gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Привет всем. Я в химии недавно и мало что в ней понимаю. Мне надо рассчитать молекулу с 100 атомами.
Но вот беда мне гаусиан подозрительно вываливает в процессе расчёта Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Я сидел 2 или 3 дня, ждал пока он сосчитает, но бесполезно. Не дождался я. Подскажите мне надо ещё подождать или это ошибка?
******************************************
Gaussian 09: IA32W-G09RevD.01 24-Apr-2013
12-Sep-2018
******************************************
%chk=C:\GausianMyLab\PAN_swazi_wto\Opt.chk
----------------------------------------
# opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity
----------------------------------------
1/14=-1,18=20,19=15,26=3,38=1,57=2/1,3;
2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=101,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,18=20,19=15,26=3/3(2);
2/9=110/2;
99//99;
2/9=110/2;
3/5=1,6=6,7=101,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3;
4/5=5,16=3,69=1/1;
5/5=2,38=5/2;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,18=20,19=15,26=3/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
-------------------
Title Card Required
-------------------
Symbolic Z-matrix:
...
Trust Radius=3.00D-01 FncErr=1.00D-07 GrdErr=1.00D-06
Number of steps in this run= 420 maximum allowed number of steps= 420.
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
...
Stoichiometry C46H10N14(15+,4)
Framework group CS[SG(C46H10N14)]
Deg. of freedom 137
Full point group CS NOp 2
Largest Abelian subgroup CS NOp 2
Largest concise Abelian subgroup C1 NOp 1
Standard orientation:
...
Standard basis: 6-31G(d,p) (6D, 7F)
There are 700 symmetry adapted cartesian basis functions of A' symmetry.
There are 250 symmetry adapted cartesian basis functions of A" symmetry.
There are 700 symmetry adapted basis functions of A' symmetry.
There are 250 symmetry adapted basis functions of A" symmetry.
950 basis functions, 1750 primitive gaussians, 950 cartesian basis functions
186 alpha electrons 183 beta electrons
nuclear repulsion energy 7524.4885069210 Hartrees.
NAtoms= 70 NActive= 70 NUniq= 70 SFac= 1.00D+00 NAtFMM= 60 NAOKFM=T Big=T
Integral buffers will be 262144 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis= 950 RedAO= T EigKep= 9.72D-05 NBF= 700 250
NBsUse= 950 1.00D-06 EigRej= -1.00D+00 NBFU= 700 250
ExpMin= 1.61D-01 ExpMax= 4.17D+03 ExpMxC= 6.27D+02 IAcc=1 IRadAn= 1 AccDes= 0.00D+00
Harris functional with IExCor= 402 and IRadAn= 1 diagonalized for initial guess.
HarFok: IExCor= 402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn= 1 IDoV= 1 UseB2=F ITyADJ=14
ICtDFT= 3500011 ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000
FoFCou: FMM=F IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 2001
NFxFlg= 0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
wScrn= 0.000000 ICntrl= 500 IOpCl= 0 I1Cent= 200000004 NGrid= 0
NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0
Petite list used in FoFCou.
Initial guess orbital symmetries:
Alpha Orbitals:
...
'Сам расчёт :
The electronic state of the initial guess is 4-A".
Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 1.5000 <S**2>= 3.7500 S= 1.5000
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
EnCoef did 2 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 2 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
EnCoef did 9 forward-backward iterations
EnCoef did 11 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
EnCoef did 4 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
Restarting incremental Fock formation.
Initial convergence to 1.0D-05 achieved. Increase integral accuracy.
Также пробовал другим методом:
******************************************
Gaussian 09: IA32W-G09RevD.01 24-Apr-2013
11-Sep-2018
******************************************
%chk=C:\GausianMyLab\PAN_swazi_wto\3.chk
------------------------------------
# b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity
------------------------------------
1/38=1,57=2/1;
2/12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=101,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
99/5=1,9=1/99;
-------------------
Title Card Required
-------------------
Symbolic Z-matrix:
...
The electronic state of the initial guess is 4-A".
Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 1.5000 <S**2>= 3.7500 S= 1.5000
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
EnCoef did 2 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 2 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
EnCoef did 9 forward-backward iterations
EnCoef did 11 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
EnCoef did 4 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
ПОДСКАЖИТЕ НУБУ пожалуйста!
Но вот беда мне гаусиан подозрительно вываливает в процессе расчёта Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Я сидел 2 или 3 дня, ждал пока он сосчитает, но бесполезно. Не дождался я. Подскажите мне надо ещё подождать или это ошибка?
******************************************
Gaussian 09: IA32W-G09RevD.01 24-Apr-2013
12-Sep-2018
******************************************
%chk=C:\GausianMyLab\PAN_swazi_wto\Opt.chk
----------------------------------------
# opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity
----------------------------------------
1/14=-1,18=20,19=15,26=3,38=1,57=2/1,3;
2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=101,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,18=20,19=15,26=3/3(2);
2/9=110/2;
99//99;
2/9=110/2;
3/5=1,6=6,7=101,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3;
4/5=5,16=3,69=1/1;
5/5=2,38=5/2;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,18=20,19=15,26=3/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
-------------------
Title Card Required
-------------------
Symbolic Z-matrix:
...
Trust Radius=3.00D-01 FncErr=1.00D-07 GrdErr=1.00D-06
Number of steps in this run= 420 maximum allowed number of steps= 420.
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
...
Stoichiometry C46H10N14(15+,4)
Framework group CS[SG(C46H10N14)]
Deg. of freedom 137
Full point group CS NOp 2
Largest Abelian subgroup CS NOp 2
Largest concise Abelian subgroup C1 NOp 1
Standard orientation:
...
Standard basis: 6-31G(d,p) (6D, 7F)
There are 700 symmetry adapted cartesian basis functions of A' symmetry.
There are 250 symmetry adapted cartesian basis functions of A" symmetry.
There are 700 symmetry adapted basis functions of A' symmetry.
There are 250 symmetry adapted basis functions of A" symmetry.
950 basis functions, 1750 primitive gaussians, 950 cartesian basis functions
186 alpha electrons 183 beta electrons
nuclear repulsion energy 7524.4885069210 Hartrees.
NAtoms= 70 NActive= 70 NUniq= 70 SFac= 1.00D+00 NAtFMM= 60 NAOKFM=T Big=T
Integral buffers will be 262144 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis= 950 RedAO= T EigKep= 9.72D-05 NBF= 700 250
NBsUse= 950 1.00D-06 EigRej= -1.00D+00 NBFU= 700 250
ExpMin= 1.61D-01 ExpMax= 4.17D+03 ExpMxC= 6.27D+02 IAcc=1 IRadAn= 1 AccDes= 0.00D+00
Harris functional with IExCor= 402 and IRadAn= 1 diagonalized for initial guess.
HarFok: IExCor= 402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn= 1 IDoV= 1 UseB2=F ITyADJ=14
ICtDFT= 3500011 ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000
FoFCou: FMM=F IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 2001
NFxFlg= 0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
wScrn= 0.000000 ICntrl= 500 IOpCl= 0 I1Cent= 200000004 NGrid= 0
NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0
Petite list used in FoFCou.
Initial guess orbital symmetries:
Alpha Orbitals:
...
'Сам расчёт :
The electronic state of the initial guess is 4-A".
Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 1.5000 <S**2>= 3.7500 S= 1.5000
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
EnCoef did 2 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 2 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
EnCoef did 9 forward-backward iterations
EnCoef did 11 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
EnCoef did 4 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
Restarting incremental Fock formation.
Initial convergence to 1.0D-05 achieved. Increase integral accuracy.
Также пробовал другим методом:
******************************************
Gaussian 09: IA32W-G09RevD.01 24-Apr-2013
11-Sep-2018
******************************************
%chk=C:\GausianMyLab\PAN_swazi_wto\3.chk
------------------------------------
# b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity
------------------------------------
1/38=1,57=2/1;
2/12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=101,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
99/5=1,9=1/99;
-------------------
Title Card Required
-------------------
Symbolic Z-matrix:
...
The electronic state of the initial guess is 4-A".
Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 1.5000 <S**2>= 3.7500 S= 1.5000
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
EnCoef did 2 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 2 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
EnCoef did 9 forward-backward iterations
EnCoef did 11 forward-backward iterations
EnCoef did 6 forward-backward iterations
EnCoef did 4 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
EnCoef did 100 forward-backward iterations
ПОДСКАЖИТЕ НУБУ пожалуйста!
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Недостаточно данных для анализа.
По всей видимости проблема на первом SCF шаге. Так?
На каких ресурсах (число ядер и оператива) это считается? (Исходя из адреса чекпоинта это виндовый гауссиан то есть скорее всего наперсоналке то есть скорее всего до 4 ядер).
Какие у системы заряд и мультиплетность? действительно 15+,4 для молекулы C46H10N14 ? Это катастрофически плохая постановка задачи, я затрудняюсь представить себе такой поликатион. Чем бы оно ни было с такими зарядами и мультиплетностью его считать нельзя. <S**2>= 3.75 тоже настораживает.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iteration - это как бы не ошибка само по себе, оно понизило себе точность расчета интегралов потому что ему плохо. С таким зарядом мне тоже плохо было бы, и мы еще геометрии не видели.
Вообщем я неготов сказать что происходит с вашим расчетом и почему оно долго, но думаю вылечить его "волшебным словом" не получится, вероятно надо смотреть на систему.
По всей видимости проблема на первом SCF шаге. Так?
На каких ресурсах (число ядер и оператива) это считается? (Исходя из адреса чекпоинта это виндовый гауссиан то есть скорее всего наперсоналке то есть скорее всего до 4 ядер).
Какие у системы заряд и мультиплетность? действительно 15+,4 для молекулы C46H10N14 ? Это катастрофически плохая постановка задачи, я затрудняюсь представить себе такой поликатион. Чем бы оно ни было с такими зарядами и мультиплетностью его считать нельзя. <S**2>= 3.75 тоже настораживает.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iteration - это как бы не ошибка само по себе, оно понизило себе точность расчета интегралов потому что ему плохо. С таким зарядом мне тоже плохо было бы, и мы еще геометрии не видели.
Вообщем я неготов сказать что происходит с вашим расчетом и почему оно долго, но думаю вылечить его "волшебным словом" не получится, вероятно надо смотреть на систему.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Похоже тут я ещё не могу прикладывать файлы.
Файлы выложил в облако: https://cloud.mail.ru/public/8sUq/kcjWQJNMJ
Предпочтительнее конечно для оптимизации структура 2aroma5 т.к. я предполагаю наличие ароматических колец в структуре, а не двойных связей.
Спасибо за Ваш ответ! Я ровным счётом ничего не понял из него). Буду гуглить, познавать Ваши слова по предложениям.
Файлы выложил в облако: https://cloud.mail.ru/public/8sUq/kcjWQJNMJ
Предпочтительнее конечно для оптимизации структура 2aroma5 т.к. я предполагаю наличие ароматических колец в структуре, а не двойных связей.
Спасибо за Ваш ответ! Я ровным счётом ничего не понял из него). Буду гуглить, познавать Ваши слова по предложениям.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Считаю на домашнем ноуте т.к. выбить что-то в универе нереально.
4 ядра, 8 потоков i7 2.2 МГц, оператива сгорела одна, поэтому всего 4ГБ. А что надо больше? Могу купить комп с 8 ядрами...
Какие у системы заряд и мультиплетность? - вот вообще не понимаю что вы написали, загуглю и скажу. Скажу так. Я посторил молекулу от руки, затем нажал кнопочку Clean и готово. Как бы в лабах, в интернете всё так делается. Вообще заряд должен быть нейтральным т.к. это просто молекула для оптимизации на самом начальном этапе, уже потом я вырву из неё 3 атома и молекула преобретёт заряд 3-, далее в молекулу будут интегрироваться металлические молекулы.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iteration - это как бы не ошибка само по себе, оно понизило себе точность расчета интегралов потому что ему плохо. С таким зарядом мне тоже плохо было бы, и мы еще геометрии не видели. -
Я не могу вставить картинку к сожалению. В облаке есть файл в нём всё. См 5aroma2.gif .
4 ядра, 8 потоков i7 2.2 МГц, оператива сгорела одна, поэтому всего 4ГБ. А что надо больше? Могу купить комп с 8 ядрами...
Какие у системы заряд и мультиплетность? - вот вообще не понимаю что вы написали, загуглю и скажу. Скажу так. Я посторил молекулу от руки, затем нажал кнопочку Clean и готово. Как бы в лабах, в интернете всё так делается. Вообще заряд должен быть нейтральным т.к. это просто молекула для оптимизации на самом начальном этапе, уже потом я вырву из неё 3 атома и молекула преобретёт заряд 3-, далее в молекулу будут интегрироваться металлические молекулы.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iteration - это как бы не ошибка само по себе, оно понизило себе точность расчета интегралов потому что ему плохо. С таким зарядом мне тоже плохо было бы, и мы еще геометрии не видели. -
Я не могу вставить картинку к сожалению. В облаке есть файл в нём всё. См 5aroma2.gif .
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Можете, но не в формате gjf, меняйте им расщирение, или архивируйте или выкладывайте на внещних ресурсах.
Это плохо. Начинайте разбираться что вы собственно делаете.
Геометрия там на самом деле приличнее чем я думал, нормальная чешуйка графена сильнодопированная азотом по границе. Я бы брал симметричную, это сделает расчет несколько дешевле. Мне не нравится что несколько азотов на боковых границах вы протонируете, в то время как азоты на длинных границах у вас "пиридиновые". "Вы либо крестик снимите либо штаны наденьте".
В ДФТ нет понятия "связь", поэтому расчет не в курсе о том что такое ароматические кольца и двойные связи (ну точнее вы об этом уведомляете в connectivity блоке, но эта информация нигде не используется и вообще сам блок лишний).
Это зависит от дальнейших планов, денег которые вы готовы потратить на хобби и позиции универа. Решить конкретную задачу такого размера на 8-ядернике пожалуй можно, а с учетом того что взят довольно скромный базис 6-31g(d,p) то и за разумное время. Однако если вы этим намеряны заниматься в будущем - то кроме освоения что вы собственно посылаете на расчет желательно еще получить доступ на какой нибудь хоть захудалый кластер (и заодно освоить линукс в минимальной степени). Ибо домашней персоналкой сыт не будешь, это скорее хобби чем работа.
При допировании наночешуек атомами металла я очень не рекомендую делать расчет упомянутого полианиона. Особенно если вы в нем еще надырявите дефектов. Впрочем для более обстоятельного ответа всеравно надо знать задачу, в частности зачем вообще столь интенсивное допирование азотом.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Чешуйка графена сильнодопированная азотом по границе - это пиролизованный ПАН. И он не допированный, Азот остался после реакции.
Какая настройка в gaussian отвечает за заряд и мультиплетность системы? Я что-то найти не могу(.
Какая настройка в gaussian отвечает за заряд и мультиплетность системы? Я что-то найти не могу(.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
строка в инпуте перед началом координат. В случае одного из инпутов у вас это 15 4
Если вы свои инпуты через гаусвьювер делаете то там 2 отдельных подписанных поля.
Что такое ПАН? ПАУ - PAH - Polycyclic Aromatic Hydrocarbons знаю и люблю (если руками не трогать ), а для буквы Н я расшифровки подобрать не могу.
Если вы свои инпуты через гаусвьювер делаете то там 2 отдельных подписанных поля.
Что такое ПАН? ПАУ - PAH - Polycyclic Aromatic Hydrocarbons знаю и люблю (если руками не трогать ), а для буквы Н я расшифровки подобрать не могу.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
пиролизованный полиакрилонитрил это, вот.
Вообще мне примерно такое надо: https://ti.jvolsu.com/index.php/ru/comp ... wnload/477
Но я решил с однослойного начать.
Вообще мне примерно такое надо: https://ti.jvolsu.com/index.php/ru/comp ... wnload/477
Но я решил с однослойного начать.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Я инструкцию для стартовых параметров гаусиана ещё не дочитал). Я думал это повысит точность вычислений... Точно. Первая настройка- заряд, это где-то я читал. А вот со второй я пока не разобрался.... Заряд конечно же нуль пока что.
- Droog_Andrey
- Сообщения: 2670
- Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
- Контактная информация:
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
По ссылке тихий ужас.BIG_DATE писал(а): ↑Сб сен 15, 2018 1:21 pmВообще мне примерно такое надо: https://ti.jvolsu.com/index.php/ru/comp ... wnload/477
Положительные заряды, видимо, появились автоматически в рисовалке при замене некоторых углеродов азотами.
Чтобы точность интегралов не снижалась на первых итерациях, можно написать SCF(NoVarInt).
2^74207281-1 is prime!
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Не, ну тема конечно существует, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articl ... -02407.pdf, http://advances.sciencemag.org/content/4/6/eaat1687 но даже называя результат графенизированным народ предусмотрительно не рисует такие чешуйки, на мой взгляд там с пиролиза должна выходить жуткодефектная структура в которой "слои" будут просматриваться не без труда. Впрочем тут я могу быть неправ. К тому же вы всеравно будете делать чешуйки ибо начальство сказало ))).BIG_DATE писал(а): ↑Сб сен 15, 2018 1:21 pmпиролизованный полиакрилонитрил это, вот.
Вообще мне примерно такое надо: https://ti.jvolsu.com/index.php/ru/comp ... wnload/477
Но я решил с однослойного начать.
Раз речь идет о таких системах я бы рекомендовал уходить от молекулярных систем в периодическое ДФТ, соответственно уходить из гауссиана в софт твердотельщиков - VASP, Wien2K, Crystal, QuantumEspresso и т.д., можете выбрать из https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_q ... s_software
Это же поможет и когда вы начнете запихивать на систему металлические кластеры. На B3LYP в гауссиане на дефектных чешуйках с металлокластерами я прогнозирую много мучительных проблем. Не то чтобы периодика от них гарантированно спасет, но вряд ли станет хуже. Как минимум B3LYP на металлокластеры+проводящая органика не рекомендую. PBE будет и дешевле и стабильнее.
Это легче сделать на старте а не в средине проекта все заново переделывать.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Попробуйте эту геометрию в качестве начальной. Это минимум по мнению одной программы в базисе 6-31g.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
К тому же вы всеравно будете делать чешуйки ибо начальство сказало ))). - дело в том, что не первый кто этим занимается. И тут теория больше подгоняется под практические эксперименты. И там всё именно так и получается. Насчёт "жуткодефектная структура в которой "слои" будут просматриваться не без труда" - не знаю. Видел где-то фото под электронным микроскопом- всё нормально, почти плоско всё.
По ссылке тьма программ. Чтобы всё перепробывать уйдёт много времени. Подскажите пожалуйста 2-3 нормальные)
По ссылке тьма программ. Чтобы всё перепробывать уйдёт много времени. Подскажите пожалуйста 2-3 нормальные)
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Это легче сделать на старте а не в средине проекта все заново переделывать. - это, это перейти на другой софт?
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Я пользуюсь VASP, на форуме есть люди практикующие QuantumEspresso, вцелом у всего есть свои пользователи. Почти все под линукс, виндовых незнаю, часть платная, часть из них доступна там же где народ берет гауссиан.
да, и на другой функционал
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Эх. Ошибка 2070. Буду гуглить.... Не понимаю почем ошибки то. Вроде же атомы расположил и запустил расчёт. Но нет. Ничего не считается...
Последний раз редактировалось BIG_DATE Вт ноя 27, 2018 5:56 pm, всего редактировалось 1 раз.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
даже незнаю с чего начать
1) l906 - редкая ошибка, связанная с нехваткой оперативы, крайне редко возникает в дфт, но
2) на зачем внезапно использовать MP2? (оно потребляет намного больше оперативы)
3) даже если вы сможете придумать обоснование для использования MP2 то MP2/sto-3g имеет ну ооочень мало смысла - это использование достаточно навороченного метода с настолько отстойным базисом что результат весьма ниочем.
Инициатива это конечно прекрасно, но думаю было бы лучше если бы вы спросили у кого точто КАК имеет смысл считать, а потом читали бы что обозначают кейворды которые вы суете в расчет...
1) l906 - редкая ошибка, связанная с нехваткой оперативы, крайне редко возникает в дфт, но
2) на зачем внезапно использовать MP2? (оно потребляет намного больше оперативы)
3) даже если вы сможете придумать обоснование для использования MP2 то MP2/sto-3g имеет ну ооочень мало смысла - это использование достаточно навороченного метода с настолько отстойным базисом что результат весьма ниочем.
Инициатива это конечно прекрасно, но думаю было бы лучше если бы вы спросили у кого то
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Гауссиан и вправду довольно плох для этой задачи. Да что там -- почти для любых задач он не лучший выбор.
Для молекулярных случаев я пользуюсь NWChem (бесплатно, функционально) и TeraChem (невероятно быстро, но функциональность оставляет желать лучшего, к тому же платно), а если периодические системы, то CP2K, значимых конкурентов ему не обнаружил, хотя искал тщательно. Ну разве что VASP, но он очень странный.
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Спасибо за ответы. В гаусиане построил молекулу в половину от требуемой, она хотя бы считается без ошибки теперь её. Но правда энергия у неё -1500). Буду переходить на другие системы. Я так чувствую всё под линухой....
Re: gaussian. Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 24 гостя