Собственно пользовался вебверсией chemaxon для расчёта LogD моих молекул, но внезапно они эту лазейку прикрыли (
Так же похожий функционал есть у ACDlabs, пользуюсь версией 6 с рутрекера, так же вроде есть версия 12 , но там морока с активацией.
Собственно вопрос: а нет ли какого то свободного софта для подобных расчетов? Может быть какие то скрипты или библиотеки под Python, rScript или типа того ? Алгоритмы то вроде как простые и публичные, неужели никто не соорудил?
Какой есть доступный софт для расчета LogD, pKa и т.д.
- Jokermaniak
- Сообщения: 3780
- Зарегистрирован: Чт окт 02, 2014 4:41 pm
Re: Какой есть доступный софт для расчета LogD, pKa и т.д.
Есть всякие открытые Пубкемы и Кемспидоры, которые приводят расчетные физхим константы для туевой хучи веществ. Конечно, вашего может там не быть, но у них там адские миллионы гипотетических и никем не синтезированных структур, поэтому вероятность что и ваша будет достаточно велика...
Что, Карл Маркс запрещает держать на лестнице ковры? Разве где-нибудь у Карла Маркса сказано, что 2-й подьезд калабуховского дома на Пречистенеке следует забить досками и ходить кругом через черный двор?
Re: Какой есть доступный софт для расчета LogD, pKa и т.д.
Ну они приводят цифры рассчитанные по ACD алгоритму для пары разных рН. Хемаксон и десктопная версия ACD строит график-зависимость в диапазоне рН 0-14, что куда удобнее и нагляднее.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: Bing [Bot] и 3 гостя