Смещение двойной связи

[chronos377]

Спасибо Вам большое за информацию.

[Гесс]

кстати о птичках. А чем плох просто норборнан?

[chronos377]

кстати о птичках. А чем плох просто норборнан?

А его можно прикрепить к аминокислоте двойной связью??? И выдержит ли он облучение лазером? 430 и 350нм.

[Гесс]

всмысле двойной связью? У вас же все крепежки одинарные через метилены!
Выдержит, че ему будет. Норборнадиен обратимо циклится в квадрициклан, а норборнану что? Один из прочнейших полукаркасов. Не, если конечно постараться то и его можно повалить, но при тех мощностях облучения ни о каких аминокислотах говорить будет нельзя.

[chronos377]

всмысле двойной связью? У вас же все крепежки одинарные через метилены!
Выдержит, че ему будет. Норборнадиен обратимо циклится в квадрициклан, а норборнану что? Один из прочнейших полукаркасов. Не, если конечно постараться то и его можно повалить, но при тех мощностях облучения ни о каких аминокислотах говорить будет нельзя.

Спасибо Вам большое за помощь . Сам норборнан имеет "центр" где углерод в sp3 гибридизации. Этот центр будет крепиться к аминокислоте. И будет являться осью вращения. В таком случае плоскость проведенная через точки фиксации азотистых оснований при вращении будет описывать в пространстве усеченный конус, а необходима окружность т.к. отклонение на более чем 5 ангстрем может привести к потере информации. Угол между плоскостью проведенной через точки фиксации А.О. и прямой проведенной через точку фиксации на аминокислоте к центру вышеназванной плоскости должен быть 90 градусов. Это критически важно. Возможно ли используя норборнан добиться удовлетворения данных условий?

[maks]

а почему не исходить из диена, где кетоны в позициях R2 и R3
и присоенять через цинкоорганические реагенты или Гриньяры ослабленные LiCl при -30Ц по Knochel, на первом этапе
другой вопрос , в крокодиле одно из оснований присоединено через дополнительный метилен, так и задумано или ошибка

[Гесс]

Если честно опять ни разу не понял

Сам норборнан имеет "центр" где углерод в sp3 гибридизации.

Там все атомы в этой гибридизации, вы про "мостиковый" "верхний" метиленовый?

И будет являться осью вращения.

Атом не может являться осью, ось проходит через ДВЕ точки

В таком случае плоскость проведенная через точки фиксации азотистых оснований при вращении будет описывать в пространстве усеченный конус,

четыре "нижних" атома норборнана (если вы их называете точками крепления), как и в случае вашего навороченного 222бициклооктана лежат в одной плоскости, это вытекает из его симметрии.

отклонение на более чем 5 ангстрем

это порядка трех длин связей С-С, где такое отклонение взять?

может привести к потере информации.

какой информации?

А.О.

вы б хоть упомянули что вы так азотистые основания сокращаете, а то я атомные орбитали вспоминаю каждый раз

Угол между плоскостью проведенной через точки фиксации А.О. и прямой проведенной через точку фиксации на аминокислоте к центру вышеназванной плоскости должен быть 90 градусов.

Из симметрии С2v вытекает, что если через 4 атома о которых я говорил выше провести плоскость, то ось вращения второго порядка проходящая через "верхний" атом даст с плоскостью угол 90" и точка пересечения оси и плоскости будет равноудалена от вышеназванных атомов.

Если вы еще хотите чтото крепить к "осевому" атому то я вижу два теоретических подхода:
1) диметилфульвен с производным ацетилена дают замещенный норборнадиен, который по реакции ретроДА с тетраазотистой фигней (или флешвакуумпиролизом) разваливают в дизамещенный диметилфульвен и ацетилен. Продукт вводят в реакцию со вторым дизамещенным ацетиленом. Продукт - тетразамещенный диметиленнорборнадиен. Синтез описан в литературе для тетракарбометоксильного производного и еще каких то чуд.
2) норборнадиен функционализировать по двойным связям каким то матом металлорганикой или аккуратно окислять их в эпоксиды/спирты/кетоны а потом функционализировать эти вещества.

Ни один из путей не гарантирует легкого успеха но шанс на него намного выше чем мучать нарисованный в начале трицикл.

Кстати как альтернатива диметилфульвену - спиран у которого одно из колец ЦПД. Второе циклопропан или циклопентан, оба описаны.
Ну или кеталь циклопентадиенона, но он безумнореактивен в реакции ДА и выходы там кхе-кхе (это не руки кривые, я с ним не работал, мне литературы хватило).

[chronos377]

Да. Я имел в виду мостиковый атом.
По поводу оси. Неправильно выразился. Правильнее было сказать: линия проведенная через 2 атома один из которых мостиковый углерод а другой тот к которому этот углерод крепится.
Информации о последовательности нуклеотидов в гене.
Извиняюсь за А.О. как-то забыл что этими буквами много всего обозначают.
Спасибо Вам за рекомендации.

[ChemNavigator]

азотистые основания- как в ДНК, Вы это имеете в виду?

Да. Совершенно верно.

Вот такая структура нужна. Вместо R1,2,3,4 Аденин, Тимин, Цитозин, Гуанин.

На этой картинке азотистые основания связаны с каркасом НЕ через атомы азота.

[chronos377]

Совершенно верно. Так должно быть.

[ChemNavigator]

Ну тогда если каркас будет содержать, например, атомы хлора, то Вы их так просто на азотистые основания не замените. А почему нельзя связать их через азот? И почему нельзя взять каркас на основе, например, бензола или пиразина с заместителями в 1,2,4,5-положениях?

[chronos377]

Ну тогда если каркас будет содержать, например, атомы хлора, то Вы их так просто на азотистые основания не замените. А почему нельзя связать их через азот? И почему нельзя взять каркас на основе, например, бензола или пиразина с заместителями в 1,2,4,5-положениях?

А к бензолу и пиразину по реакции Дильса - Альдера потом можно будет присоединить циклопентадиен???

[ChemNavigator]

А зачем Вам циклопентадиен? Я так понял, что Вам нужна примерно квадратная геометрия заместителей.

[chronos377]

А зачем Вам циклопентадиен?

Нужно чтобы была ось вращения каркаса.

[chronos377]

А зачем Вам циклопентадиен? Я так понял, что Вам нужна примерно квадратная геометрия заместителей.

Как я понял промежуточным продуктом синтеза пиразина является диен. Можно ли его По реакции ДА прореагировать заставить???

[ChemNavigator]

Если заместители должны лежать в одной плоскости, то берите бензол (можно взять пиразин, бензохинон и т.д.). Если заместители должны быть "приподняты" над плоскостью, то чем не подходят циклопентан или циклобутан?

А зачем Вам циклопентадиен? Я так понял, что Вам нужна примерно квадратная геометрия заместителей.

Как я понял промежуточным продуктом синтеза пиразина является диен. Можно ли его По реакции ДА прореагировать заставить???

Пиразин получают НЕ по реакции Дильса-Альдера, о каким диене Вы говорите?

[chronos377]

Я имел в виду реакцию Дильса - Альдера с циклопентадиеном уже после получения пиразина.
http://www.xumuk.ru/encyklopedia/2/3322.html здесь нарисован диен. Конденсация 2-х молекул аминокетонов.

[ChemNavigator]

Эта вещь называется дигидропиразин (хорошо, пусть будет "диен"). Как он реагирует с циклопентадиеном мне неизвестно, но Вы так и не ответили какую роль должно играть присоединяемое циклопентановое (циклопентеновое, циклопентадиеновое и т.д.) кольцо. Оно должно защищать молекулу с тыла? И всё-таки, геометрия 4-х заместителей должна быть плоской или "приподнятой" над плоскостью?

[chronos377]

Дальнейшее использование данной молекулы будет подогнано под геометрию заместителей. Главное чтобы они крепко держались на каркасе. Циклопентадиен будет выполнять роль опоры и оси вокруг которой будет происходить вращение каркаса с заместителями.

[ChemNavigator]

Какой оси? И какой опоры? Вы хотите пришить этот циклопентадиен второй оставшейся двойной связью к подложке что ли?