internal rotation

[amge]

Do you know the option in Priroda allowing you to find a TS in the way you have described above? Does it work for fairly big systems? Have you tried?

Это есть (и как-то работает) в Природе-9. В 6-й версии, похоже, не работает. Инпут-файл примерно такой:

Код: Выделить всё

$system mem=256 path=. disk=1 $end
$control
 task=saddle
 basis=/usr/local/lib/priroda/basis/L1
$end
$molecule
 cartesian
 7    0.00000000   0.00000000   0.00000000
 1    1.02745321   0.00000000   0.00000000
 1   -0.25084982   0.99634785   0.00000000
 1   -0.25061944  -0.32182112  -0.94302394
$end
$molecule
 cartesian
 7    0.00000000   0.00000000   0.00000000
 1    1.02745321   0.00000000   0.00000000
 1   -0.25084982   0.99634785   0.00000000
 1   -0.25061944  -0.32182112   0.94302394
$end

В этом простейшем случае (инверсия аммиака) получается почти плоская геометрия (т.е. результат похож на правду). Ничего более сложного я не пробовал.

[YuraM]

По теме.
Есть неплохая прграмма которая может посчитать что-то интересное, в частности влияние внутреннего вращения на термодинамику

http://ichem.unn.ru/Moltran/

[annulen]

Доброго времени суток!
Рассчитать барьер вращения очень просто. Используйте для этого программу PC Gamess, она бесплатна и доступна для скачивания на сайте http://classic.chem.msu.su/gran/gamess/index.html.
Чтобы рассчитать барьер, используйте опцию RUNTYPE=RSURFACE (подробности здесь: http://classic.chem.msu.su/gran/gamess/index.html)
Для расчета термодинамических свойств по рассчитанному барьеру используйте бесплатную программу OpenThermo (http://openthermo.sourceforge.net)