как запустить параллельный рассчет на pcgamess

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
lucky-ph
Сообщения: 36
Зарегистрирован: Пн дек 03, 2007 3:44 pm
Контактная информация:

как запустить параллельный рассчет на pcgamess

Сообщение lucky-ph » Пн дек 03, 2007 3:56 pm

Здравствуйте. Ситуация следующая: имеется двухъядерный компьютер и я хочу, чтобы pcgamess использовал во время рассчетов оба ядра. Подскажите пожалуйста какой софт нужно дополнительно установить (желательно со ссылками) и как изменить скрипт для запуска рассчета. Считать хотелось бы под windows. Откликнитесь если знаете что-нибудь по данной теме.

Аватара пользователя
Yu/2
Сообщения: 541
Зарегистрирован: Сб ноя 15, 2003 12:33 pm

Сообщение Yu/2 » Пн дек 03, 2007 4:38 pm

В readme все написано.

Rusia
Сообщения: 190
Зарегистрирован: Пн авг 06, 2007 9:35 pm

Сообщение Rusia » Ср янв 23, 2008 8:12 pm

Yu/2 писал(а):В readme все написано.
Я хотел бы узнать, где находится этот readme

eukar

Сообщение eukar » Ср янв 23, 2008 8:21 pm

{installation path}\readmes.zip?

Rusia
Сообщения: 190
Зарегистрирован: Пн авг 06, 2007 9:35 pm

Сообщение Rusia » Ср янв 23, 2008 9:05 pm

eukar писал(а):{installation path}\readmes.zip?
спасибо

Только всё равно расчёт идёт на 1 ядре из 4х, :cry: что не есть хорошо( я не знаю, сколько расчёт займёт времени, но если учесть, что это неэмпирика- то порядко часа-другого) у меня молекул не мало - штук под 30, и хотелось бы побыстрей, иначе буду вынужден разбить задачу на несколько машин на ночь. А так- только один компьютер будет занят.

вроде wmpi установил, дллку скопировал- так сначала вообще не работала программа, а с другой версией wmpi, работает на 1 ядре...

или мне кажется, что на 1 ядре- если посмотреть "кардиограмму" ядер-то "бются в тахикардии" 3 из 4, но процесс занимает по прежнему 25% ЦП...

Аватара пользователя
cynnamoyl
Сообщения: 793
Зарегистрирован: Вс дек 17, 2006 3:03 pm

Re: как запустить параллельный рассчет на pcgamess

Сообщение cynnamoyl » Ср янв 30, 2008 2:42 pm

lucky-ph писал(а):Здравствуйте. Ситуация следующая: имеется двухъядерный компьютер и я хочу, чтобы pcgamess использовал во время рассчетов оба ядра. Подскажите пожалуйста какой софт нужно дополнительно установить (желательно со ссылками) и как изменить скрипт для запуска рассчета. Считать хотелось бы под windows. Откликнитесь если знаете что-нибудь по данной теме.

Удобно пользоваться фронт-ендом PCGAm.
Успешно работает как и на мультипроцесорных системах, так и через локалку.

Сайт программы

Подробная инструкция настройки паралелей под WMPI

NB для мультиядерной системы наличие присутвия хотя бы raid 0, рекомендуется.
Ибо написано: живу Я, говорит Господь, предо Мною преклонится всякое колено, и всякий язык будет исповедывать Бога. Рим 14:11

Nik®
Сообщения: 92
Зарегистрирован: Пн апр 09, 2007 11:58 pm

Re: как запустить параллельный рассчет на pcgamess

Сообщение Nik® » Чт янв 31, 2008 11:54 am

Удобно пользоваться фронт-ендом PCGAm.
как вы могли, великий и могучий Nord разозлится и покарает вас за такие вот "рюшечки" :wink:

P.S. а можно узнать что рекомендуется лучше чем
хотя бы raid 0

Аватара пользователя
cynnamoyl
Сообщения: 793
Зарегистрирован: Вс дек 17, 2006 3:03 pm

Re: как запустить параллельный рассчет на pcgamess

Сообщение cynnamoyl » Чт янв 31, 2008 1:55 pm

Nik® писал(а): как вы могли, великий и могучий Nord разозлится и покарает вас за такие вот "рюшечки" :wink:
Какие рюшечки?
Nik® писал(а):P.S. а можно узнать что рекомендуется лучше чем
хотя бы raid 0
раид из 4*WD raptor XXXX, или какаято спец система(на скази или сас)

Или Gigabyte i-RAM ...или раид 0 на его основе :D
Ибо написано: живу Я, говорит Господь, предо Мною преклонится всякое колено, и всякий язык будет исповедывать Бога. Рим 14:11

Nik®
Сообщения: 92
Зарегистрирован: Пн апр 09, 2007 11:58 pm

Сообщение Nik® » Чт янв 31, 2008 4:02 pm

а что разве страйп на
4*WD raptor XXXX
не будет уже нулевым рэйдом ?

ай рам вещь конечно неплохая но как замена дисковой подсистемы не супер во всяком случае больших обьемов на ней пока не получить и дороговато ну и пропускная способность пи-си-айной шины 133 Мб/с не так уж и много
спец система(на скази или сас)
тоже будет рэйд 0(разговор больше про интерфейс)

Аватара пользователя
cynnamoyl
Сообщения: 793
Зарегистрирован: Вс дек 17, 2006 3:03 pm

Сообщение cynnamoyl » Чт янв 31, 2008 4:51 pm

Nik® писал(а):а что разве страйп на
4*WD raptor XXXX
не будет уже нулевым рэйдом ?

ай рам вещь конечно неплохая но как замена дисковой подсистемы не супер во всяком случае больших обьемов на ней пока не получить и дороговато ну и пропускная способность пи-си-айной шины 133 Мб/с не так уж и много
спец система(на скази или сас)
тоже будет рэйд 0(разговор больше про интерфейс)
Не цепляйтесь пожалуста к словам.

В первый раз имелся ввиду симпл раид на ширпотребных дисках.

133мб\с мало для пластинчастого диска? :lol:

а и-рам раид 0 дает до 200мб\с (и ето на домашней системе) - мало?

(И ето при том что Gigabyte i-RAM неиспользует шину PCI нначе как для питания) :lol:
Ибо написано: живу Я, говорит Господь, предо Мною преклонится всякое колено, и всякий язык будет исповедывать Бога. Рим 14:11

Rusia
Сообщения: 190
Зарегистрирован: Пн авг 06, 2007 9:35 pm

Re: как запустить параллельный рассчет на pcgamess

Сообщение Rusia » Пт фев 01, 2008 3:52 pm

cynnamoyl писал(а):
lucky-ph писал(а):Здравствуйте. Ситуация следующая: имеется двухъядерный компьютер и я хочу, чтобы pcgamess использовал во время рассчетов оба ядра. Подскажите пожалуйста какой софт нужно дополнительно установить (желательно со ссылками) и как изменить скрипт для запуска рассчета. Считать хотелось бы под windows. Откликнитесь если знаете что-нибудь по данной теме.

Удобно пользоваться фронт-ендом PCGAm.
Успешно работает как и на мультипроцесорных системах, так и через локалку.

Сайт программы



Подробная инструкция настройки паралелей под WMPI

NB для мультиядерной системы наличие присутвия хотя бы raid 0, рекомендуется.
Спасибо почитаю, если будут вопросы/неудачи опишу их крайне подробно.

Nik®
Сообщения: 92
Зарегистрирован: Пн апр 09, 2007 11:58 pm

Сообщение Nik® » Пт фев 01, 2008 5:54 pm

ну в начале я подумал может уже появился какой то другой
способ организации дисков в массиве быстрее чем raid 0, а я не в курсе :shock:

а потом конечно позанудствовал немного :oops:

а вот про ай рам я до сегодня был не в курсе что работает через саташный контроллер просто когда просматривал новости подумалось что
работает через шину и + гнездо для подключения сташного диска по типу
PCI -> SATA контроллера :?

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Сообщение EvgeniX » Сб фев 02, 2008 10:25 pm

Есть ещё вариант - хранить все данные в ОЗУ.
А ОЗУ можно распараллелить используя кластер.

С одной стороны дороговато, с другой применение нескольких компьютеров вполне сравнимо с быстрыми дисковыми массивами.

И нужно учитывать то, что расчёты, использующие слишком большие объёмы данных на диске (>~20-50 ГБ) не сильно эффективны (полезны).

Rusia
Сообщения: 190
Зарегистрирован: Пн авг 06, 2007 9:35 pm

Сообщение Rusia » Ср фев 06, 2008 7:04 pm

вот первая проблема- под вистой 64-битной не замускается WMPII, в процессах его не наблюдается, хотя его разрешил...

Придётся тогда тратить время для того, чтобы разобраться с линуксом.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 20 гостей