Смолы для пептидного синтеза

[Biotage]

Коллеги, доброго дня!

Нужно приобрести грамм по 25 Ринк и Тритилхлоридной смолы. Кто может подсказать где это проще, дешевле и быстрее всего сделать в Москве?
Особенно интересует качество тритильной смолы, у каких фирм ее лучше заказывать?

С уважением, Владимир

[Georgio]

Мы доставали китайскую. Вполне приличная. Но 25г..., берите кило)

[EKol]

А какой фирмы? В 2005-м Applied biosystems заказывала смолы у китайцев, Rink ещё ничего, а с присоединенными Fmoc-аминокислотами - полное г... Сейчас работаем на Tentagel - дорого, но пептиды получаются просто отлично. Дороговизна окупается хорошим выходом.

[Cherep]

<offtopic>
Во Fmoc-ах и без полимера полно косяков (это признавали даже Atherton и Sheppard)
</offtopic>
А у кого Tentagel берёте?

[Georgio]

А какой фирмы? В 2005-м Applied biosystems заказывала смолы у китайцев, Rink ещё ничего, а с присоединенными Fmoc-аминокислотами - полное г... Сейчас работаем на Tentagel - дорого, но пептиды получаются просто отлично. Дороговизна окупается хорошим выходом.

noname. Мастер Мадеинчин.

[EKol]

А у кого Tentagel берёте?

Заказывали через наш отдел снабжения, указывали Iris Biotech. Кто конкретно поставлял - не знаю, закупали через тендер.
Fmoc-и проверяли ВЭЖХ, и от Applied Biosystems, и от ChemPep, и от Reanal, и от Bachem, примерно все одинаковые - 97-98% чистоты. Судя по ЯМР пептидов, с оптической чистотой тоже всё норм.

[Cherep]

примерно все одинаковые - 97-98% чистоты. Судя по ЯМР пептидов, с оптической чистотой тоже всё норм.

смотря что за примесь эти 2-3 %. Если там Fmoc подснялся, то стопудово в пептиде будут продукты удвоения. И не факт, что они отделятся от основного пикав каких-то стандартных условиях.

upd: что же касается подтверждения оптической читоты методами ЯМР, то это опятьже в общем случае должны быть не просто пептиды, а их особые производные, как показал N. Leo Benoiton

ПМСМ, единственное приемущество Fmoc химии -- отсутсвие необходимости использовать безводный фторид водорода.

[EKol]

смотря что за примесь эти 2-3 %. Если там Fmoc подснялся, то стопудово в пептиде будут продукты удвоения. И не факт, что они отделятся от основного пикав каких-то стандартных условиях.

Нет, скорее какие-то другие примеси. На обращенке идут после основного пика. Могли бы быть Fmoc-дипептиды, но удвоений в ходе синтеза не наблюдаем, кроме случаев, когда пролин плохо присоединяется, приходится повторы делать. Но грязь во Fmoc-Pro тут ни при чем.
А что значит "стандартные условия"? Один-единственный раз было, что не смогли разделить 20-с-чем-то-членный пептид и побочный продукт с пропуском Asn. Целевой пептид и продукт с удвоенным Pro разделить удалось, правда, с потерями.

ПМСМ, единственное приемущество Fmoc химии -- отсутсвие необходимости использовать безводный фторид водорода.

А также возможность синтеза достаточно длинных пептидов с последовательностями Asn-Pro, Asp-Pro, практически отсутствие превращения Glu и особенно Gln в пироглутамат в ходе синтеза (в ходе Вос-синтеза до 50% Gln со свободным N-концом может перейти в пироглутамат, на чём синтез и закончится).

[Cherep]

Да Gln на N-конце -- он и в природе не жилец.

Glu(OCy) в пироглютамат превращается крайне медленно.
Asn-Pro, Asp-Pro можно и дипептидами сажать в крайнем случае. А не в крайнем как такую проблему решать написано в Стьюарте и Янге.

Пролин -- вторичный амин, чегоб ему Fmoc не валить? Это на модельных реакция M Bodanszky ещё в 1979 г показал

То, что Asp во Fmoc-ах вызывает гемморой, косвенно подтверждается тем, сколько защитных групп придумали для боковой цепи

По побочным реакциям книга уже написана, такшито копья ломать считаю лишним.

И таки да, если у вас там еще и микроволновое облучение и с ним всё зашибись, то я пойду покурю немного. А так эпический срач про микроволновки уже был на форуме.

"стандартные условия" -- отсыл к тому, что субъективно часто люди использует некий стандартный градиент или набор стандартных для ВЭЖХ анализа. А может и не используют. Но иногда побочные продукты надо ещё уметь найти