Цветная разметка белковых структур

вопросы современной биологической химии, молекулярной биологии, химической энзимологии и смежных наук
biochem, molbio, chemical enzymology and related discussions for professionals
Ответить
d53
Сообщения: 32
Зарегистрирован: Вс фев 28, 2010 10:35 am

Цветная разметка белковых структур

Сообщение d53 » Пт мар 26, 2010 7:14 pm

На картинках где изображают всякие белковые структуры делают определенную цветную раскраску отдельных первичных структур, но я не пойму по какому признаку? Почему одни красные другие зелёные третьи серые и тд, это произвольно всё раскрашивается или есть строгие правила цветной маркировки?

Marxist

Re: Цветная разметка белковых структур

Сообщение Marxist » Пт мар 26, 2010 7:52 pm

Либо это структурно обоснованная окраска (например, выделение доменов), либо это окраска по вторичной структуре с использованием дефолтных цветовых схем.
FIG05_pkne.jpg
snap.jpg
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

d53
Сообщения: 32
Зарегистрирован: Вс фев 28, 2010 10:35 am

Re: Цветная разметка белковых структур

Сообщение d53 » Пт мар 26, 2010 8:01 pm

а если на картинке рядом две альфа-спирали но разного цвета, это что значит? разные домены?

Marxist

Re: Цветная разметка белковых структур

Сообщение Marxist » Пт мар 26, 2010 8:19 pm

А вы уверены, что они обе альфа? Если да, то это значит, что авторы по какой-то причине захотели их покрасить по-разному. Причин может быть много разных, и они обычно объясняются в тексте статьи или подписи к рисунку.

d53
Сообщения: 32
Зарегистрирован: Вс фев 28, 2010 10:35 am

Re: Цветная разметка белковых структур

Сообщение d53 » Пт мар 26, 2010 8:39 pm

ну вот чтобы далеко не ходить
http://img696.imageshack.us/img696/2028 ... shotrt.jpg

Marxist

Re: Цветная разметка белковых структур

Сообщение Marxist » Пт мар 26, 2010 8:41 pm

Ну это симметричный димер. Одна субъединица синяя, другая зелёная.

d53
Сообщения: 32
Зарегистрирован: Вс фев 28, 2010 10:35 am

Re: Цветная разметка белковых структур

Сообщение d53 » Пт мар 26, 2010 8:41 pm

Спасибо!

Ответить

Вернуться в «биохимия и молекулярная биология / biochemistry and molecular biology»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 16 гостей