N-бензоилцистеин (рацемат),

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
klamm
Сообщения: 532
Зарегистрирован: Чт май 07, 2009 4:31 pm

N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение klamm » Пт дек 11, 2009 1:22 am

Делаю по стандартному Шоттену-Бауману общей методике для аминокислот, причем, N-бензоилцистеин там указан. Получается нечто - вероятнее всего смесь N- и S-ацилированного производного.
Ребята, может кто-то из вас делал? Чем бы SH-группу таким защитить, чтобы легко снять можно было, чтобы амид уцелел? Или может знаете какие секреты? :D

Аватара пользователя
suprachemister
Сообщения: 4884
Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение suprachemister » Пт дек 11, 2009 2:40 am

методы синтеза :arrow:
N-бензоилцистеин.pdf
N-Benzoyl-L-cystein (6)
12.1 g (0.1 mol) L-Cystein und 14.0 g (0.1 mol) Benzoylchlorid wurden in 100 ml Ether bei 20"
tropfenweise mit 10.1 g (0.1 mol) Triethylamin versetzt, Triethylammoniumchlorid abfiltriert, das
Filtrat eingeengt und mit Wasser zu einer halbfesten Masse durchgearbeitet . Aus EthanoYWasser
hellgelbe Kristalle, Schmp. 116-120.5O, Lit.'): Schmp. 105-110", Ausb. 22 % d. Th.
Немного литературы :D :arrow:
cis1.pdf
cis2.pdf
cis3.pdf
Последний раз редактировалось suprachemister Сб дек 12, 2009 3:23 pm, всего редактировалось 2 раза.

klamm
Сообщения: 532
Зарегистрирован: Чт май 07, 2009 4:31 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение klamm » Пт дек 11, 2009 8:57 am

suprachemister, очень вам благодарен! :D Буду разбираться.

Аватара пользователя
nikkochem
Сообщения: 1401
Зарегистрирован: Чт ноя 26, 2009 12:47 pm
Контактная информация:

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение nikkochem » Пт дек 11, 2009 10:54 am

Рекомендую почитать "Реакции и методы исследования органических соединений. Книга 9. М-Л. Госхимиздат, 1959" начиная с 157 страницы про оксазолы. И про синтез 2-фенилдигидротиазол-4-карбоновую кислоту и её эфиры. С цистеином не работал, работал с метионином - были проблемы с синтезом (там группа -SH защищена). Получал тиазолы, алкил-,амино- и.т.д. В том числе из аминотиолов (всмотритесь в цистеин!). Подозреваю, что у вас тиазолчик получился. Нужен анализ. Вообще я бы посоветовал обратится к Upstream - он похоже в этом специалист с ОГРОМНЫМ опытом.
Уважающие себя физики и математики обходят стороной антинаучных художников рисущих молекулы и называющих себя химиками.

gugu

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение gugu » Пт дек 11, 2009 9:44 pm

Вроде как стандартный метод там это ацилирование дисульфида, а потом восстановление боргидридом натрия. Конкретной методики под рукой к сожалению нет.

Аватара пользователя
suprachemister
Сообщения: 4884
Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение suprachemister » Пт дек 11, 2009 10:10 pm

gugu писал(а):Вроде как стандартный метод там это ацилирование дисульфида, а потом восстановление боргидридом натрия. Конкретной методики под рукой к сожалению нет.
почему же нет :issue: , вот она :arrow:

Аватара пользователя
Сергей1111
Сообщения: 184
Зарегистрирован: Вс май 24, 2009 7:41 am

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение Сергей1111 » Сб дек 12, 2009 9:22 am

Процедура Шоттен-Баумана бензоилирования цистеина также описана здесь: Monatshefte fuer Chemie; English; 131; 6; 2000; 667 - 672. У меня нет доступа к этому журналу, к сожалению, поэтому не знаю насколько там ценная статья. С уважением.

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение Upstream » Сб дек 12, 2009 12:49 pm

Скорее всего, по Ш-Б это дело описал ещё Эмиль Фишер. :wink:
Из цистина (дисульфида), конечно, можно исходить, как из защищённой формы. Только учтите, что заметно растворяется он лишь в сильно щелочной среде, в отличие от цистеина, который в воде почти как сахар растворяется. В идеале, нужно в суспензию цистина капать с одинаковой скоростью раствор карбоната натрия и раствор бензоилхлорида в ТГФ, ацетонитриле или диоксане. До конца процесс иногда довести бывает адски трудно. Восстанавливать дисульфид наиболее удобно током сероводорода.
С цистином будет образовываться смесь Bz-Cys(Bz)-OH и Bz-Cys-OH с непрореагировавшим цистеином + примесь продуктов окисления кислородом воздуха. S-изомер не существует - мгновенно перегруппировывается в N-изомер (этот процесс лежит в основе Native chemical ligation и я вляется одной из стадий спонтанного белкового сплайсинга). Нужно просто перед обработкой защелочить реакционную смесь на пару минут выше 12, и бис-аддукт развалится в целевой продукт. Предварительно необходимо избавиться от остатков бензоилхлорида - лучше всего упариванием с водой на роторе до исчезновения гнусного запаха. :wink:

Аватара пользователя
nikkochem
Сообщения: 1401
Зарегистрирован: Чт ноя 26, 2009 12:47 pm
Контактная информация:

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение nikkochem » Сб дек 12, 2009 9:37 pm

Уважаемый Upstream помедленнее пожалуйста я записываю :). Можно литературную ссылочку про перегруппировку, очень надо!
Уважающие себя физики и математики обходят стороной антинаучных художников рисущих молекулы и называющих себя химиками.

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение Upstream » Сб дек 12, 2009 11:33 pm

Прилагаю для начала мануальчик по NCL со ссылками. Если интерес не угаснет - могу выложить на файлообменник около 15 МБ статей и др. информации по этой теме, за которой я слежу в пол-глаза чисто из спортивного интереса.

klamm
Сообщения: 532
Зарегистрирован: Чт май 07, 2009 4:31 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение klamm » Вс дек 13, 2009 3:16 pm

nikkochem, благодарю вас за идеи! :up:
Образование тиазолина, чую, сомнительно. Ибо, наверное, (спасибо upstream) S-перегруппировывается в N- как раз через эту стадию с последующей атакой OH-.

klamm
Сообщения: 532
Зарегистрирован: Чт май 07, 2009 4:31 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение klamm » Вс дек 13, 2009 3:40 pm

Upstream, спасибо за ваш подробнейший обзор!
А может там образовываться бензоилированный сразу по S- и по N-, наряду с N-бензоил?
S-изомер можно получить через селеноорганику, если верить

Код: Выделить всё

http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja00806a033
Нашел про бензоилирование цистина статью, yeld 41%, после двойной перикристаллизации. И то пойдет, благо цистин есть. Попробую использовать рекомендованные вами растворители.
В настиоящий момент N-THFA-цистеин сделал. Там никаких проблем. Если трифторацетильная группа не слетит, то может и не понадобится с N-Bz возиться :very_shuffle: :D

klamm
Сообщения: 532
Зарегистрирован: Чт май 07, 2009 4:31 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение klamm » Вс дек 13, 2009 3:54 pm

Вот еще что вспомнил, лежит у меня где-то методика на N-ацетил. Его делают, ацилированием ацетонитрилом цистеина в водной среде. Правда, про бензонитрил что-то подобного не слышал.

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение Upstream » Пн дек 14, 2009 8:57 am

>А может там образовываться бензоилированный сразу по S- и по N-, наряду с N-бензоил?
Это как раз и есть Bz-Cys(Bz)-OH, который я указал в качестве одного из продуктов. Система ЮПАК для пептидных аббревиатур проста: символ с чёрточкой перед трёхбуквенным символом - группировка, сидящая на альфа-аминогруппе; в скобках указывается радикал, сидящий на боковой функции, в данном случае - сере; -ОН символизирует свободный карбоксил.
И именно превращению этого тиоэфира в целевой продукт посвящена кратковременная обработка щёлочью.

Что касается нитрилов, то они не могут никого проацилировать. Скорее всего там были ацилцианиды AcCN (а не MeCN), но это труднодоступная экзотика.

klamm
Сообщения: 532
Зарегистрирован: Чт май 07, 2009 4:31 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение klamm » Пн дек 14, 2009 8:46 pm

Upstream писал(а): Что касается нитрилов, то они не могут никого проацилировать
Если доверять патенту, то могут

Код: Выделить всё

http://www.freepatentsonline.com/4918224.html

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение Upstream » Вт дек 15, 2009 8:44 pm

Dear klamm:
Поздравляю с замечательной находкой: совершенно никому неизвестная реакция, специфичная для 1,2 и 1,3 аминотиолов! Похоже эта ветка будет первым местом в сети, где она озвучена. Очевидно, в начале нуклеофильное присоединение тиолята с последующей гидролизом иминотиоэфира и миграцией ацетила. С бензонитрилом должно тоже идти, просто такой продукт им был неинтересен. Могу подарить литр старого бензонитрила, если его есть кому забрать в столице.
За мной 10 баллов репутации! :wink: :deal:

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение Любитель_Манниха » Ср дек 16, 2009 12:02 am

:shock: :up: :up: :up: интересная реакция! Надо будет на днях попробовать гидрированный хинолин так проацилировать :roll:
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

klamm
Сообщения: 532
Зарегистрирован: Чт май 07, 2009 4:31 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение klamm » Ср дек 16, 2009 10:55 pm

Upstream, благодарю вас за профессионализм и разумное разъяснение механизма :D
То есть, с бензонитрилом есть вероятность, что получится? (все-таки он обладает меньшей электрофильностью, чем ацето)
Если честно, им давно не пользовался, поэтому наличие оного в закромах родины не проверял. Принять в дар буду рад, напишу вам в личку.

Аватара пользователя
Georgio
Сообщения: 436
Зарегистрирован: Чт фев 05, 2009 3:59 pm
Контактная информация:

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение Georgio » Ср дек 23, 2009 7:43 pm

делали так:
1. параформ с ацетамидом насухо перемешиваешь, ~3-5% серняги конц капнуть и мешать мешать, т не более 40град, как раствориться вылить в раствор Nа соли цистеина (при-5-0град), чем медленнее тем лучше. часа 2 короче. избыток ацетамидометанола ~10. вощим жалеть не надо)). потом до рн7 и фильтровать, промыть эфиром шоб быстрей сохло;) мыть водой не надо, выход будет ниже)))) выход до70%

мож где наврал, давно было, профи поправят. но ацм садится на серу четко.
Само приплывает только говно,
за жемчугом нужно нырять.

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1794
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: N-бензоилцистеин (рацемат),

Сообщение Vanya Ivanov » Пт дек 25, 2009 12:16 pm

Ацетонитрилом и бензонитрилом ацилирование аминогрупп идет довольно легко. Много этим занимался.
Амин и нитрил замешивают в растворителе (без нуклеофильных групп, но полярном. или прямо в ацетонитриле или бензонитриле) и насыщают сухим HСl при охлаждении. Использовать POCl3 или Trf-OH нужно только для жестких условий. Полученную соль имидоиламино г/х гидролизуют в кислых условиях до ацелированных аминов. Разнообразнейшее применение в химии гетероциклов описано в монографии "Бабичев. Взаимодействие амино и нитрильных групп".
Однако с тиолами нитрилы реагируют шустрей, по этому получить ацетил-цистеин вполне можно.

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 54 гостя