Бесплатные (и свободные) рисовалки формул

[Marxist]

Ну почему не сосредоточить силы на написании нативной рисовалки под Линукс (это тоже крик души, я сам тот еще программист)? Ну хотя бы, на доведении до ума XDrawChem? Почему надо заморачиваться этой б...ой кросс-платформенностью? Она как глобализация, тормозит все нативное и светлое...

А вот мне кажется, что смысла в этом особого нет. Все рисовалки под *nix пишутся на том, на чём удобно автору. Кроссплатформенность здесь последнее дело, а первое -- удобство разработки. На питоне разрабатывать удобней, чем на C++ и Qt, например. Просто в итоге получается, что кроссплатформенность написать проще, чем красивую графику или хороший оптимизатор 3D -> 2D. Только почему-то хорошие оптимизаторы и в проприетарных прогах редко встречаются...

[Cherep]

Просто в итоге получается, что кроссплатформенность написать проще, чем красивую графику или хороший оптимизатор 3D -> 2D. Только почему-то хорошие оптимизаторы и в проприетарных прогах редко встречаются...

Ыыыы... Может имелось ввиду 2D -> 3D?

[Marxist]

Ыыыы... Может имелось ввиду 2D -> 3D?

Не-а, наоборот. Для 2D -> 3D у нас лицензия на конкорд есть, да и в следующей версии бабеля обещают, да и тот же пресловутый марвин худо-бедно умеет. А вот когда есть база трёхмерных структур, а её надо по-человечески посмотреть, это иногда становится проблемой.

[Cherep]

А, ну тады ой. А то я подумал было грешным делом, что конкорд, что коррина есть помои.

[Marxist]

А то я подумал было грешным делом, что конкорд, что коррина есть помои.

Ну помои -- не помои, а лучше ничего вроде и нет...

[mpx200]

ChemDraw лучше других
кстати ее рекомендуется использовать при отправке в нормальные западные журналы

[Cherep]

Она здесь оффтопик.

[amge]

Ыыыы... Может имелось ввиду 2D -> 3D?

Не-а, наоборот. Для 2D -> 3D у нас лицензия на конкорд есть, да и в следующей версии бабеля обещают, да и тот же пресловутый марвин худо-бедно умеет. А вот когда есть база трёхмерных структур, а её надо по-человечески посмотреть, это иногда становится проблемой.

Но ведь марвин и 3D->2D тоже умеет. К тому же, в комплекте к нему есть консольная прога molconvert, аналог бабеля, которой можно все сделать автоматически. А почему 2D -> 3D марвин умеет лишь худо-бедно? В нем есть несколько инструментов для этого, я всегда пользовался молекулярной механикой, получались вполне нормальные структуры. Даже поиск конформеров есть...

3D->2D с помощью molconvert

Код: Выделить всё

molconvert -2 -Y sdf 3D.sdf > 2D_without_H.sdf

То же самое можно сделать через менюшки в mview. По моему, результат выглядит отлично.

[Cherep]

Я кстати установил этот Марвин. Пока никакими лицензиями не обременял ни себя, ни их... И пока не шибко нравится чёто.

[Alex98]

Еще остался не упомянутым ChemScetch oт ACD, есть и freeware version. Так же как и Исис и Chem Draw поддерживает форматирование формул под стандарты разных журналов. И все же советую СhemDraw/ChemOffice, они хоть и платные, но ослик все принесет

[eukar]

Еще остался не упомянутым ChemScetch oт ACD, есть и freeware version.

Читайте внимательнее, упоминалась в самом начале второй страницы.

[Cherep]

http://avogadro.openmolecules.net/wiki/ ... at.27s_New

Вот интересно эту пощупать.
Боюсь, прийдётся ставить вручную...

Вобщем это нихрена не двумерная рисовалка. Чтото типа Ghemical. Но возможностей для редактирования вроде больше.
Впрочем, я пока не особо читал мануал... хрен его знает, какая философия у автора.
Поскольку начал я в своё время с OpenSuse, сегодня в ней ковырялся, разобрался с проблемой отсутсвия звука, а заодно из интернет-репозитария установил это чудо.

[Cherep]

А ведь поместить условное обозначение основания ("В") с парой электронов в BKChem удобнее чем везде ещё, где я пробовал! Там мышой двигаешь - и программулина вращает пару электронов вокруг В. О как.

[Cherep]

плин... изображать орбитальки можно только в XDrawChem? Да и то, не повернуть их, не растянуть, не раскрасить?

[Otetz]

Ух! Большое спасибо за наводку на BKChem. А то я до сего момента использовал ChemSketch под Wine. Достало, сил нет. Пусть ChemSketch программка хорошая, но не люблю вайн.
Кстати, может и не в тему, но кто- нибудь из вас смог под Linux попользоваться нормальным поиском на orgsyn.org (через апплет для ввода формул)? Было бы вообще замечательно, если бы удалось это сделать.

[Cherep]

Да, не, это не оффтоп.
Может проще оргсину написать, чтоб они что-нибудя ява-подобное завели у себя.

[N oxide]

Народ!
Скажите, как все-таки обстоят дела с платностью ISIS/Draw и ISIS/Base?
Мне тут надо на некоторые компы поставить и то и другое, но поскольку меня "наградили" ответственностью за лицезионный софт на компах, поэтому и спрашиваю. Проги хорошие и, что самое главное, нужные!!
Если можно, дайте ссылочку на соответствующее обращение изготовителя программ, типа "эта прога free"...
Премного благодарен!!

[Marxist]

http://www.mdl.com/products/framework/i ... /index.jsp, например. Дорогие и неудобные.

[Serty]

http://www.mdl.com/products/framework/i ... /index.jsp, например. Дорогие и неудобные.

Это кто как привык Я с ними работаю уже более 10 лет и мне все остальные проги кажутся неудобными. Приходится в случае необходимости рисовать в ISIS, а затем импортировать.

[Marxist]

Это кто как привык Я с ними работаю уже более 10 лет и мне все остальные проги кажутся неудобными. Приходится в случае необходимости рисовать в ISIS, а затем импортировать.

Я про Base в первую очередь. Какой-то у неё интерфейс очень неочевидный.