Расчет Ик спектров в Gaussian

[marusa66]

Полученный после расчета оптимизации chk файл не открывается, то есть при попытки его открыть вылетает ошибка! Он все же наверное должен открываться?

[o-oxhem]

Полученный после расчета оптимизации chk файл не открывается, то есть при попытки его открыть вылетает ошибка! Он все же наверное должен открываться?

Итак, забудьте про этот chk. Удалите guess=read. Приложите out file (после опт.)+новый инпут файл.

[marusa66]

Выкладываю файлы:

[o-oxhem]

Выкладываю файлы:

Я исправил. Вы забыли указать баз. набор. Интересно почему? Я 2 раза указывал Вам на это.

[marusa66]

Опять выдает ошибку

[VTur]

Что в задании геометрии или размера ячейки.

У Вас оба процессора загружены во время работы? Возможно, что только один. Под виндюком должно быть еще такое сообщение

Default is to use a total of 3 processors:
3 via shared-memory
1 via Linda

Посмотрите, заодно, размер используемой оперативки. Под виндюком он может не использовать, что ему сказали.

[o-oxhem]

Опять выдает ошибку

Вообще версия gau$$ian, которую ВЫ применяете на виндовс не выполняет парал. расчётов.
Когда BLAS/atlas выдаёт ошибку, что делать не знаю. Но подозреваю, что Вам пора определиться, сколько процесоров считает - у Вас строго 1. И не надо писать лишнего.

На g09 - расчёт идёт (начинается) ...

Ещё раз, но теперь только на одном процессоре посчитайте.
Интересно, а зачем Вам частоты для PBC?

[Droog_Andrey]

А с каких пор Гауссиан умеет считать частоты для периодических систем?

[o-oxhem]

А с каких пор Гауссиан умеет считать частоты для периодических систем?

Действительно,

Periodic Boundary Conditions (PBC)

Gaussian 03 offers PBC calculations for studying periodic systems: e.g., polymers, surfaces and crystals. PBC calculations solve the Schrцdinger equation subject to the boundary condition that the molecule and the wavefunction repeat indefinitely in one, two or three directions. Hartree-Fock and DFT energies and gradients are available for periodic systems.

Но интересно, что получится? А может это и не нужно.

[Rastamax]

o-oxhem, Пытаюсь получить колебания и их частоты в Ик-области для кристалла кремния(как думал что это простейший вариант ,а в дальнейшем перейти на усложнение модели внедрея атомы кислорода и тд с переходом на более сложные п/п на основе кремния) для сравнения с получаемыми мною экспериментальными данными! Такая вот была идейка.

вновь запустил рассчеты спустя полтора часа неизв. ошибка:

[o-oxhem]

o-oxhem, Пытаюсь получить колебания и их частоты в Ик-области для кристалла кремния(как думал что это простейший вариант ,а в дальнейшем перейти на усложнение модели внедрея атомы кислорода и тд с переходом на более сложные п/п на основе кремния) для сравнения с получаемыми мною экспериментальными данными! Такая вот была идейка.

вновь запустил рассчеты спустя полтора часа неизв. ошибка:

Только недавно удалось вспомнить, что гауссиан не считает частоты для периодических систем. Странно, что ошибка сразу не возникла. Обычно Гауссиан, где нет аналитических вторых производных, сразу пишет об этом = сообщение об ошибке, но здесь только о том, что информация о периодичности системы системы не сохраненена.

НО Вы получили первое (или не первое) упражнение по работе с кв.-хим. пакетами. Переходите на специализированные пакеты - для периодических систем, некоторые из них бесплатные.
Но они они работают на Linux. Некоторые трудно инсталлировать.