Firefly проблема при счете на кластере

вопросы строения молекул и квантовой химии
avelon
Сообщения: 460
Зарегистрирован: Ср авг 12, 2009 5:09 pm

Re: Firefly проблема при счете на кластере

Сообщение avelon » Ср сен 29, 2010 1:15 pm

вам менеджер должен автоматически выделить доступные ноды или поставить задачу в очередь до освобождения нодов. в любом случае у вас проблема со списком выделенных нодов, он не формируется, может быть причина в ограничение числа нодов для данного пользователя. читайте мануал по рабе с менеджером либо лично решайте вопрос с админами на кластере

Olsha
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Пн сен 27, 2010 12:20 am

Re: Firefly проблема при счете на кластере

Сообщение Olsha » Ср сен 29, 2010 5:27 pm

avelon, спасибо! С помощью Вашего совета удалось запустить программу на двух узлах, правда в монопольном режиме - без менеджера.
Одна поправка только - чтобы запустить на 2-х узлах, нужно в строке "mpdboot --rsh=ssh -n 2 -f host" "2" заменить на "3". Вдруг кому пригодится..
Администраторы кластера сказали, что чтобы мои задачи можно было запускать через менеджер, нужно менять его глубинные настройки, и как минимум это означает перезапуск Cleo => остановку всех задач, которые сейчас запущены. Так что проще пока блокировать часть узлов и обходиться без менеджера :(

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 13 гостей