Киназы и их ингибиторы

[suprachemister]

Я тут добавил немного литературы по киназам

Хотелось бы узнать у специалистов почему исследование киназ и лекарств-ингибиторов так популярно ?
А также есть ли методы кроме Docking (RBA) для самого дизайна ?

P.S. и где про это можно почитать доступным языком...

[Marxist]

Хотелось бы узнать у специалистов почему исследование киназ и лекарств-ингибиторов так популярно?

Потому что киназы -- самые распространённые ферменты (у человека их около 600 штук) и очень хорошие биомишени. Относительно просто проводить HTS. Потом, немалую роль в этом сыграл шумный успех иматиниба (Gleevec, курите поиск по форуму, тема обсуждалась несколько лет назад в органике)

А также есть ли методы кроме Docking (RBA) для самого дизайна ?

Докинг -- вообще не метод дизайна. Что такое RBA, кстати?

Вообще в каждом номере JMC и JCIM проскакивают статьи с новыми методами. Ну или так или иначе относящиеся к теме.

P.S. и где про это можно почитать доступным языком...

А чем вас эти книжки, которые вы выложили, не устраивают?

[avor]

Хотелось бы узнать у специалистов почему исследование киназ и лекарств-ингибиторов так популярно ?

А это потому что фосфорилирование белков это один из самых распрастраненных вариантов регуляции активности белков. Для определенного субстрата(белочка, например р53 или циклин какой то) существует своя специфичная киназа при чем ее активация в свою очередь тоже может зависить от ее собственного фосфорилирования. Так вот после фосфорилирования по какой-то определенной аминокислоте белочек приобретает новую активность, например: связывается с ДНК и включает экспрессию какого-нибудь гена или встраивается в какой-то комплекс, который начинает работать, а до этого не мог, или наоборот распадается какой-то олигомерный комплекс. Очень много внешних химических сигналов в клетку после активации белка рецептора на мембране клетки включают целые каскады фосфорилирования вызывающие весьма сложные реакции клетки. Очень многие паталогии в клетке связаны с нарушениями работы киназ, в частности их нерегулируемой избыточной активностью. Вот поэтому избтрательные ингибиторы киназ так популярны в качестве потенциальных драгов особенно в онкологии.

[suprachemister]

Докинг -- вообще не метод дизайна. Что такое RBA, кстати?

RBA--RECEPTOR-BASED APPROACH

А чем вас эти книжки, которые вы выложили, не устраивают?

я думаю, что они слишком сложные как для студента...
может есть почитать что-то на русском для начала и потом переходить к таким книгам...
или чтобы стать профессионалом надо сразу читать и разбираться по таким книгам ?...

[Marxist]

или чтобы стать профессионалом надо сразу читать и разбираться по таким книгам ?...

Лучше сразу читать и разбираться по обзорам, статьям, патентам и мануалам но можно и по книгам, главное, чтоб содержание было подходящее. Вот, например, в книге "Kinase Inhibitor Drugs" есть неплохие главы, это видно джаже по их названиям.

RBA--RECEPTOR-BASED APPROACH

Да уж, любят хохлы придумывать новые названия известным вещам.

Вот вам типичный пример на фрагментном подходе, первая попавшаяся статья

[Cherep]

Эээ, Marxist, ты того, это, полегче с терминами там всякими

В книги приходится лезть как раз за расшифровкой аббревиатур, толкованием терминов, итп. Интернет - то он есть, но он - Помойка...
Ещё я когда-то наивно думал, что в книгах по медицинской химии всё будет в общем виде. Что-то есть м в общем, но не все.

[Marxist]

Эээ, Marxist, ты того, это, полегче с терминами там всякими

Я про Енамин, если что

В книги приходится лезть как раз за расшифровкой аббревиатур, толкованием терминов, итп. Интернет - то он есть, но он - Помойка...

Ага, в медхимических блогах полезной информации зачастую не меньше, чем в иных книгах

Ещё я когда-то наивно думал, что в книгах по медицинской химии всё будет в общем виде. Что-то есть м в общем, но не все.

А потому что нет никакой общности, в этой области ещё очень много state-of-the-art и персонализированных подходов.

[Cherep]

А потому что нет никакой общности, в этой области ещё очень много state-of-the-art и персонализированных подходов.

Ну, вобщем как-то так и есть. Только для меня это уже послезнание

Upd

Ага, в медхимических блогах полезной информации зачастую не меньше, чем в иных книгах

Времена меняются... Где эти блоги были 7 лет назад? О, как я стар...

[suprachemister]

Ага, в медхимических блогах полезной информации зачастую не меньше, чем в иных книгах

а какие из ихнего огромного количества посоветуете почитать на ваш вкус ?...

А потому что нет никакой общности, в этой области ещё очень много state-of-the-art и персонализированных подходов.

а что из себя представляют эти state-of-the-art приведите пример или ссылку где почитать... спасибо

[daniilsakun]

Уважаемые участники форума, здравствуйте! Искренне рассчитываю на вашу помощь! Если кто-то занимался или просто знаком со спектрофотометрической методикой определения активности ангиотензин-превращающего фермента в сыворотке крови с исп в качестве субстрата ФУРИЛАКРИЛОИЛФЕНИЛАЛАНИЛГЛИЦИЛГЛИЦИНА (FAPGG), поделитесь пожалуйста, посоветуйте литературу или к кому можно обратиться, мой E-mail: daniilsakun@gmail.com , в интернете, даже на зарубежных сайтах, она, к сожалению, не достаточно подробно дается. Спасибо.
С уважением, Даниил Сакун.

[Cherep]

А при чём тут киназы?

[daniilsakun]

Не нашел соответствующей темы, поэтому написал в тех, что с ферментами связаны. я знаю, что такое киназы))

[avor]

поделитесь пожалуйста, посоветуйте литературу или к кому можно обратиться, мой E-mail: daniilsakun@gmail.com , в интернете, даже на зарубежных сайтах, она, к сожалению, не достаточно подробно дается. Спасибо.
С уважением, Даниил Сакун.

Балин! Врачи, а своим же pubmed'ом пользоваться не хотят.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/portal/utils/pageresolver.fcgi?log$=activity&recordid=1263661635668666

[Marxist]

Не нашел соответствующей темы

А новую завести религия не позволяет?

[daniilsakun]

Не нашел соответствующей темы

А новую завести религия не позволяет?

Позволяет) спешил просто, да и форумами не пользовался до этого, не сообразил в общем.

[daniilsakun]

поделитесь пожалуйста, посоветуйте литературу или к кому можно обратиться, мой E-mail: daniilsakun@gmail.com , в интернете, даже на зарубежных сайтах, она, к сожалению, не достаточно подробно дается. Спасибо.
С уважением, Даниил Сакун.

Балин! Врачи, а своим же pubmed'ом пользоваться не хотят.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/portal/util ... 1635668666

Такое ощущение складывается, что кто-то себя умнее остальных считает. может поделитесь как с "нашего" pubmed`a полнотекстовые статьи скачивать?? ссылка, кстати, не работает, но все равно спасибо!

[Marxist]

может поделитесь как с "нашего" pubmed`a полнотекстовые статьи скачивать??

пабмед -- база рефератов, а не статей. Для скачивания статей есть отдельный форум.

[Vanya Ivanov]

Marxist, подскажите, пожалуйста, что за медхимические блоги Вы имели ввиду?

[Marxist]

pipeline.corante.com, например. У него в левой колонке есть ещё нехилый списочек, но мне всё лень там порыться.