3.4GHz
5. Intel Core i7-3930K 3.2 ГГц
Предполагается СЖО и небольшой разгон ~20%.
По поводу №3 все понятно из данной ветки форума (неудачный вариант). Что скажете по поводу остальных? Вариант: двухпроцессорный сервер на Socket LGA 1366 рассматривал, но выходит дороговато.
Что посоветуете? Может есть альтернативные варианты.
Буду благодарен за ответы!
Считаю катализаторы на основе переходных металлов в основном DFT, MP2(3,4) в PC GAMESS, GAMESS-US, редко в Gaussian 09W из-под Windows 7 x64 и OpenSuse 12.1.
Хочу собрать расчетную машину, помогите выбрать процессор.
1. AMD Phenom II X6 1100T 3.3 GHz
2. AMD FX-6100 3.3GHz
3. AMD FX-8150 3.6GHz
4. Intel Core i7-2600K 3.4GHz
5. Intel Core i7-3930K 3.2 ГГц
Предполагается СЖО и небольшой разгон ~20%.
По поводу №3 все понятно из данной ветки форума (неудачный вариант). Что скажете по поводу остальных? Вариант: двухпроцессорный сервер на Socket LGA 1366 рассматривал, но выходит дороговато.
Что посоветуете? Может есть альтернативные варианты.
Буду благодарен за ответы!
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
При ограниченном бюджете лучше i7-2600K и побольше быстрой памяти.
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Спасибо. А что скажете по-поводу модели постарше i7 3930K?Yu/2 писал(а):При ограниченном бюджете лучше i7-2600K и побольше быстрой памяти.
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Можно купить, но не в ущерб памяти и материнской плате, и если нужные методы в используемом софте хорошо параллелятся.Kuzmin писал(а): Спасибо. А что скажете по-поводу модели постарше i7 3930K?
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
По поводу памяти есть комплект DDR3 Corsair XMS3 4*2Gb с частотой 1600 МГц стоит в связке с i5 750... Склоняюсь к покупке все-же камня i7 3930K для него скорее всего возьму комплект DDR3 4096MBx4 PC12800 1600MHz Corsair Vengeance LP 9-9-9-24 и мать ASUS LGA2011 P9X79 PRO X79 8xDDR3-2400 (4xPCI-E3,0(16+16+8+8) 8ch BT 4xSATA 4xSATA3 RAID 6xUSB3 eSATA ATX). Остальные запчасти в принципе имеются: 2шт. SSD по 90Гб, 2шт. SATA2 по 1 Тб и киловаттник.
Я так понимаю что довольно проблематично параллелится можно и на меньшем числе ядер запустить, ну или две задачи одновременно решать?
Вообще по какому параметру выбрать проц: SuperPi тест, LinX тест или какой-то иной бенчмарк?
Я так понимаю что довольно проблематично параллелится можно и на меньшем числе ядер запустить, ну или две задачи одновременно решать?
Вообще по какому параметру выбрать проц: SuperPi тест, LinX тест или какой-то иной бенчмарк?
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
А зачем вам 2 штуки SSD?
If you are not part of the solution, you are part of the precipitate.
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Оптимально в качестве бенчмарков использовать задачи, максимально приближенные к тем, которые вы собираетесь решать.Kuzmin писал(а):Вообще по какому параметру выбрать проц: SuperPi тест, LinX тест или какой-то иной бенчмарк?
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
зачем память корсар? возьмите хайникс или самсунг, они и стоят дешевле, и гонятся очень даже. на тех же корсаровских частотах спокойно будут работать. корсар - это только доплата за брэнд, а зачастую ещё гемор с матерями.. сам сталкивался, во времена ddr-2
-
- Сообщения: 50
- Зарегистрирован: Ср июн 28, 2006 1:17 pm
- Контактная информация:
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Что касается более-менее репрезентативных бенчмарков Firefly, то они есть у нас на сайте в разделе "Performance". Кончается там все на i7-2600K, но с тех пор ничего качественно лучшего не появлялось, за исключением наращивания числа ядер. Для полноты картины не хватает результатов для Бульдозера. Каюсь, немного подзапустил это дело, но довольно скоро все же надеюсь их тоже опубликовать. В целом, на AMD FX 8120 с формальной частотой 3.1 GHz результаты на всех восьми ядрах совсем немного получше, чем для старенького уже Phenom II X4 955 3.2 GHz
starless писал(а):Оптимально в качестве бенчмарков использовать задачи, максимально приближенные к тем, которые вы собираетесь решать.Kuzmin писал(а):Вообще по какому параметру выбрать проц: SuperPi тест, LinX тест или какой-то иной бенчмарк?
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Удобно в RAID0 считать MP2, например, на 4-х ядрах.kbob писал(а):А зачем вам 2 штуки SSD?
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Вы, конечно, правы. У хиникса и самсунга пока не встречал такие комплекты памяти, у кингстона есть, и цена совсем на немного отличается... В любом случае учту Ваши замечания!VIPer писал(а):зачем память корсар? возьмите хайникс или самсунг, они и стоят дешевле, и гонятся очень даже. на тех же корсаровских частотах спокойно будут работать. корсар - это только доплата за брэнд, а зачастую ещё гемор с матерями.. сам сталкивался, во времена ddr-2
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
да там и комплекты не нужны, просто берите сколько нужно штук планок по 4 гб и всё одна планка будет порядка 700-800 р где-то. 8 гигов - почти 1,5 тыщи, 16 - 3 тыщи. не помню, когда так память дёшево стоила) я брал корсар 2 по 2 китом за 5 с чем-то.. DDR-2.. потом еле продал.
-
- Сообщения: 23
- Зарегистрирован: Пн дек 15, 2014 2:09 pm
Re: Компьютеры для квантовохимических расчетов
Доброго времени суток! Собираем комп для расчетов (молекулярная квантовая химия, задачи, в основном, DFT оптимизация) и есть сомнение в том, стоит ли переплачивать за DDR5 вместо DDR4 и более высокую тактовую частоту (4,5 ГГц против 3,4 ГГц) при условии, что ядер будет меньше, 12 вместо 16. Конкретные сравниваемые процы AMD Ryzen 9 7950X и AMD Ryzen 9 5950X. Если у кого-то есть опыт или мысли по этому поводу, пожалуйста, поделитесь
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 1 гость