Нормальная ли это очередь на расчёт?

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
madschumacher
Сообщения: 892
Зарегистрирован: Ср авг 05, 2015 4:30 pm

Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение madschumacher » Ср ноя 16, 2016 9:36 pm

Добрый день Всем!

2 недели назад я поставил в очередь на Суперкомпьютере Ломоносове относительно небольшой расчёт (на 16 нодах). Так вот, он до сих пор не начался и стоит где-то в жопе очереди.
Хочу задать маленький вопрос: Это нормально?! :evil:
И да узрел Охламон, что сие есть круть несусветная!

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение Shorku » Чт ноя 17, 2016 10:48 am

В целом бывает, да. На Ломоносове скорость продвижения в очереди очень зависит еще от ресурсов, ну т.е. задача на пару нод и пять часов пойдет в счет гораздо быстрее, чем 16 нод и трое суток. Поэтому ресурсы надо максимально аккуратно прикидывать =)
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение amge » Чт ноя 17, 2016 11:09 am

+1

Еще, не знаю как на Ломоносове, но на кластере, на котором я считаю, есть различные очереди (qstat -Q). И часто бывает, задача долго висит в умолчаемой очереди, но сразу запускается в какой-нибудь другой. Зная особенности очередей, можно сильно ускорять свою работу.

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение uchebnik fiziki » Чт ноя 17, 2016 10:12 pm

Размер расчёта определяется не количеством нод, а максимальным временем. Без указания максимального времени слёрм запускает всё в порядке общей очереди, а с максимальным временем минут 50 на 48 нод встаёт сразу.
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Аватара пользователя
VIPer
Сообщения: 387
Зарегистрирован: Вт фев 13, 2007 10:17 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение VIPer » Сб ноя 19, 2016 12:24 pm

а что это максимальное время означает? что по его прошествии задача оборвётся, даже если расчёт ещё не закончен?

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение Shorku » Сб ноя 19, 2016 2:10 pm

Да
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
VIPer
Сообщения: 387
Зарегистрирован: Вт фев 13, 2007 10:17 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение VIPer » Сб ноя 19, 2016 3:23 pm

а какой же тогда смысл ставить расчёт с малым максимальным временем при этом? ну, начнёт он выполняться в очереди раньше, а если он достаточно продолжительный?

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение uchebnik fiziki » Сб ноя 19, 2016 3:57 pm

зависит от ситуации: есть расчёты, которые при параллельном выполнении вполне быстры
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение Гесс » Сб ноя 19, 2016 4:29 pm

VIPer писал(а):а какой же тогда смысл ставить расчёт с малым максимальным временем при этом? ну, начнёт он выполняться в очереди раньше, а если он достаточно продолжительный?
Если знаешь сколько расчет будет длиться - то все просто.
Ну и иногда иммет смысл рестартануть оптимизацию чем выжидать очередь, но это уже почти читерство.
На некоторых серверах до получаса есть очередь devel (op). В некоторых случаях этого достаточно.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение Shorku » Сб ноя 19, 2016 8:36 pm

Гесс писал(а): Если знаешь сколько расчет будет длиться - то все просто.
Ну и иногда иммет смысл рестартануть оптимизацию чем выжидать очередь, но это уже почти читерство.
На некоторых серверах до получаса есть очередь devel (op). В некоторых случаях этого достаточно.
На Ломоносове есть test на 15 минут, однако половину этого времени может протупить сам суперкомпьютер.

Вообще никто же не мешает посмотреть на очереди (их там на cpu четыре штуки) и выбрать самую свободную :mrgreen:
VIPer писал(а):а какой же тогда смысл ставить расчёт с малым максимальным временем при этом? ну, начнёт он выполняться в очереди раньше, а если он достаточно продолжительный?
Ну так надо не с малым, а с достаточным
Make quantum chemistry, not war

Аватара пользователя
madschumacher
Сообщения: 892
Зарегистрирован: Ср авг 05, 2015 4:30 pm

Re: Нормальная ли это очередь на расчёт?

Сообщение madschumacher » Пн ноя 21, 2016 12:33 pm

Shorku писал(а): Вообще никто же не мешает посмотреть на очереди (их там на cpu четыре штуки) и выбрать самую свободную :mrgreen:
На cpu сейчас в действии только /regular[4,6]/... И обе были сейчас сильно загружены (термохимики и биомодельщики ставят по 3 задачи на over 100 нод каждая + максимальный таймлимит, ну и физики тоже)... :evil:
И да узрел Охламон, что сие есть круть несусветная!

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 6 гостей