Прога для иллюстрации реакций

[Darth Vasya]

Всё ж таки покадрово руками делать скриншоты и потом склеивать их в гифку - дело довольно муторное, особенно, если гладких переходов между конфигурациями хочется. Если уж есть набор геометрий, лучше всего использовать специально для этого написанный софт (то же VMD или хотя бы Molekel).

[ЕЖ]

Darth Vasya, Леонид, спасибо!

amge, очень интересно! именно это я и ищу! пли-из!

[amge]

Всё ж таки покадрово руками делать скриншоты и потом склеивать их в гифку - дело довольно муторное, особенно, если гладких переходов между конфигурациями хочется.

Это то как раз довольно быстро (гораздо больше времени уходит на получение "правильного" набора геометрий). Я делаю так:
- Открываю набор геометрий (штук 50-150) в molden'е.
- Проигрывая этот набор (кнопочка Movie) и вращая молекулу, подбираю подходящий ракурс.
- Нажимаю кнопку с фотоаппаратом и затем Movie. Получается набор гифов, по одному на каждую геометрию.
- Склеиваю полученные гифы в динамический гиф. Эту операцию можно делать с помощью ImageMagick (win, linux, нужно много памяти), gifsircle (linux), GIF Movie Gear (win, платная, но очень удобная), ...
Можно сделать и avi (например, GIF Movie Gear умеет), но динамический гиф мне больше нравится (его и все браузеры понимают, и в презентацию можно вставить).

Если уж есть набор геометрий, лучше всего использовать специально для этого написанный софт (то же VMD или хотя бы Molekel).

Слышал про такое, но никогда не пользовался. Пожалуйста, если можно, расскажите подробнее...

[Marxist]

Если уж есть набор геометрий, лучше всего использовать специально для этого написанный софт (то же VMD или хотя бы Molekel).

Слышал про такое, но никогда не пользовался. Пожалуйста, если можно, расскажите подробнее...

Ну а что, там сразу открываете траекторию и он рендерит Вам хоть мувик, хоть гиф. Средств для рендеринга там завались, причём для качественного рендеринга. Точно так же выбираете удобную визуализацию и ракурс. Ещё там огромные возможности по расширению.
Да, я про VMD говорю...

[Darth Vasya]

+ возможно сглаживание, произвольное вращение камеры/масштабирование и т.д. Если изучить скриптовый язык VMD (TCL), можно самые невероятные мультики делать, но отрендерить плавную анимацию можно и без него.

А молден всё-таки уродливый достаточно, на мой художественный вкус.

[amge]

... А молден всё-таки уродливый достаточно, на мой художественный вкус.

С этим трудно не согласиться. Интерфейс у молдена просто безобразный, надо очень захотеть, чтобы начать им пользоваться. Но многое умеет. Для меня главное, из того, что он умеет -- это подписывать атомы расчетными хим. сдвигами и некоторая совместимость с "Природой", в частности, рисовать посчитанные ею ИК-спектры.

Кстати, если у Вас есть красивые химические мультики и заинтересованность, я с удовольствием размещу их на нашем сайте (со всеми необходимыми ссылками, разумеется).

[EvgeniX]

Я бы тоже мультики на нашем сайте разместил (аналогично amge)

[ЕЖ]

Спасибо большое всем! Я после отпуска вернусь и, если коллеги не возражают, еще поспрашиваю и, чую, вопросов будет много

[amge]

Я бы тоже мультики на нашем сайте разместил

EvgeniX, если Вам это интересно, то я совсем не возражаю, если мои мультики будут продублированы на Вашем сайте (с любыми видоизменениями либо без них) -- IMHO, всякая популяризация расчетной химии полезна.