Новые интересные софты для химиков

[ilonaolenikova]

Всем привет! Всегда мечтала о чудо программе, которая будет извлекать химические структуры из статей, патентов и др. в редакторы химических формул (типа ChemDraw). Может такие проги уже существуют. Кто встречал?

[Гесс]

вероятно существуют, потому как гложут меня сомнения что скайфайндер наполняют формулами в статьи вручную. Но я пока не встречал.
Это должно быть какое то продвинутое распознавание.

[uchebnik fiziki]

Конечно, существуют и давно. Есть тривиальные -- перевод формул в смайлс. Есть более продвинутые. По ключевым словам всё легко гуглится.

[uchebnik fiziki]

потому как гложут меня сомнения что скайфайндер наполняют формулами в статьи вручную.

вот жалко, не попал я на их программу, мог бы посмотреть. Но вообще высококачественные базы данных обычно контролируются вручную. За это, собственно, бешеные деньги и дерут.

[Гесс]

Конечно, существуют и давно. Есть тривиальные -- перевод формул в смайлс. Есть более продвинутые. По ключевым словам всё легко гуглится.

эммм, непонял, смайлсы само собой, но если я правильно понял ТС - то вопрос в том чтобы
1) дать программе пдф-статье
2) ...
3) кемофисовский документ с формулами напечатанными в статье
4) PROFIT

причем в пункте 2) нет "специально обученной мартышки которая перерисует формулы с одного места в другое"

Но вообще высококоачественные базы данных обычно контролируются вручную. За это, собственно, бешеные деньги и дерут.

Контролируют наверняка, потому как ситуаций когда в статье нет того что указано в скайфе я встречал всего пару раз (я говорю про поиск по формуле).
Просто ИМХО отсмотреть соответствие и наличие явной лажи проще чем долго и мучительно перерисовывать.
В частности в пользу этого говорит то что каркасные алканы и их производные (то что я чаще всего ищу) в результатах поиска отображаются в основном единообразно, и практически никогда не так как их рисуют нормальные люди в статьях.

[uchebnik fiziki]

причем в пункте 2) нет "специально обученной мартышки которая перерисует формулы с одного места в другое"

Ну так в любом случае после распознавания образов проводится их проверка. Конвертация смайлс в картинки -- тривиальная операция. Конвертация картинок в смайлс путём распознавания образов -- значительно менее, но такого софта точно больше одного названия. Я сам пользовался такой штукой, когда синтетики принесли список реагентов и надо было его конвертировать в комбинаторную библиотеку.

Просто ИМХО отсмотреть соответствие и наличие явной лажи проще чем долго и мучительно перерисовывать.

Когда я работал в подобной конторе, там перерисовывали. Например, потому, что в статьях обычно нет списка полных формул, а есть отдельно нарисованные скаффолды и отдельные заместители.

В частности в пользу этого говорит то что каркасные алканы и их производные (то что я чаще всего ищу) в результатах поиска отображаются в основном единообразно, и практически никогда не так как их рисуют нормальные люди в статьях.

Скорее это стандартизация картинки по каким-то руководящим указаниям.

[ilonaolenikova]

что-то у меня по ключевым словам особо не гуглилось, кроме как перевод в смайлсы. Только этот перевод из 10 pdf-ок хорошо если одну только распознавал((( если встречали продвинутые проги, поделитесь с народом))

[uchebnik fiziki]

ключевые слова -- chemical structure ocr
там была какая-то софтина, которая работала с тиффами
пдф конвертируется в тифф с высоким разрешением, потом распознаётся
потом ручками проверять всё