Термодинамика в Gaussian
Термодинамика в Gaussian
Здравствуйте!
Не могли бы Вы подсказать следующую вещь, когда в Gaussiane мы проводим рассчёт колебаний, в output файле мы имеем следующие:
Zero-point correction= 0.114740 (Hartree/Particle)
Thermal correction to Energy= 0.122069
Thermal correction to Enthalpy= 0.123013
Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.082553
Sum of electronic and zero-point Energies= -379.696579
Sum of electronic and thermal Energies= -379.689250
Sum of electronic and thermal Enthalpies= -379.688306
Sum of electronic and thermal Free Energies= -379.728766
E (Thermal) CV S
KCal/Mol Cal/Mol-Kelvin Cal/Mol-Kelvin
Total 76.600 27.867 85.156
Вопрос, что из этого свободная энергия Гиббса и энтальпия. Заранее благодарю.
Не могли бы Вы подсказать следующую вещь, когда в Gaussiane мы проводим рассчёт колебаний, в output файле мы имеем следующие:
Zero-point correction= 0.114740 (Hartree/Particle)
Thermal correction to Energy= 0.122069
Thermal correction to Enthalpy= 0.123013
Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.082553
Sum of electronic and zero-point Energies= -379.696579
Sum of electronic and thermal Energies= -379.689250
Sum of electronic and thermal Enthalpies= -379.688306
Sum of electronic and thermal Free Energies= -379.728766
E (Thermal) CV S
KCal/Mol Cal/Mol-Kelvin Cal/Mol-Kelvin
Total 76.600 27.867 85.156
Вопрос, что из этого свободная энергия Гиббса и энтальпия. Заранее благодарю.
Re: Термодинамика в Gaussian
Sum of electronic and thermal Enthalpies - энтальпия в ХартриBunev писал(а):Здравствуйте!
Не могли бы Вы подсказать следующую вещь, когда в Gaussiane мы проводим рассчёт колебаний, в output файле мы имеем следующие:
Zero-point correction= 0.114740 (Hartree/Particle)
Thermal correction to Energy= 0.122069
Thermal correction to Enthalpy= 0.123013
Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.082553
Sum of electronic and zero-point Energies= -379.696579
Sum of electronic and thermal Energies= -379.689250
Sum of electronic and thermal Enthalpies= -379.688306
Sum of electronic and thermal Free Energies= -379.728766
E (Thermal) CV S
KCal/Mol Cal/Mol-Kelvin Cal/Mol-Kelvin
Total 76.600 27.867 85.156
Вопрос, что из этого свободная энергия Гиббса и энтальпия. Заранее благодарю.
Sum of electronic and thermal Free Energies - энергия Гиббса в Хартри
Sum of electronic and thermal Energies - скорее всего внутренняя энергия
Re: Термодинамика в Gaussian
Все правильно, и лучше говорить полная энтальпия, полная внутренняя энергия и полная свободная энергия.EvgeniX писал(а):Sum of electronic and thermal Enthalpies - энтальпия в Хартри
Sum of electronic and thermal Free Energies - энергия Гиббса в Хартри
Sum of electronic and thermal Energies - скорее всего внутренняя энергия
После отстоя требуйте долива
Re: Термодинамика в Gaussian
Это понятно, что во всех случаях не учитывается внутренняя энергия ядер (которая не меняется в ходе протекания химических реакций). Т.е. все эти величины не являются абсолютными, за исключением энтропии.VTur писал(а):Все правильно, и лучше говорить полная энтальпия, полная внутренняя энергия и полная свободная энергия.
Re: Термодинамика в Gaussian
Большое спасибо, именно так я всегда и думал, НО до недавненного момента. Если эти абсолютные значения умножить на коэффициент перевода 627.51, мы получаем коласальные значения (разумеется только для неэмперики). Тут мне подсказали, да и есть ряд работ, где с помощью рассчётов определяют энергию Гиббса и энтальпию, точнее изменение. Для этих целей используют другую информацию
Thermal correction to Enthalpy= 0.100168
Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.059452
Именно это и есть значения данных параметров. Хочеться особо отметить, что эти данные хорошо коррелирует с числами, которые можно получить и при рассчёте в Gamess, НО дословный перевод наводит меня на ложность моих суждений. Так что, многоуважаемые господа, КАК БЫТЬ.
Thermal correction to Enthalpy= 0.100168
Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.059452
Именно это и есть значения данных параметров. Хочеться особо отметить, что эти данные хорошо коррелирует с числами, которые можно получить и при рассчёте в Gamess, НО дословный перевод наводит меня на ложность моих суждений. Так что, многоуважаемые господа, КАК БЫТЬ.
Re: Термодинамика в Gaussian
Код: Выделить всё
http://gaussian.com/g_whitepap/thermo.htm
Re: Термодинамика в Gaussian
Формулы, по которым считаю, могу дать. Но потребуются частоты колебаний и потенциальные функции внутреннего вращения.
После отстоя требуйте долива
Re: Термодинамика в Gaussian
Основной вклад в это колоссальное значение - это полная энергия молекулы. Но нас полные энергии вообще-то не интересуют, мы работаем с относительными величинами, изменениями.Bunev писал(а):Большое спасибо, именно так я всегда и думал, НО до недавненного момента. Если эти абсолютные значения умножить на коэффициент перевода 627.51, мы получаем коласальные значения (разумеется только для неэмперики).
И как их можно использовать? Без полной энергии - никак.Bunev писал(а):Тут мне подсказали, да и есть ряд работ, где с помощью рассчётов определяют энергию Гиббса и энтальпию, точнее изменение. Для этих целей используют другую информацию
Thermal correction to Enthalpy= 0.100168
Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.059452
Из вопроса ничего не понятно. В чём проблема?Bunev писал(а):Именно это и есть значения данных параметров. Хочеться особо отметить, что эти данные хорошо коррелирует с числами, которые можно получить и при рассчёте в Gamess, НО дословный перевод наводит меня на ложность моих суждений. Так что, многоуважаемые господа, КАК БЫТЬ.
В Gaussian-е и GAMESS-е сравниваются относительные величины, или какие-то числа в лоб?
Re: Термодинамика в Gaussian
Господа, все проще. Я произвожу оптимизацию молекулы этонала RHF/6-31G в PC GAMESS. С помощью 11 ChemBio3D Извлекаю значение свободной энергии Гибсса и оно составляет 56 ккал на моль. При аналогичном рассчёте в Gaussian используя значение Thermal correction to Gibbs Free Energy умножанное на 627,51 имею то же самое значение. Когда я считаю реакции и изменение энергии Гиббса меня вполне устравивает разница Sum of electronic and thermal Free Energies продукта и реагента. НО МОЙ ВОПРОС В СЛЕДУЮЩЕМ, МОГУ ЛИ Я СЧИТАТЬ дельта G в гауссине без учета полной энергии, если да, то каким образом. Или это можно найти как разницу энергии Sum of electronic and thermal Free Energies-SCF Done
Re: Термодинамика в Gaussian
Процедура оптимизации в GAMESS PC выдаёт термические параметры, без решения колебательной задачи?Bunev писал(а):Господа, все проще. Я произвожу оптимизацию молекулы этонала RHF/6-31G в PC GAMESS. С помощью 11 ChemBio3D Извлекаю значение свободной энергии Гибсса и оно составляет 56 ккал на моль.
И в любом случае, значение что-то уж слишком маленькое, может быть это не абсолютное значение, а значение образования из простых веществ или что-то подобное? А если без ChemBio3D 11, из выходного файла руками извлекать сколько получается?
Мало ли сколько имеется, это значение само по себе смысла не имеет. Только как поправка/вклад.Bunev писал(а):При аналогичном рассчёте в Gaussian используя значение Thermal correction to Gibbs Free Energy умножанное на 627,51 имею то же самое значение.
Ну и зря.Bunev писал(а):Когда я считаю реакции и изменение энергии Гиббса меня вполне устравивает разница Sum of electronic and thermal Free Energies продукта и реагента.
Не можете.Bunev писал(а):НО МОЙ ВОПРОС В СЛЕДУЮЩЕМ, МОГУ ЛИ Я СЧИТАТЬ дельта G в гауссине без учета полной энергии, если да, то каким образом. Или это можно найти как разницу энергии Sum of electronic and thermal Free Energies-SCF Done
Re: Термодинамика в Gaussian
Ну так поясните, как это делают люди
Re: Термодинамика в Gaussian
Допустим, есть реакцияBunev писал(а):Ну так поясните, как это делают люди
A + B -> C
ТД параметры для неё считаются очень просто:
deltaH = Htotal(C) - Htotal(A) - Htotal(B)
deltaG = Gtotal(C) - Gtotal(A) - Gtotal(B)
А ТД параметры соединений включают в себя
1) Полную энергию молекулы;
2) Энергию нулевых колебаний (ZPE);
3) Различные термические поправки к полной энергии для расчёта ТД параметров.
Gaussian сразу выдаёт что нужно (Sum ...)
И вообще,
http://gaussian.com/g_whitepap/thermo.htm
Re: Термодинамика в Gaussian
Только нужно помнить, что частоты в гармоническом приближении и внутреннее вращение берётся как гармоническое колебание.
После отстоя требуйте долива
Re: Термодинамика в Gaussian
Добрый день. У меня очень дилетантский вопрос касательно расчетов.
Что за значения 0,094005 и 0,068316 в расчете Gibbs free energy of formation во всеми любимом http://gaussian.com/g_whitepap/thermo.htm
Понятно, что здесь должна быть энтропия молекулы, но почему разность?
Что за значения 0,094005 и 0,068316 в расчете Gibbs free energy of formation во всеми любимом http://gaussian.com/g_whitepap/thermo.htm
Понятно, что здесь должна быть энтропия молекулы, но почему разность?
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 15 гостей