бокирование аргинина
- Vanya Ivanov
- Сообщения: 1790
- Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm
бокирование аргинина
Коллеги, кто нибудь сталкивался с практической методикой бокирования аргинина? Если да, то поделитесь пожалуйста.
Поставил пробник на 50 мг аминокислоты и 3,5 эквивалента бок-ангидрида, получил смесь ди- и три-бокированной аминокислоты (по LCMS и тсх). Патент POZDNEV, V. F.: SU/1155587: N, N, N-TRI-TRET-BUTILOKSIKARBONILARGININ V KACHESTVE POLUPRODUKTA DLYA SINTEZA ARGININSODERZHASHCHIX PEPTIDOV - не достал.
Мне нужно экономично приготовить 4-5 г три-бок-аргинина, что делать?
Поставил пробник на 50 мг аминокислоты и 3,5 эквивалента бок-ангидрида, получил смесь ди- и три-бокированной аминокислоты (по LCMS и тсх). Патент POZDNEV, V. F.: SU/1155587: N, N, N-TRI-TRET-BUTILOKSIKARBONILARGININ V KACHESTVE POLUPRODUKTA DLYA SINTEZA ARGININSODERZHASHCHIX PEPTIDOV - не достал.
Мне нужно экономично приготовить 4-5 г три-бок-аргинина, что делать?
- suprachemister
- Сообщения: 4884
- Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm
Re: бокирование аргинина
патент находится просто на espacenet
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
- Vanya Ivanov
- Сообщения: 1790
- Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm
Re: бокирование аргинина
Спасибо большое, сейчас сейчас посмотрим
Re: бокирование аргинина
Vanya Ivanov:
Не переводите зря Boc2O: Boc-Arg(Boc2)-OH - типичное барочное излишество! (Не в обиду Поздневу - отцу этого пирокарбоната будет сказано...)
Во-первых, это маслообразная смесь региоизомеров, один из которых валится на глазах, подробности в этой статье
Во-вторых, диуретановые производные (по гуанидиновой функции) аргинины - порочный тип защищённых производных. По неведомой мне причине они с лёгкостью ацилируются по третьему азоту (до 10% на цикл), что приводит к дегуанидилированию в орнитин после деблокирования с выбросом 5-членного цикла. Угробили в своё время массу сил на Boc-Arg(Cl-Z2)-OH. Коту под хвост. 
В-третьих, Boc-Arg-OH в присутствие HOBt надёжен на 100%, как на стадии включения в цепь, так и в дальнейшем. Осложнения возможны лишь при использовании избытка третичного амина. Просто удивительно, что сей факт остаётся малоосознанным спустя 50+ лет после обнаружения! Впрочем, чувство необходимости пользовать дорогущие арилсульфонильные производные небескорыстно поддерживают фирмы-производители. Если будете сами получать Boc-Arg-OH - берите непременно аргинин-основание, небольшой избыток пирокарбоната и никакой соды или амина! Гидрохлорид необходимо предварительно раскислить окисью серебра.
Успехов!
Не переводите зря Boc2O: Boc-Arg(Boc2)-OH - типичное барочное излишество! (Не в обиду Поздневу - отцу этого пирокарбоната будет сказано...)
Во-первых, это маслообразная смесь региоизомеров, один из которых валится на глазах, подробности в этой статье
Код: Выделить всё
http://www.rjbc.ru/arc/12/8/1013-1022.pdfВ-третьих, Boc-Arg-OH в присутствие HOBt надёжен на 100%, как на стадии включения в цепь, так и в дальнейшем. Осложнения возможны лишь при использовании избытка третичного амина. Просто удивительно, что сей факт остаётся малоосознанным спустя 50+ лет после обнаружения! Впрочем, чувство необходимости пользовать дорогущие арилсульфонильные производные небескорыстно поддерживают фирмы-производители. Если будете сами получать Boc-Arg-OH - берите непременно аргинин-основание, небольшой избыток пирокарбоната и никакой соды или амина! Гидрохлорид необходимо предварительно раскислить окисью серебра.
Успехов!
- Vanya Ivanov
- Сообщения: 1790
- Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm
Re: бокирование аргинина
спасибо за ценное замечание, Это действительно так. Однако, по Вашему совету метод выглядит совсем просто:
ИПС-вода, аргинин-основание, бок-ангидрид (1.1 эквивалент), поболтать два-три часика и экстрагнуть хлороформом. Остаток от упаривания - почти чистый бок-аргинин, пригодный для спариваия с чужой аминогруппой при помощи BOP/TBTU?
Я побеседовал в корридоре на бегу, с человеком стоявшим рядом с человеком, делавшим ди-Boc-аргинин через триметил-силильные производные. т.е. сначала все силилируется в сухом дихлорометане, а масло после упаривания обрабатывается 2 эквивалентами бок-ангидрида с триэтиламином в дихлорометане. Через час - дибок-аргинин, практически чистый. Что Вы думаете о этом подходе?
ИПС-вода, аргинин-основание, бок-ангидрид (1.1 эквивалент), поболтать два-три часика и экстрагнуть хлороформом. Остаток от упаривания - почти чистый бок-аргинин, пригодный для спариваия с чужой аминогруппой при помощи BOP/TBTU?
Я побеседовал в корридоре на бегу, с человеком стоявшим рядом с человеком, делавшим ди-Boc-аргинин через триметил-силильные производные. т.е. сначала все силилируется в сухом дихлорометане, а масло после упаривания обрабатывается 2 эквивалентами бок-ангидрида с триэтиламином в дихлорометане. Через час - дибок-аргинин, практически чистый. Что Вы думаете о этом подходе?
Re: бокирование аргинина
Мы даже не экстрагируем. Просто упариваем до начала кристаллизации. Я вообще не люблю лиших телодвижений при обработке
В осадке - чистый моно-Бок (цвиттер-ионный).
Похоже, наш печальный опыт Вас не убедил, а на него ссылается даже каталог Novabiochem (единственная работа российских авторов в их списке литературы - надо же себя похвалить
.
ЕЩЁ РАЗ. Это малоизученный по сути парадокс: уретановые защиты ПОВЫШАЮТ склонность гуанидина к ацилированию! Примерно так же как силилирование активирует амины.
Беспроблемныый вариант ТОЛЬКО Boc-Arg-OH. Boc-Arg(Boc)-OH будет легко ацилироваться по рогам с последующим образованием орнитина. Ищите заметку Rink /Sieber in TetLet, где описываются эти проблемы с Fmoc-Arg(Boc)-OH.
Похоже, наш печальный опыт Вас не убедил, а на него ссылается даже каталог Novabiochem (единственная работа российских авторов в их списке литературы - надо же себя похвалить
ЕЩЁ РАЗ. Это малоизученный по сути парадокс: уретановые защиты ПОВЫШАЮТ склонность гуанидина к ацилированию! Примерно так же как силилирование активирует амины.
Беспроблемныый вариант ТОЛЬКО Boc-Arg-OH. Boc-Arg(Boc)-OH будет легко ацилироваться по рогам с последующим образованием орнитина. Ищите заметку Rink /Sieber in TetLet, где описываются эти проблемы с Fmoc-Arg(Boc)-OH.
- Vanya Ivanov
- Сообщения: 1790
- Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm
Re: бокирование аргинина
Вы меня убедили. В общем с Ваших слов и лит источников получается довольно четкая картинка. Спасибо. Я сам люблю простые решения. Однако все же страшновато .. амины дороговаты. Но, бум делать .. бум
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 17 гостей