Рассчёт вращения с разрывом связи

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение OrganikNV » Чт май 26, 2011 4:38 pm

Подскажите, пожалуйста, как расчитать вращение в PCGAMESS и учесть разрыв связи в переходном состоянии!
Может есть примеры?

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение sanya1024 » Чт май 26, 2011 10:36 pm

Единственный адекватный метод для моделирования разрыва связи -- CASSCF. Где-то я в форуме скидывала основополагающую статью Шмидта и Гордона (M.W. Schmidt, M.S. Gordon, Annu. Rev. Phys. Chem. 1998., 49, 233 -- поищите. Может быть, файл с названием mcscf-review.pdf.
Метод сложный, выбор активного пространства требует тщательности -- от него все зависит. Тут уже есть обсуждение похожей проблемы.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Ferom
Сообщения: 1049
Зарегистрирован: Чт дек 16, 2010 11:43 am

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение Ferom » Пт май 27, 2011 12:43 am

Или сделать скан по двум координатам. Для начала в каком-нибудь простом методе.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2046
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение amge » Пт май 27, 2011 6:04 am

OrganikNV писал(а):Подскажите, пожалуйста, как расчитать вращение в PCGAMESS и учесть разрыв связи в переходном состоянии!
Может есть примеры?
Все сильно зависит от конкретной системы. Если в ней 10 атомов, то Вам посоветуют одно, а если 100 - то, вероятно, нечто другое. Если разрыв связи происходит в результате перегруппировки (с образованием новой) - это одна ситуация, а если образуется бирадикал (или два радикала) - то совсем другая.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение VTur » Пт май 27, 2011 10:28 am

Наиболее простой путь - изначально считать SCFTYP=UHF
Разрыв связи - это переход от двойной к одинарной или полностью между атомами? В первом случае совет поможет. Во втором может разорвать в другом месте, где слабее.
После отстоя требуйте долива

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение OrganikNV » Пт май 27, 2011 2:15 pm

В молекуле одна двойная связь. Предположительно происходит разрыв с образованием бирадикала (гомолитический) или с образованием катиона и аниона (внутренней соли). Количество атомов разное примерно от 5 до 40.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение VTur » Пт май 27, 2011 5:11 pm

А рвёться то что?
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение sanya1024 » Пт май 27, 2011 6:33 pm

Это не DFT-шная и не хартри-фоковская задача. И даже не coupled-cluster (пока нет multireference реализации CC, но даже если будет -- это будет ооооочень дорого). Это типичный CASSCF. А если еще нужно учесть возможность гетеролитического разрыва -- то точно CASSCF. Только в усреднение по состояниям придется включить гораздо больше состояний (этот гетеролитический разрыв еще поймать надо). От размера системы это не зависит, бирадикал есть бирадикал. В CAS спокойно влезают системы до 1000 орбиталей при умеренных акт. пространствах.

В общем, OrganikNV, Вы попали :) Изучайте тему по ссылке, действуйте и рассказывайте нам об успехах и проблемах. А мы поможем, если что :)
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение OrganikNV » Пт май 27, 2011 10:03 pm

В системе рвётся одна двойная связь и образуется одинарная.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение sanya1024 » Сб май 28, 2011 1:57 am

Так совсем непонятно. Двойная связь рвется -- где? одинарная образуется -- где? на месте двойной или где-то в другом месте? или это все-таки скручивание двойной связи, когда при угле ~90 град образуется бирадикал?

В любом случае, без CASSCF разрывы связей описываются неправильно уже на качественном уровне.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение OrganikNV » Сб май 28, 2011 11:44 am

Да, это случай, когда при угле 90 образуется бирадикал.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Рассчёт вращения с разрывом связи

Сообщение sanya1024 » Сб май 28, 2011 2:20 pm

Точно CASSCF. Плясать надо от включения в акт. пространство 2 верхних занятых и 2 нижних вакантных орбиталей и усреднения по основному состоянию + 2 возб. синглета (и еще + 2 нижних триплета). Если Вы уже посмотрели тему по ссылке, то должны понять, о чем речь.

Я на всякий случаю приложила статью, о к-рой выше шла речь.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 11 гостей