Общий вид такой:

Я составил и расчитал для одной части катиона геометрию в базисе 321 (знаю что маленький базис, но пока смысла считать в расширенном нету), но вот как вторую разместить не могу никак сообразить, кольца постоянно разрываются или получается какае то хрень.
Вот координаты:
Вообще в идеале это нужно для расчета такой системы:CARBON 6.0 -0.0907014702 -0.5587737571 1.6537833538
NITROGEN 7.0 -0.0380465406 -0.5541670899 2.9722198569
HYDROGEN 1.0 -0.8645101299 -0.6979471289 3.5158420949
HYDROGEN 1.0 0.8290876281 -0.4068147715 3.4471981807
NITROGEN 7.0 -1.2510580088 -0.7559910101 1.0305350468
NITROGEN 7.0 1.0161953652 -0.3662333509 0.9386125396
HYDROGEN 1.0 -1.2702484089 -0.7559384687 0.0297841453
HYDROGEN 1.0 0.9554969347 -0.3732273522 -0.0604585325
CARBON 6.0 -2.5019604426 -0.9731473821 1.7244061911
CARBON 6.0 2.3183876413 -0.1445871268 1.5289822712
CARBON 6.0 -3.3003962285 0.1103318304 2.0460164314
CARBON 6.0 3.1402011146 -1.2260135423 1.7935605672
CARBON 6.0 -2.8924981767 -2.2629496223 2.0386737673
CARBON 6.0 2.7323960730 1.1472772185 1.8020057531
CARBON 6.0 -4.5025178718 -0.1015703699 2.6973172992
CARBON 6.0 4.3903674905 -1.0098888140 2.3454356459
CARBON 6.0 -4.0957196405 -2.4684959332 2.6899800786
CARBON 6.0 3.9836585141 1.3570452367 2.3538507403
CARBON 6.0 -4.8985179188 -1.3890587891 3.0189908535
CARBON 6.0 4.8104215412 0.2797171696 2.6254070501
HYDROGEN 1.0 -2.9893698901 1.1012967029 1.7832970022
HYDROGEN 1.0 2.8094904153 -2.2187149855 1.5634843917
HYDROGEN 1.0 -2.2687196195 -3.0916024128 1.7703518596
HYDROGEN 1.0 2.0889918538 1.9742068860 1.5784362420
HYDROGEN 1.0 -5.1268436047 0.7318850364 2.9462082574
HYDROGEN 1.0 5.0327546213 -1.8417626380 2.5496309074
HYDROGEN 1.0 -4.4056964329 -3.4640621771 2.9331724921
HYDROGEN 1.0 4.3117616385 2.3542039682 2.5645593810
HYDROGEN 1.0 -5.8309288116 -1.5508492370 3.5203428468
HYDROGEN 1.0 5.7798032057 0.4447875307 3.0496399122
