Единицы

[tornado]

Здравствуйте.

Скажите пожалуйста, в out-файле Gaussian-a расстояния между атомами, например в молекуле азота N2, дается в ангстремах или борах?
В инпут файле я могу задавать как в ангстремах, так и в борах (смотря, что я пишу Units=AU или Units=Ang), а в самом out-файле в любом случае пишется:

Coordinates (Angstroms)
X Y Z
-----------------------------------
0.000000 0.000000 0.547169
0.000000 0.000000 -0.547169

Дело в том, что в моей практике приходится в ручную, без графических редакторов, с помощью математических пакетов типа MathCAd составлять HOMO молекулярную орбиталь (в случае N2 это 3SIG) в виде ЛКАО. И поэтому необходимо задавать межъядерное расстояние R. Когда я беру R в ангстремах, то вид HOMO получается совсем не такой как в графическом редакторе и самое главное нормировка не выполняется. Если же я беру R в борах, то и вид у HOMO надлежащий и нормировка в порядке. Иначе, хочу уточнить, действительно ли Gaussian в конце концов выдает геометрию молекулы в борах, несмотря на то, что везде он пишет ангстремы?

Спасибо заранее.

[VTur]

Итоговые значения - в ангстремах
Имеется в виду здесь.
1|1|UNPC-UNK|Freq|RB3LYP|6-311++G(3df,3pd)|C2H6|PCUSER|16-Dec-2002|0||
#N GEOM=ALLCHECK GUESS=TCHECK RB3LYP/6-311++G(3DF,3PD) FREQ||ЭтанOptFr
eq||0,1|C,0.,0.,-0.7636569128|C,0.,0.,0.7636569128| и т.д.

[tornado]

Действительно, все данные в out-файле вроде бы говорят о том, что межъядерное расстояние R выражается в ангстремах, но когда подставляешь в расчет R (при составлении МО), выраженное в ангстремах, то не получается нормировка, а когда подставляешь R, выраженное в борах, то все правильно. Я бы не задавал вопрос, если бы в out-файле данные представлялись бы в борах, но именно тот факт, что R пишется в ангстремах, а надо подставлять боры, дает сомнения и хочеться уточнить этот момент.
Кстати, логично, что если R выражено в ангстрамах, то почему энергия МО выражена в атомных единицах. Кажется должны бы была быть выражена в электрон-вольтах.

[VTur]

Атомная единица длины как раз бор. Все внутренние представления длинн в борах.

[tornado]

VTur спасибо.
Действительно, в итоге все единицы вроде бы атомные (и длины, и энергии). Но пишут то почему в ангстремах не понятно. Ладно бы писали, но и графические программы, используемые для отображения out-файлов Gaussian-а, также показывают длину в ангстремах.
Ну вроде бы все понятно, но вот эта неоднозначность сбивает.

[EvgeniX]

VTur спасибо.
Действительно, в итоге все единицы вроде бы атомные (и длины, и энергии). Но пишут то почему в ангстремах не понятно. Ладно бы писали, но и графические программы, используемые для отображения out-файлов Gaussian-а, также показывают длину в ангстремах.
Ну вроде бы все понятно, но вот эта неоднозначность сбивает.

Длины связей в декартовых координатах / зет-матрицах как раз в ангстремах.
Их графические программы и показывают.

[VTur]

Если не секрет, а зачем Вам форма орбитали?