молекула

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Ответить
maks
Сообщения: 15183
Зарегистрирован: Вс апр 19, 2009 3:32 pm

молекула

Сообщение maks » Чт ноя 28, 2024 1:46 pm

Уважаемые коллеги
У биологов есть такая молекула . Фотоинициатор в их замысле. Поглощает в УФ и видимой области ,точная длина волны это ниже их достоинства где-то пятьсот, красноватый такой :lol: и даже экстинция в видимой , где не помнят . Ладно, кинули они ее в фосфатный буфер pH=7.5 там где у них плавала анаеробная культура, почему то , фотоинициатора в 3 раза больше .Но больше чем количество бактерий это как они сравнивали может кому-то ясно ?
Поставили под азотом. Анаероб накрылся, они возрадовались. Только говорят скажи почему пропало поглощение в видимой области, Он стал почти бесцветный ? что случилось с этой молекулой ?
Если у кого-то есть желание пофантазировать- пожалуйста !

Параллельно пару моментов
1)может быть чисто фотохим кливедж, есть ли такой без кислорода ? ( с кислородом то эта молекула ожидаемо дает дикислородный мостик центрального периленового кольца- подтверждено литературой)
2) оба хиральных центра активны, там где гидроксил S, там где кетон R
3) 3) есть мысль сделать лиофилизацию и для начала ВЭЖХ, посмотреть сколько там есть огрызков стартовой фотомолекулы ( это их очень интересует), но опять же биологическая ароматика в УФ вылазить будет.
Короче резвитесь коллеги
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
он химик, он ботаник-князь Федор , мой племянник

Аватара пользователя
SkydiVAR
Сообщения: 10339
Зарегистрирован: Пн янв 19, 2009 12:51 am
Контактная информация:

Re: молекула

Сообщение SkydiVAR » Чт ноя 28, 2024 2:25 pm

Коллега, а Вы не рассматривали восстановление этой хиноидной структуры бактериальными метаболитами или ещё какой гадостью из бульона?
Может, тут не фотолиз виноват?

ЗЫ: Посмотрите файлы, коллега, может быть найдёте что-нибудь интересное.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Меч-кладенец - оружие пофигистов.

maks
Сообщения: 15183
Зарегистрирован: Вс апр 19, 2009 3:32 pm

Re: молекула

Сообщение maks » Чт ноя 28, 2024 3:02 pm

сказал им сделать опыт без бактерий и опыт с бактериями без фотохимии. Пока сделают решил спросить о мыслях.
метаболиты , что собой представляют не знаю . Спасибо за литературу
он химик, он ботаник-князь Федор , мой племянник

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 5293
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: молекула

Сообщение bigM » Чт ноя 28, 2024 9:25 pm

о-о! новый антибиотик!
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Jokermaniak
Сообщения: 3825
Зарегистрирован: Чт окт 02, 2014 4:41 pm

Re: молекула

Сообщение Jokermaniak » Пт ноя 29, 2024 12:24 am

А может оно куда-то в клетку заперлось и там связалось необратимо?
SkydiVAR писал(а):
Чт ноя 28, 2024 2:25 pm
Коллега, а Вы не рассматривали восстановление этой хиноидной структуры бактериальными метаболитами или ещё какой гадостью из бульона?
Может, тут не фотолиз виноват?
Перилен тоже в видимой области поглощает.
maks писал(а):
Чт ноя 28, 2024 1:46 pm
фотоинициатора в 3 раза больше .Но больше чем количество бактерий это как они сравнивали может кому-то ясно ?
Зная, что такое биологи, предположу, что по массе. Ну или если это продвинутые биологи, то по 3 молекулы на 1 клетку.
maks писал(а):
Чт ноя 28, 2024 1:46 pm
3) 3) есть мысль сделать лиофилизацию и для начала ВЭЖХ, посмотреть сколько там есть огрызков стартовой фотомолекулы ( это их очень интересует), но опять же биологическая ароматика в УФ вылазить будет.
Короче резвитесь коллеги
ВЭЖХ-МС надо.
maks писал(а):
Чт ноя 28, 2024 1:46 pm
Фотоинициатор в их замысле.
Фотоинициатор? Ну, пусть инициатор.
Что, Карл Маркс запрещает держать на лестнице ковры? Разве где-нибудь у Карла Маркса сказано, что 2-й подьезд калабуховского дома на Пречистенеке следует забить досками и ходить кругом через черный двор?

Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6948
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Re: молекула

Сообщение Phobos » Пт ноя 29, 2024 10:09 am

А у этой молекулы есть растворимость в воде? Какая там кислотность у фенолов?
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

Nickolas
Сообщения: 1721
Зарегистрирован: Пн авг 27, 2007 8:15 pm

Re: молекула

Сообщение Nickolas » Пт ноя 29, 2024 1:06 pm

Phobos писал(а):
Пт ноя 29, 2024 10:09 am
А у этой молекулы есть растворимость в воде?
Растворимость очень плохая, согласно прикрепленной коллегой статье. Для работы с ним бычно используют смеси воды с органикой.

Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6948
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Re: молекула

Сообщение Phobos » Пт ноя 29, 2024 1:41 pm

И насколько микробы могут быть живучи в смеси воды с полярными растворителями? В какой вообще форме она будет в фосфатном буфере 7.5? Суспензия в воде и 10 ппм в растворе?
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

kbob
Сообщения: 1950
Зарегистрирован: Сб окт 17, 2009 9:48 am

Re: молекула

Сообщение kbob » Пт ноя 29, 2024 3:12 pm

bigM писал(а):
Чт ноя 28, 2024 9:25 pm
о-о! новый антибиотик!
Его из грибов получают, поэтому неновый
https://link.springer.com/article/10.10 ... 790-4#Fig1

Кстати эти грибочки есть можно или тоже "обесцветишся"?
If you are not part of the solution, you are part of the precipitate.

Аватара пользователя
Jokermaniak
Сообщения: 3825
Зарегистрирован: Чт окт 02, 2014 4:41 pm

Re: молекула

Сообщение Jokermaniak » Сб ноя 30, 2024 1:38 am

Phobos писал(а):
Пт ноя 29, 2024 1:41 pm
И насколько микробы могут быть живучи в смеси воды с полярными растворителями? В какой вообще форме она будет в фосфатном буфере 7.5? Суспензия в воде и 10 ппм в растворе?
Да ДМСО добавляют, нормальная практика у биологов. И микробы живут.
Что, Карл Маркс запрещает держать на лестнице ковры? Разве где-нибудь у Карла Маркса сказано, что 2-й подьезд калабуховского дома на Пречистенеке следует забить досками и ходить кругом через черный двор?

Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6948
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Re: молекула

Сообщение Phobos » Сб ноя 30, 2024 11:36 am

А на планарность конформации это может повлиять?У нас есть одна молекула из порфиринов, в метанольном растворе бурно окисляется кислородом воздуха в внесением гидроксила на активный метилен. Если добавить к метанолу 50% ДМФ, то окисление полностью останавливается. Ученые умы пытаются это задним числом объяснить через изменение конформации с уходом активного метилена куда-то в неактивную позицию.
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

Аватара пользователя
Jokermaniak
Сообщения: 3825
Зарегистрирован: Чт окт 02, 2014 4:41 pm

Re: молекула

Сообщение Jokermaniak » Сб ноя 30, 2024 8:37 pm

Phobos писал(а):
Сб ноя 30, 2024 11:36 am
А на планарность конформации это может повлиять?У нас есть одна молекула из порфиринов, в метанольном растворе бурно окисляется кислородом воздуха в внесением гидроксила на активный метилен. Если добавить к метанолу 50% ДМФ, то окисление полностью останавливается. Ученые умы пытаются это задним числом объяснить через изменение конформации с уходом активного метилена куда-то в неактивную позицию.
А это в темноте работает или только на свету? Возможно ДМФ тушит генерацию синглетного кислорода...
Что, Карл Маркс запрещает держать на лестнице ковры? Разве где-нибудь у Карла Маркса сказано, что 2-й подьезд калабуховского дома на Пречистенеке следует забить досками и ходить кругом через черный двор?

maks
Сообщения: 15183
Зарегистрирован: Вс апр 19, 2009 3:32 pm

Re: молекула

Сообщение maks » Сб ноя 30, 2024 8:44 pm

to Jokermaniak- сейчас под рукой нет, но, конечно Масс нужен ; там Выше указал, что дал им здание проверить без освещения, можно уточнить, что бы вообще алюминиевой бумагой закрыли
to BigM он даже коммерчески доступен
to Phobos говорят, что растворима в концентрации 10-4 M/l
он химик, он ботаник-князь Федор , мой племянник

Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6948
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Re: молекула

Сообщение Phobos » Сб ноя 30, 2024 9:54 pm

А это в темноте работает или только на свету?
С ним и так только в темноте работают, со слабо желтоватым светом. На свету там кроме окисления еще какие-то побочки происходят.
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

Аватара пользователя
Jokermaniak
Сообщения: 3825
Зарегистрирован: Чт окт 02, 2014 4:41 pm

Re: молекула

Сообщение Jokermaniak » Вс дек 01, 2024 12:37 am

Phobos писал(а):
Сб ноя 30, 2024 9:54 pm
А это в темноте работает или только на свету?
С ним и так только в темноте работают, со слабо желтоватым светом. На свету там кроме окисления еще какие-то побочки происходят.
Это именно порфирин? По повадкам больше на бактериохлорин какой-то похоже. Хотя порфирины тоже всякие бывают, конечно.
Что, Карл Маркс запрещает держать на лестнице ковры? Разве где-нибудь у Карла Маркса сказано, что 2-й подьезд калабуховского дома на Пречистенеке следует забить досками и ходить кругом через черный двор?

Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6948
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Re: молекула

Сообщение Phobos » Пн дек 02, 2024 12:24 pm

Нет, только хотел указать на общую структуру с пирроловыми кольцами :)
Но я лишь о том, что добавление постороннего растворителя к таким молекулам может иметь сильные и неожиданные эффекты.
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 18 гостей