Визуализация электронной плотности в Гауссиане.

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Визуализация электронной плотности в Гауссиане.

Сообщение etzell » Вт окт 30, 2012 9:08 pm

Подскажите, как можно визуализировать электронную плотность в Гауссиане 9 версии? Раньше делал, помню создавал файлы cube, после через gausview решал данную задачу. Однако, что запамятовал). Может кто быстро подскаже?

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: Визуализация электронной плотности в Гауссиане.

Сообщение AlexKsen » Ср окт 31, 2012 7:59 pm

Отгрываете в GaussView *.chk файл, затем Results, далее Surfaces/ Cubes, далее открывается окно Surfaces and Cubes и там уже ищете, что Вам нужно!

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Визуализация электронной плотности в Гауссиане.

Сообщение etzell » Чт ноя 01, 2012 10:33 pm

Эти шаги мне известны. Проблема в другом. Гауссиан 09 под виндовс 7 никак не хочет создавать chk файлы. Во время расчета они создаются в папке scratch, но после удаляются автоматом. Я уже пробовал комманды Chk=file.chk, CubeDensity (просто тупо вылетает, когда пытается в конце расчета создать cube файл) или просто Density (файлы в scratch автоматом удалются). В чем здесь проблемы?

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13063
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Визуализация электронной плотности в Гауссиане.

Сообщение Гесс » Пт ноя 02, 2012 2:01 am

Это чтото неправильное! У меня под 7кой с фразой %chk=имя_без_всяких_расширений чекпоинт создается и никуда не пропадает.

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Визуализация электронной плотности в Гауссиане.

Сообщение etzell » Пт ноя 02, 2012 2:53 am

Сейчас, переустановил гауссиан 09, все получилось. Кстати, а как сделать 2d распределение электронной плотности? (не контурное, а виде цветной картинки, но в 2d) в гаусвью?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Визуализация электронной плотности в Гауссиане.

Сообщение VTur » Вс ноя 04, 2012 5:48 pm

Т.е. не линии, а цветные разводы?
Все, что он может указано в "Displaying Surfaces and Contours" в Хелпе.
После отстоя требуйте долива

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Визуализация электронной плотности в Гауссиане.

Сообщение etzell » Вс ноя 04, 2012 5:58 pm

Все ок. я использовал chemcraft, более красивее получилось).

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 32 гостя