Здравствуйте! Помогите разобраться с EXCITATIONS & DEEXCITATIONS SAP COEFFICENTами. В результате расчета методом TDDFT получены энергии состояний, их сила осциллятора, а также молекулярные орбитали, переходы между которыми образуют данное состояние! Ниже приведен кусок выходного файла с SAP коэффициентами. Объясните, кто знает, что эти коэффициенты означают, какой они имеют смысл? Почему допустим переход с 73МО на 74МО имеет положительный коэффициет, а с 74 на 73 отрицательный, а в случае 72 на 76 и 76 на 72 они отрицательные. И еще один вопрос: где во выходном файле смотреть природу МО (π-тип, σ-тип, n-тип) и как определить ее тип? Заранее спасибо!
EXCITATIONS & DEEXCITATIONS SAP COEFFICENT
FROM MO TO MO
----------------------------------------------
72 74 0.15953586
74 72 0.03530189
72 76 -0.06472653
76 72 -0.01125458
73 74 0.98951542
74 73 -0.13150815
----------------------------------------------
EXCITATIONS & DEEXCITATIONS SAP COEFFICENT
Re: EXCITATIONS & DEEXCITATIONS SAP COEFFICENT
Возьмите статью Dreuw, A.; Head-Gordon, M. Chem. Rev. 2005, 105, 4009, там объясняется, откуда эти коэффициенты. DEEXCITATIONS показывают, насколько велика роль двукратных возбуждений в данном переходе. Напрямую в TDDFT они не получаются, но вот таким образом проявляются. И если эти коэффициенты при DEEXCITATIONS большие по модулю (>0.1-0.2), то данный переход плохо описывается в TDDFT.
А орбитали, если они в выдаче есть, можно посмотреть ChemCraft-ом или Molden-ом.
А орбитали, если они в выдаче есть, можно посмотреть ChemCraft-ом или Molden-ом.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
Re: EXCITATIONS & DEEXCITATIONS SAP COEFFICENT
Спасибо большое за ответ! Проводила визуализацию результатов расчета программой ChemCraft, она выдала спектр молекулы, ее структуру, заряды, порядки связей и др.,что касается МО, то получила только диаграмму энергетических уровней молекулярных орбиталей. Интересно было бы посмотреть конкретный вид каждой МО, какие АО участвуют о образовании данной МО. Можно ли такое сделать в FF или GAMESSе?Если да, то что нужно добавить во входно файл, чтобы на выдаче можно было посмотреть конкретный вид каждой МО!
У меня было так
$CUBE CUBE=.T. MESH=fine $END
$ELDENS IEDEN=1 $END
Нашла, что группа $ELDENS отвечает за вычисление электронной плотности.
есть еще группа $MOLGRF, она как раз отвечает за визуализацию орбиталей, но для нее требуется коммерческий пакет MOLGRAPH. Может кто-нибудь знает, как можно визуализировать орбитали с помощью chemcrafta? или это некорректный вопрос?
У меня было так
$CUBE CUBE=.T. MESH=fine $END
$ELDENS IEDEN=1 $END
Нашла, что группа $ELDENS отвечает за вычисление электронной плотности.
есть еще группа $MOLGRF, она как раз отвечает за визуализацию орбиталей, но для нее требуется коммерческий пакет MOLGRAPH. Может кто-нибудь знает, как можно визуализировать орбитали с помощью chemcrafta? или это некорректный вопрос?
Re: EXCITATIONS & DEEXCITATIONS SAP COEFFICENT
Ни $CUBE, ни $ELDENS, ни $MOLGRF для визуализации орбиталей ChemCraft-ом не нужны. Если орбитали в файле есть (а они есть, раз выдается диаграмма уровней), то делаем так: Tools->Orbitals->Render molecular orbitals. Там отмечаем нужные орбитали, уменьшаем map points per angstrom, чтоб побыстрее строилось, и жмем OK. Все. Можно еще посмотреть Analyze molecular orbitals -- там будут вклады расписаны.
Если орбиталей по какой-то причине в файле нет, посмотрите в мануале опции типа nprint, nprt и поставьте значения такие, чтобы печатались орбитали. Да, ни в коем случае не заказывайте печать орбиталей на каждом шагу оптимизации геометрии -- файл будет бешеного размера и может не влезть в ChemCraft.
Если орбиталей по какой-то причине в файле нет, посмотрите в мануале опции типа nprint, nprt и поставьте значения такие, чтобы печатались орбитали. Да, ни в коем случае не заказывайте печать орбиталей на каждом шагу оптимизации геометрии -- файл будет бешеного размера и может не влезть в ChemCraft.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
Re: EXCITATIONS & DEEXCITATIONS SAP COEFFICENT
Спасибо огромное! Все выводится, сама бы наверное не разобралась))))
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 13 гостей