Проблема с геометрией
Проблема с геометрией
Патаюсь оптимизировать молекулу в PC Gamess, исходник:
$contrl exetyp=check runtyp=optimize icharg=-1 coord=zmtmpc nzvar=99 $end
$system memory=99000000 timlim=90000 $end
$basis gbasis=n21 ngauss=3 ndfunc=1 $end
$ZMAT AUTO=.t. DLC=.t. $end
$statpt nstep=2000 $end
$data
ligand2
C1
C 0.000000 0 0.000000 0 0.000000 0 0 0 0
C 1.945819 1 0.000000 0 0.000000 0 1 0 0
C 1.336990 1 117.318540 1 0.000000 0 2 1 0
N 1.461990 1 119.000000 1 3.036950 1 3 2 1
C 1.461990 1 123.998316 1 346.247435 1 4 3 2
C 1.336990 1 108.983484 1 22.220565 1 1 2 3
C 1.336990 1 111.000000 1 212.460886 1 5 4 3
C 1.502975 1 120.000000 1 147.145384 1 7 5 4
C 1.502975 1 120.000000 1 329.499164 1 8 7 5
C 1.502975 1 119.998760 1 142.551574 1 6 1 2
N 1.461990 1 111.000000 1 294.290769 1 7 5 4
C 1.461990 1 123.998068 1 235.486892 1 11 7 5
C 1.747363 1 100.059852 1 316.887745 1 12 11 7
C 1.336990 1 119.998760 1 150.072103 1 8 7 5
Cu 1.845993 1 124.998252 1 166.982731 1 4 3 2
O 1.809998 1 141.811048 1 1.134445 1 15 4 3
C 1.354996 1 109.500000 1 180.000000 1 16 15 4
C 1.419983 1 120.000000 1 120.000000 1 17 16 15
C 1.419983 1 120.000000 1 179.427061 1 18 17 16
C 1.419983 1 120.000000 1 0.000000 1 19 18 17
C 1.419930 1 120.000000 1 0.000001 1 20 19 18
C 1.419983 1 119.998760 1 299.427061 1 17 16 15
H 1.099991 1 128.356803 1 202.911475 1 1 2 3
H 1.099991 1 128.343432 1 202.869605 1 2 1 6
H 1.099991 1 120.498709 1 183.618526 1 3 2 1
H 1.099991 1 123.566946 1 270.280694 1 9 8 7
H 1.099991 1 118.196432 1 33.369828 1 10 6 1
H 1.099991 1 145.511630 1 137.884056 1 12 11 7
H 1.099991 1 134.387695 1 226.625726 1 13 12 11
H 1.099991 1 119.998760 1 179.427061 1 14 8 7
H 1.099991 1 119.998760 1 0.000000 1 18 17 16
H 1.099991 1 119.998760 1 180.572939 1 19 18 17
H 1.099991 1 119.998760 1 180.572939 1 20 19 18
H 1.099991 1 119.998139 1 180.572928 1 21 20 19
H 1.099991 1 119.998760 1 359.999993 1 22 17 16
$ end
В результате вылетает ошибка: **** ERROR READING VARIABLE BL CHECK COLUMN 4
$ end
....V....1....V....2....V....3....V....4....V....5....V....6....V....7....V....8
EXECUTION OF GAMESS TERMINATED ABNORMALLY AT 18:08:34 LT 11-NOV-2008
0 WORDS OF DYNAMIC MEMORY USED
В чем может быть причина ошибки?
$contrl exetyp=check runtyp=optimize icharg=-1 coord=zmtmpc nzvar=99 $end
$system memory=99000000 timlim=90000 $end
$basis gbasis=n21 ngauss=3 ndfunc=1 $end
$ZMAT AUTO=.t. DLC=.t. $end
$statpt nstep=2000 $end
$data
ligand2
C1
C 0.000000 0 0.000000 0 0.000000 0 0 0 0
C 1.945819 1 0.000000 0 0.000000 0 1 0 0
C 1.336990 1 117.318540 1 0.000000 0 2 1 0
N 1.461990 1 119.000000 1 3.036950 1 3 2 1
C 1.461990 1 123.998316 1 346.247435 1 4 3 2
C 1.336990 1 108.983484 1 22.220565 1 1 2 3
C 1.336990 1 111.000000 1 212.460886 1 5 4 3
C 1.502975 1 120.000000 1 147.145384 1 7 5 4
C 1.502975 1 120.000000 1 329.499164 1 8 7 5
C 1.502975 1 119.998760 1 142.551574 1 6 1 2
N 1.461990 1 111.000000 1 294.290769 1 7 5 4
C 1.461990 1 123.998068 1 235.486892 1 11 7 5
C 1.747363 1 100.059852 1 316.887745 1 12 11 7
C 1.336990 1 119.998760 1 150.072103 1 8 7 5
Cu 1.845993 1 124.998252 1 166.982731 1 4 3 2
O 1.809998 1 141.811048 1 1.134445 1 15 4 3
C 1.354996 1 109.500000 1 180.000000 1 16 15 4
C 1.419983 1 120.000000 1 120.000000 1 17 16 15
C 1.419983 1 120.000000 1 179.427061 1 18 17 16
C 1.419983 1 120.000000 1 0.000000 1 19 18 17
C 1.419930 1 120.000000 1 0.000001 1 20 19 18
C 1.419983 1 119.998760 1 299.427061 1 17 16 15
H 1.099991 1 128.356803 1 202.911475 1 1 2 3
H 1.099991 1 128.343432 1 202.869605 1 2 1 6
H 1.099991 1 120.498709 1 183.618526 1 3 2 1
H 1.099991 1 123.566946 1 270.280694 1 9 8 7
H 1.099991 1 118.196432 1 33.369828 1 10 6 1
H 1.099991 1 145.511630 1 137.884056 1 12 11 7
H 1.099991 1 134.387695 1 226.625726 1 13 12 11
H 1.099991 1 119.998760 1 179.427061 1 14 8 7
H 1.099991 1 119.998760 1 0.000000 1 18 17 16
H 1.099991 1 119.998760 1 180.572939 1 19 18 17
H 1.099991 1 119.998760 1 180.572939 1 20 19 18
H 1.099991 1 119.998139 1 180.572928 1 21 20 19
H 1.099991 1 119.998760 1 359.999993 1 22 17 16
$ end
В результате вылетает ошибка: **** ERROR READING VARIABLE BL CHECK COLUMN 4
$ end
....V....1....V....2....V....3....V....4....V....5....V....6....V....7....V....8
EXECUTION OF GAMESS TERMINATED ABNORMALLY AT 18:08:34 LT 11-NOV-2008
0 WORDS OF DYNAMIC MEMORY USED
В чем может быть причина ошибки?
Re: Проблема с геометрией
Попытайтесь ввести в декартовых координатах. Что-то с длиной связи.
Мультиплетность правильная?
Мультиплетность правильная?
После отстоя требуйте долива
Re: Проблема с геометрией
Перевод в декартовые координаты - также не помогает... вылетает таже ошибка... Мультиплетность=1
Re: Проблема с геометрией
Мультиплетность таки неправильная (или заряд). С зарядом 0 д.б. нормально.
Re: Проблема с геометрией
спасибо... попробую. А что, вообщем, означает эта ошибка "ERROR READING VARIABLE BL CHECK COLUMN 4
$ end
....V....1....V....2....V....3....V....4....V....5....V....6....V....7....V....8" ?
$ end
....V....1....V....2....V....3....V....4....V....5....V....6....V....7....V....8" ?
Re: Проблема с геометрией
Если опять вылетит (с правильным зарядом и мультиплетностью), откройте файл любым просмотрщиком и посмотрите длины связей, возможно, что-то стоит по умолчанию, с ограничением на длину. Если и это не поможет, все установки по умолчанию пишите в явном виде.
После отстоя требуйте долива
Re: Проблема с геометрией
А угол можно задавать как 359 градусов? Вроде где-то сталкивался, что нельзя больше 180 ставить...
А я вот паровоз поднимал... Но не поднял.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 17 гостей