РСА, непонятный ДМФ

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Ответить
ahh
Сообщения: 516
Зарегистрирован: Пн дек 03, 2007 9:10 pm

РСА, непонятный ДМФ

Сообщение ahh » Чт фев 19, 2009 11:50 pm

Вопрос такой: есть РСА кристала соединения, 4 молекулы соединения, сбоку прилеплены еще 2 молекулы воды и молекула ДМФ. ДМФ прицеплен засчет водородной связи между водородом аминогруппы одной из 4 молекул соединения и кислородом ДМФ. Все бы ничего, но я немогу разобраться со структурой ДМФ. Чтото в ней не то, откуда 4 метила, 2 СН. Прилагаю рисунок со структурой ДМФ, только там еще от кислорода водородная связь идет к аминогруппе.

Может такой момент быть из-за быстрого колебания связей и наложились 2 вида ориентирования ДМФ?

ahh
Сообщения: 516
Зарегистрирован: Пн дек 03, 2007 9:10 pm

Re: РСА, непонятный ДМФ

Сообщение ahh » Сб фев 21, 2009 8:14 pm

Никто не знает, или это глупый вопрос просто?

Marxist

Re: РСА, непонятный ДМФ

Сообщение Marxist » Сб фев 21, 2009 10:47 pm

ahh писал(а):Может такой момент быть из-за быстрого колебания связей и наложились 2 вида ориентирования ДМФ?
Может быть, просто в кристалле две ориентации в соотношении 1:1?

Аватара пользователя
Himera
Сообщения: 3454
Зарегистрирован: Ср мар 05, 2003 5:38 pm
Контактная информация:

Re: РСА, непонятный ДМФ

Сообщение Himera » Вс фев 22, 2009 12:22 am

А у Вас файл со структурной информацией есть? Там для метилов и CH заселённости какие? Если 0.5 от ожидаемых (т.е. одна молекула ДМФ на формульную единицу), то это две ориентации, а уж откуда они взялись -- вопрос к тем, кто решал структуру. Могут быть две ориентации (срастаются в одном кристалле две модификации с разным расположением молекулы ДМФ), а может быть неправильно выбранная симметрия.

Аватара пользователя
IB
Сообщения: 3098
Зарегистрирован: Ср июл 25, 2007 9:12 pm

Re: РСА, непонятный ДМФ

Сообщение IB » Вс фев 22, 2009 11:22 am

ahh писал(а):Вопрос такой: есть РСА кристала соединения, 4 молекулы соединения, сбоку прилеплены еще 2 молекулы воды и молекула ДМФ. ДМФ прицеплен засчет водородной связи между водородом аминогруппы одной из 4 молекул соединения и кислородом ДМФ. Все бы ничего, но я немогу разобраться со структурой ДМФ. Чтото в ней не то, откуда 4 метила, 2 СН. Прилагаю рисунок со структурой ДМФ, только там еще от кислорода водородная связь идет к аминогруппе.

Может такой момент быть из-за быстрого колебания связей и наложились 2 вида ориентирования ДМФ?

Половина связей как раз обозначена пунктиром - т.е. Платон явно указывает на disorder (разупорядочивание). Волноваться не нужно - если других проблем нет, то всё замечательно (R-фактор, как минимум, хороший).

P.S. Разупорядочивание молекул растворителя (и не только), когда молекула может принимать два или более положения в кристалле с некоторой "заселённостью", т.е. вероятностью нахождения - это очень типичное явление, особенно для молекул растворителя. Особенно типичен случай, когда симметрия пространственной группы определяет более высокую локальную симметрию для места, где должна находиться молекула растворителя, чем её собственная симметрия. В этом случае реализуется такое разупорядочивание, которое будет удовлетворять более высокой симметрии. Если в структуре слишком много разупорядоченных областей, то это, в принципе, может указывать на неправильно найденную пространственную группу. Скорее всего, у Вас всё хорошо - подобное разупорядочивание очень характерно.

ahh
Сообщения: 516
Зарегистрирован: Пн дек 03, 2007 9:10 pm

Re: РСА, непонятный ДМФ

Сообщение ahh » Вс фев 22, 2009 9:18 pm

Спасибо, я все понял. :) Значит все хорошо

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 12 гостей