Разные вопросы по FF
Re: Разные вопросы по FF
В ГАУССИАНе есть две процедуры QST2 и QST3, которые гарантированно (в разумных пределах) находят правильное TS, с которого и нужно стартовать.
После отстоя требуйте долива
-
- Сообщения: 40
- Зарегистрирован: Пт июл 11, 2014 11:19 pm
Re: Разные вопросы по FF
Спасибо за совет.
Если поясните, как этот совет помогает проблеме рассмотрения, в какой минимум ведет релаксация вертикально возбужденной молекулы (естественно, не обязанной и не попадающей в TS на вoзбужденной поверхности) - буду особенно благодарна.
Есть два пути скатиться ниже в подобные по энергии минимумы, но разной природы (один - global minimum, другой - conical intersection minimum, барьера нет, второй выше), соответственно надо оценить, в какой минимум ведут более крутые градиенты. Я вижу два пути - расчет Мinimum Еnergy Path посредством IRC. Второй - ручная линейная интерполяция координат (получения промежуточных геометрий между Franc Condon Excited State и минимумами), релаксации полученных геометрий и оценка энергий, но я не уверена что второй путь годен для поставленной задачи, потому и бьюсь с IRC.
Если поясните, как этот совет помогает проблеме рассмотрения, в какой минимум ведет релаксация вертикально возбужденной молекулы (естественно, не обязанной и не попадающей в TS на вoзбужденной поверхности) - буду особенно благодарна.
Есть два пути скатиться ниже в подобные по энергии минимумы, но разной природы (один - global minimum, другой - conical intersection minimum, барьера нет, второй выше), соответственно надо оценить, в какой минимум ведут более крутые градиенты. Я вижу два пути - расчет Мinimum Еnergy Path посредством IRC. Второй - ручная линейная интерполяция координат (получения промежуточных геометрий между Franc Condon Excited State и минимумами), релаксации полученных геометрий и оценка энергий, но я не уверена что второй путь годен для поставленной задачи, потому и бьюсь с IRC.
Re: Разные вопросы по FF
Релаксация при вертикальном возбуждении ведет в ближайший минимум, который не обязательно глобальный. Он обычно глобальный, если молекула жесткая или маленькая. Для больших молекул всегда нужно проводить конформационный поиск.
Для малых жестких молекул обычно попадают в колебательно возбужденное состояние вблизи минимума (принцип ФК), для больших многоатомных молекул попадаете куда угодно.
Для малых жестких молекул обычно попадают в колебательно возбужденное состояние вблизи минимума (принцип ФК), для больших многоатомных молекул попадаете куда угодно.
После отстоя требуйте долива
-
- Сообщения: 40
- Зарегистрирован: Пт июл 11, 2014 11:19 pm
Re: Разные вопросы по FF
Речь сейчас не о том, куда ведет релаксация, а куда энергетически выгоднее пойти - где путь резче.
Про конформеры и др неглобальные мимумы я в курсе, спасибо.
PS Как мне известно, принцип говорит и неизменности положения ядер в момент возбуждения (о "вертикальности" возбуждения), а уже дальше учитывают Born-Oppenheimer принцип и выводят, что вероятность перехода прямо зависит от квадрата оверлепа вибрац. функций (помноженной на квадрат оверлепа эл. функций и спиновых функций). То есть я не вижу причин, чтобы в общем случае не попадать куда угодно (н-р, что бы не попасть маленькой молекуле выше dissociation limit возбужденного состояния, а не на ее вибрац. уровень близкий к минимуму).
Про конформеры и др неглобальные мимумы я в курсе, спасибо.
PS Как мне известно, принцип говорит и неизменности положения ядер в момент возбуждения (о "вертикальности" возбуждения), а уже дальше учитывают Born-Oppenheimer принцип и выводят, что вероятность перехода прямо зависит от квадрата оверлепа вибрац. функций (помноженной на квадрат оверлепа эл. функций и спиновых функций). То есть я не вижу причин, чтобы в общем случае не попадать куда угодно (н-р, что бы не попасть маленькой молекуле выше dissociation limit возбужденного состояния, а не на ее вибрац. уровень близкий к минимуму).
Re: Разные вопросы по FF
Мне категорически непонятно зачем искать TS если вопрос стоит не в том чтобы найти глобальный минимум а скатиться в ближайший локальный откуда релаксировать.
alexandrao2 - а почему нельзя просто сделать оптимизацию? У вас же по сути некая неоптимальная геометрия (неважно в каком состоянии). Ну так и дайте ей ехать куда ей едется.
alexandrao2 - а почему нельзя просто сделать оптимизацию? У вас же по сути некая неоптимальная геометрия (неважно в каком состоянии). Ну так и дайте ей ехать куда ей едется.
Re: Разные вопросы по FF
Это уже не Борн-Оппенгеймер. Это, как минимум, адиабатическое приближение.alexandrao2 писал(а):Речь сейчас не о том, куда ведет релаксация, а куда энергетически выгоднее пойти - где путь резче.
Вы собираетесь решать такую задачу?
После отстоя требуйте долива
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 10 гостей