Структурные аналоги

[nayk]

Критерии отнесения одного вещества к структурному аналогу другого?
Есть ли литература по этому поводу или какие нибудь разработки

[anatoliy]

Вообще-то критерии зависят от решаемой задачи.
Литература... Обычно в любом журнале по органике десятки примеров.

[suprachemister]

про поиск структурных аналогов

SciFinder uses the Tanimoto algorithm to compare all substances in the database with your query structure, and then determines which are the most similar.

[Marxist]

Есть ли литература по этому поводу или какие нибудь разработки

Ищите по слову similarity. И по слову isostere. Над этим работают бешеные толпы людей.

[Upstream]

Marxist, а вот интересно: у кого-нибудь из этих легионеров есть шансы открыть структурную аналогию ТНС и анандамида? С нуля, без подсказок и наводок.

Автору темы: ещё полезные ключевые словосочетания "molecular mimicry" "<прототип> mimetic(или mimic)"

[Marxist]

Marxist, а вот интересно: у кого-нибудь из этих легионеров есть шансы открыть структурную аналогию ТНС и анандамида? С нуля, без подсказок и наводок.

Это всё-таки вручную надо делать. Вроде кто-то занимался наложением, там всяким конформационным анализом анандамида и т.д.

И потом, для схожих эффектов схожесть структуры не обязательна. Принцип поиска по подобию основан на утверждении, что у структурно близких соединений похожая активность. Обратное, разумеется, неверно. Ну и понятно, что даже при очень высоком структурном подобии активность может различаться на несколько порядков.

[Vanya Ivanov]

один из простейших методов дизайна "аналогов" - метод смены "ядра" молекулы, при этом боковые радикалы должны оставаться теми же, самыми. Это так называемый метод "scaffold hopping".

scaffolds.JPG