Расчет энергии водородной связи в Gaussian

обсуждение вопросов физической химии и химической физики
physical chemistry and chemical physics: discussions for professionals
Ответить
BaHb_XeJIbCuHr
Сообщения: 17
Зарегистрирован: Вт сен 05, 2023 11:48 pm

Расчет энергии водородной связи в Gaussian

Сообщение BaHb_XeJIbCuHr » Сб фев 07, 2026 12:14 pm

Доброго времени суток. Необходимо с помощью Gaussian расчитать энергию водородной связи в димере, образованном из тимола и 1,8-цинеола. У кого был опыт таких расчетов в этой проге прошу поделиться. Пробовал сначала построить обе молекулы в HyperChem, сблизить акцепторный и донорный фрагменты на эффективное расстояние, после чего оптимизировать геометрию в MM+ и сохранить файл в формате, который умеет распознавать Gaussian, а именно .mol. Дальше в самом Gaussian разделял атомные группы и проводил расчет по ряду методик, но значения выходили большие, от 1800 до 2200 кДж/моль.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

spa
Сообщения: 7
Зарегистрирован: Чт дек 27, 2018 6:34 am

Re: Расчет энергии водородной связи в Gaussian

Сообщение spa » Вс мар 08, 2026 6:06 am

Проведите оптимизацию геометрии отдельно молекулы тимола, затем отдельно молекулы 1,8-цинеола, затем проведите оптимизацию геометрии рядом расположенных молекул при этом они как-то могут сблизиться и не обязательно нужным вам образом. Вычтите из энергии комплекса сумму энергий исходных молекул. Получите что-то похожее на энергию водородной связи.

Ответить

Вернуться в «физическая химия / physical chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 21 гость