Chemistry of amino acids & peptides (books)

Ответить
Аватара пользователя
mercaptan
Сообщения: 2954
Зарегистрирован: Сб мар 29, 2008 8:42 pm

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение mercaptan » Вс авг 16, 2009 6:16 pm

Полезный линк для пептидчиков (дублирую) :)
Literature Database at The Protein Research Foundation

Код: Выделить всё

http://www.prf.or.jp/en/litq.html
Some scientists claim that hydrogen, because it is so plentiful, is the basic building block of the universe. I dispute that. I say that stupidity is far more abundant than hydrogen, and THAT is the basic building block of the universe.
-- Frank Zappa

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Сб авг 22, 2009 7:55 am

mercaptan: Согласен, я тоже периодически собирался перенести информацию по японской литературной базе в эту тему. Вместе с рекомендации по доению этого ресурса. :wink:
LITDB - Literature Database at The Protein Research Foundation (Japan)

Код: Выделить всё

http://www.prf.or.jp/en/litq.html
В этой узкоспециализированной литературной базе данных с японской дотошностью окучиваются работы по биоохимии и химии аминокислот, пептидов и белков начиная аж с 1900 (!) г. Недавно стали туда заносить и труды международных пептидных симпозиумов. Это, конечно, "индпошив", но для тех, кто в теме, гарантировано станет настольным инструментом.
Одно "но": полный доступ открыт лишь для подписчиков Peptide Information и/или электронного эквивалента этого журнала. Остальным: "Guest users can search PRF/LITDB for evaluation. Results are limited to 30 entries"
Но счётчик у них не поставлен, так что можно аликвотами по 30 хоть 100 раз подряд :wink: ... ;) Как это делается, скорее всего, вы и сами догадаетесь, но на всякий случай:
Когда вы получаете 30 халявных ссылок, их следует скопировать в буфер, сохранить в текстовом файле, а затем пристально посмотреть на последнюю ссылку, на которой ваш запрос оборван. Копируете её инвентарный номер, возвращаетесь на страницу с окном поиска с помощью кнопки "назад" и "уточняете" :wink: ваш запрос путём включения этого номера в поле "LITDB ID", причём его нужно увеличить на единицу, а вместо последней буквы поставить дефис. Повторяете процедуру до полного удовлетворения :D

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Пт сен 04, 2009 4:37 am

Успешного испанского графомана Фернандо Алберисио, думаю, представлять читающим эту тему излишне. Я скептически отношусь к его эпистолярному творчеству и всегда было в напряг заказывать десятки статей, только для того, чтобы быть в курсе похождений этого деятеля. Однако скачать оптом и без лишних хлопот 50+ pdf-ов с сайта его лаборатории оказалось мне не чуждо и вполне по силам :wink: Халява - как много в этом слове...

Код: Выделить всё

http://www.pcb.ub.es/fama/htm/publications.htm

Аватара пользователя
horks
Сообщения: 865
Зарегистрирован: Пт янв 12, 2007 7:10 pm

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение horks » Вс сен 13, 2009 9:33 pm

Вроде этого еще не было
MMB-87. Combinatorial peptide library protocols. 1997.pdf

Аватара пользователя
horks
Сообщения: 865
Зарегистрирован: Пт янв 12, 2007 7:10 pm

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение horks » Пн сен 14, 2009 2:35 pm

И еще одна:
APS-202.Peptide Hybrid Polymers.zip

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Пн сен 14, 2009 5:43 pm

Horks:
Спасибо за пополнение темы. Нужно нам всё-таки, в интересах просветительской деятельности, :wink: стараться приводить полное название книг, хотя меня это тоже всегда напрягает :wink:
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

На днях довёл до приличного вида книженцию, давно гуляющую по интернету в общипанном виде (без оглавления и указателя, ссылку выкладывал Ося на первой странице):
Peptide Synthesis Protocols. Michael W. Pennington & Ben M. Dunn, Eds. In: Methods in Molecular Biology v. 35, Humana Press, 1994.
This time Table of contents and Subject index are included!!

Код: Выделить всё

http://rapidshare.com/files/279096284/PepSynProtcls_MMB35.rar
http://narod.ru/disk/13065462000/PepSynProtcls_MMB35.rar.html
На гигапедии лежит ещё несколько умеренно информативных MMB по пептидам: №№ 32,36,61,146,251,298,386,494. Совсем недавно появился свежий:

Peptide Microarrays: Methods and Protocols. Marina Cretich, Marcella Chiari, Eds. In: Methods in Molecular Biology v.570, Humana Press, 2009.

Код: Выделить всё

http://ifile.it/srmu6ji/pept.rar
In "Peptide Microarrays: Methods and Protocols", experts in the field provide a cutting-edge view of peptide array technology, its applications, and technical issues. After examining how peptides can characterize proteins and clarify, at the amino acid level, the molecular recognition events in which they are involved, the volume goes on to cover topics such as the production and use of peptide arrays for enzyme and binding motifs characterization, epitope mapping, and diagnostics, the newest technological advancements, as well as software and web tools for the design of peptide arrays and for the analysis of output data. As a volume in the highly successful "Methods in Molecular Biology" series, chapters include brief introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and notes on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

gugu

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение gugu » Сб сен 26, 2009 11:08 pm

Доброго времени суток! На днях обнаружил, что Wiley выпустил новый сборник, двухтомник "Amino Acids, Peptides and Proteins in Organic Chemistry" (ссылка: http://eu.wiley.com/WileyCDA/WileyTitle/productCd-3527320962.html). На Гигапедии его вроде нет. Никто не видел?

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Вс сен 27, 2009 9:49 am

Спасибо, коллега gugu за новости!
Скоро расшарят, дата выхода - октябрь 2009.
Но оглавление, честно говоря, не впечатляет, если не сказать: огорчает. :( Какой-то нарциссически-выпендрёжный замес, скомпанованный очередным редактором-нуворишем, о заслугах которого лично мне ничего не известно....

Amino Acids, Peptides and Proteins in Organic Chemistry: Volume 1 - Origins and Synthesis of Amino Acids. Andrew B. Hughes (Series Editor)

PART I: Origins of Amino Acids

EXTRATERRESTRIAL AMINO ACIDS
Introduction
ISM
Comets
Meteorites
Micrometeorites and IDPs
Mars
Delivery of Extraterrestrial Amino Acid to the Earth and its Importance to the Origin of Life

?TERRESTRIAL? AMINO ACIDS AND THEIR EVOLUTION
Introduction
What are the 20 ?Terrestrial? Amino Acids?
What do We Know about the Evolution of the Standard Amino Acid Alphabet?
Amino Acids that Life Passed Over: A Role for Natural Selection?
Why Does Life Genetically Encode L-Amino Acids?
Summary, Synthesis, and Conclusions

PART II: Production/Synthesis of Amino Acids
USE OF ENZYMES IN THE SYNTHESIS OF AMINO ACIDS
Introduction
Chemo-Enzymatic Processes to Enantiomerically Pure Amino Acids
Acylase Process
Amidase Process
Hydantoinase Process
Ammonia Lyase Processes
Aminotransferase Process
AADH Process
BETA-AMINO ACID BIOSYNTHESIS
Introduction
Biosynthesis of Beta-Amino Acids
Conclusions and Future Prospects
METHODS FOR THE CHEMICAL SYNTHESIS OF NONCODED ALPHA-AMINO ACIDS FOUND IN NATURAL PRODUCT PEPTIDES
Introduction
Noncoded CAAs
Noncoded Amino Acids by Chemical Modification of Coded Amino Acids
Noncoded Amino Acids with Elaborate Side-Chains
SYNTHESIS OF N-ALKYL AMINO ACIDS
Introduction
N-Methylation via Alkylation
N-Methylation via Schiff?s Base Reduction
N-Methylation by Novel Methods
N-Alkylation of Amino Acids
RECENT DEVELOPMENTS IN THE SYNTHESIS OF BETA-AMINO ACIDS
Introduction
Synthesis of Beta-Amino Acids by Homologation of Alpha-Amino Acids
Chiral Pool: Enantioselective Synthesis of Beta-Amino Acids from Aspartic Acid, Asparagine, and Derivatives
Synthesis of Beta-Amino Acids by Conjugate Addition of Nitrogen Nucleophiles to Enones
Synthesis of Beta-Amino Acids via 1,3-Dipolar Cycloaddition
Synthesis of Beta-Amino Acids by Nucleophilic Additions
Synthesis of Beta-Amino Acids by Diverse Addition or Substitution Reactions
Synthesis of Beta-Amino Acids by Stereoselective Hydrogenation of Prochiral 3-Aminoacrylates and Derivatives
Synthesis of Beta-Amino Acids by Use of Chiral Auxiliaries: Stereoselective Alkylation
Synthesis of Beta-Amino Acids via Radical Reactions
Miscellaneous Methods for the Synthesis of Beta-Amino Acids
Experimental Procedures
SYNTHESIS OF CARBOCYCLIC BETA-AMINO ACIDS
Introduction
Synthesis of Carbocyclic Beta-Amino Acids
Synthesis of Functionalized Carbocyclic Beta-Amino Acid Derivatives
Enzymatic Routes to Carbocyclic Beta-Amino Acids
Experimental Procedures
SYNTHETIC APPROACHES TO ALPHA, BETA-DIAMINO ACIDS
Introduction
Construction of the Carbon Backbone
Introduction of the Nitrogen Atoms in the Carbon Backbone
Experimental Procedures
SYNTHESIS OF HALOGENATED ALPHA-AMINO ACIDS
Introduction
Halogenated Amino Acids with a Hydrocarbon Side-Chain
Halogenated Amino Acids with an Aromatic Side-Chain
Halogenated Amino Acids with Heteroatoms in the Aliphatic Side-Chain
SYNTHESIS OF ISOTOPICALLY LABELED ALPHA-AMINO ACIDS
Introduction
Enzyme-Catalyzed Methods
Chiral Pool Approach
Chemical Asymmetric Methods
Experimental Procedures
SYNTHESIS OF UNNATURAL/NONPROTEINOGENIC ALPHA-AMINO ACIDS
Introduction
Chemical Methods
Enzymatic Methods
Experimental Procedures
SYNTHESIS OF GAMMA AND DELTA-AMINO ACIDS
Introduction
Gamma-Amino Acids
Delta-Amino Acids
SYNTHESIS OF GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID ANALOG
Introduction
Alpha-Substituted Gamma-Amino Acids
Beta-Substituted Gamma-Amino Acids
Trisubstituted Gamma-Amino Acids
Hydroxy-Gamma-Amino Acids
Unsaturated Gamma-Amino Acids
Cyclic Gamma-Amino Acids
Experimental Procedures


Amino Acids, Peptides and Proteins in Organic Chemistry, Volume 2: Modified Amino Acids, Organocatalysis and Enzymes
Andrew B. Hughes
(Series Editor)

PART I: Synthesis and Chemistry of Modified Amino Acids

SYNTHESIS AND CHEMISTRY OF ALPHA, BETA-DIDEHYDROAMINO ACIDS
Introduction
Synthesis of DDAAs
Reactions of DDAAs
Experimental Procedures
SYNTHESIS AND CHEMISTRY OF ALPHA-HYDRAZINO ACIDS
Introduction
Synthesis
Chemistry
Experimental Procedures
HYDROXAMIC ACIDS: CHEMISTRY, BIOACTIVITY, AND SOLUTION- AND SOLID-PHASE SYNTHESIS
Introduction
Chemistry, Bioactivity, and Clinical Utility
Solution-Phase Synthesis of Hydroxamic Acids
Solid-Phase Synthesis of Hydroxamic Acids
Experimental Procedures
CHEMISTRY OF ALPHA-AMINOBORONIC ACIDS AND THEIR DERIVATIVES
Introduction
Synthesis of Alpha-Aminoboronic Acids
Synthesis of Alpha-Aminoboronic Acid Derivatives
Asymmetric Synthesis via Alpha-Haloalkylboronic Esters
Synthesis of Glycine Alpha-Aminoboronic Acids
Synthesis of Proline Alpha-Aminoboronic Acids
Synthesis of Alanine Alpha-Aminoboronic Acids
Synthesis of Ornithine Alpha-Aminoboronic Acids
Synthesis of Arginine Alpha-Aminoboronic Acids
Synthesis of Phenethyl Peptide Boronic Acids
Synthesis via Zirconocene Species
Synthesis and Activity of Amine-Carboxyboranes and their Derivatives
Synthesis of Boron Analogs of Phosphonoacetates
CHEMISTRY OF AMINOPHOSPHONIC ACIDS AND PHOSPHONOPEPTIDES
Introduction
Physical/Chemical Properties and Analysis
Synthesis of Alpha-Aminophosphonic Acids
Synthesis of Beta-Aminophosphonates
Synthesis of Gamma-Aminophosphonates and Higher Homologs
Phosphono- and Phosphinopeptides
Remarks on the Practical Utility of Aminophosphonates
Experimental Procedures
CHEMISTRY OF SILICON-CONTAINING AMINO ACIDS
Introduction
Synthesis of Silicon-Containing Amino Acids
Reactions of Silicon-Containing Amino Acids
Bioactive Peptides Incorporating Silicon-Substituted Amino Acids
Experimental Procedures

PART II: Amino Acid Organocatalysis

CATALYSIS OF REACTIONS BY AMINO ACIDS
Introduction
Aldol Reaction
Mannich Reaction
Alpha-Amination Reaction
Michael Reaction
Morita-Baylis-Hillman Reactions and their Aza Counterpart
Miscellaneous Amino Acid-Catalyzed Reactions
Sustainability of Amino Acid Catalysis
Experimental Procedures

PART III: Enzymes

PROTEASES AS POWERFUL CATALYSTS FOR ORGANIC SYNTHESIS
Enzyme Biocatalysis
Proteolytic Enzymes: Mechanisms and Characteristics
Proteases as Process Catalysts
Proteases in Organic Synthesis
Peptide Synthesis
SEMISYNTHETIC ENZYMES
Usefulness of Semisynthetic Enzymes
Natural Protein Biosynthesis
Sense Codon Reassignment
Missense Suppression
Evolving the Orthogonal aaRS/tRNA Pair
Nonsense Suppression
Mischarging of rRNA by Ribozyme
Evolving the Orthogonal Ribosome/mRNA Pair
Frame-Shift Suppression
Noncanonical Base Pairs
Chemical Ligation
Inteins
EPL
Post-Transitional Chemical Modification
Examples of Semisynthetic Enzymes
CATALYSIS BY PEPTIDE-BASED ENZYME MODELS
Introduction
Peptide Models of Hydrolytic Enzymes
Peptide Models of Heme Proteins
SUBSTRATE RECOGNITION
Recognition, Specificity, Catalysis, Inhibition, and Linguistics
Serine Proteinases
Cysteine Proteinases
Glycoside Hydrolases
Protein Kinases
aaRSs
Lipases
PROTEIN RECOGNITION
General Introduction
Nature of Protein Interfaces
Affinity of Protein Interactions
Measuring Protein Interactions
Coupled Folding and Binding
Regulation of Interactions by PTMs
Engineering and Inhibiting Protein-Protein Interactions
MAMMALIAN PEPTIDE HORMONES: BIOSYNTHESIS AND INHIBITION
Introduction
Mammalian Peptide Hormones
Biosynthesis of Peptide Hormones
Inhibition of Biosynthesis
INSECT PEPTIDE HORMONES
Introductin
Structure and Biosynthesis of Insect Peptide Hormones
Proctolin
Sex Peptide
A-Type Allatostatins
CRF-Related DHs
Insect Peptide Hormones and Insect Control
PLANT PEPTIDE SIGNALS
Introduction
Defense-Related Peptides
Peptides Involved in Growth and Development
Peptides Involved in Self-Recognition
Methods in Plant Regulatory Peptide Research
NONRIBOSOMAL PEPTIDE SYNTHESIS
Introduction
NRPs
NRP Synthetase Domains
PPTases
Experimental Strategies for NRPS Investigations
Non-NRPs

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Вт окт 06, 2009 7:29 am

Похоже я-таки обучился нескольким новым трюкам :wink: и теперь могу продолжить любимый сериал:
Amino Acids, Peptides and Proteins. Vol.27.
A review of the literature published during 1994. Davies J.S. (Editor), Royal Society of Chemistry, 1996.

Код: Выделить всё

http://rapidshare.com/files/289221502/AAsP_P_v27_94_96.rar
В те недавние времена, когда задача выуживания этих книг казалась мне неподъёмной, я собрал главы по химии аминокислот (они в открытом доступе) из всех "недостающих" томов (Vols 1-17,21-28). Это вполне себе самоценная подборка будет полезна многим форумчанам, имеющим дело с аминокислотами:
Collection of Amino acids' sections from Vols 1-17,21-28

Код: Выделить всё

http://narod.ru/disk/10832317000/AminoAcidsSections.rar.html
Пока не поздно, советую всем коллегам заказать себе бесплатную, но весьма пользительную брошюрку
The Bachem Practice of SPPS - Tips and tricks

Код: Выделить всё

http://www.bachem.com/index.cfm?A9051072802B49FC9D13A0763071D00E

Аватара пользователя
bromin
Сообщения: 4200
Зарегистрирован: Чт янв 24, 2008 7:38 pm
Контактная информация:

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение bromin » Вт окт 06, 2009 12:47 pm

Глубокоуважаемый коллега Upstream, возможно ли перезалить файл v24_91_93_AAs.pdf или в архив он попал битым?
Спасибо!

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Вт окт 06, 2009 6:09 pm

Thanks, Bromin, for detecting the bug!
Here is the direct link for the correct version of the corrupted v24_91_93_AAs.pdf file:

Код: Выделить всё

http://www.rsc.org/ebooks/archive/free/AM9780851862248/AM9780851862248-00001.pdf 
I feel sorry for not having checked each file. :oops:

Аватара пользователя
bromin
Сообщения: 4200
Зарегистрирован: Чт янв 24, 2008 7:38 pm
Контактная информация:

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение bromin » Вт окт 06, 2009 7:11 pm

Upstream писал(а):Thanks, Bromin, for detecting the bug!
Here is the direct link for the correct version of the corrupted v24_91_93_AAs.pdf file:

Код: Выделить всё

http://www.rsc.org/ebooks/archive/free/AM9780851862248/AM9780851862248-00001.pdf 
I feel sorry for not having checked each file. :oops:
Дорогой коллега Upstream не надо чувствовать сорри! Я благодарен за материал которым вы делитесь!!!

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Ср окт 14, 2009 1:02 am

Amino Acids, Peptides and Proteins. Vol.28
A Review of the Literature Published during 1995. Davies J.S., Ed., (Specialist Periodical Reports), Royal Society of Chemistry, 1997

Код: Выделить всё

http://rapidshare.com/files/292629140/v28_95_97.rar

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Вс окт 18, 2009 12:28 pm

Amino Acids, Peptides and Proteins. Vol.27. A Review of the Literature Published during 1994. Senior reporter John S. Davies, RSC 1996.

Код: Выделить всё

http://rapidshare.com/files/289221502/AAsP_P_v27_94_96.rar
Amino Acids, Peptides and Proteins. Vol.26. A Review of the Literature Published during 1993. Senior reporter John S. Davies, RSC 1995.

Код: Выделить всё

http://rapidshare.com/files/292879904/AAP_P_v26_93_95.rar

Аватара пользователя
SERGYIO
Сообщения: 1323
Зарегистрирован: Чт авг 14, 2008 3:37 pm

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение SERGYIO » Вс окт 18, 2009 11:12 pm

:!: Mirror, Pleas! :shuffle:

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Пн окт 19, 2009 3:58 am

SERGYIO: Mirrors are allowed and encouraged! :wink:
In case you want me to re-upload something, please, clarify, what do you need specifically, and which file exchangers do you prefer.

Аватара пользователя
Upstream
Сообщения: 3444
Зарегистрирован: Ср июн 11, 2008 10:46 am

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Upstream » Пн окт 19, 2009 12:59 pm

Amino Acids, Peptides and Proteins. Vol.25. A Review of the Literature Published during 1992. Senior reporter John S. Davies, RSC 1994.

Код: Выделить всё

http://rapidshare.com/files/294984607/AAPP_v25_92_94.rar

Bomber
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Ср сен 23, 2009 11:07 pm

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение Bomber » Ср окт 21, 2009 1:16 am

М.б. кому-нибудь интересно:

Asymmetric Synthesis and Application of α-Amino Acids
Editor(s): Vadim A. Soloshonok, Kunisuke Izawa
ACS Symposium Series. V.1009
Publication Date (Print): June 14, 2009
Copyright © 2009 American Chemical Society

В открытом доступе по 24.10

Код: Выделить всё

http://pubs.acs.org/doi/book/10.1021/bk-2009-1009
"Господи, дай мне спокойствие принять то, чего я не могу изменить, дай мне мужество изменить то, что я могу изменить. И дай мне мудрость отличить одно от другого"
Карл Фридрих Этингер (1702—1782)

Аватара пользователя
bromin
Сообщения: 4200
Зарегистрирован: Чт янв 24, 2008 7:38 pm
Контактная информация:

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение bromin » Ср окт 21, 2009 5:10 pm

Кто скачал Asymmetric Synthesis and Application of α-Amino Acids, поделитесь пожалуйста! Обрыв постоянный :evil:

CF3
Сообщения: 153
Зарегистрирован: Чт фев 21, 2008 9:29 pm

Re: Chemistry of amino acids & peptides (books)

Сообщение CF3 » Чт окт 22, 2009 2:07 am

bromin писал(а):Кто скачал Asymmetric Synthesis and Application of α-Amino Acids, поделитесь пожалуйста! Обрыв постоянный :evil:
Пожалуйста, please, bitte... 39MB
Не могу стоять на своём - очень больно!

Ответить

Вернуться в «Полезные материалы от участников форума»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 17 гостей