Gaussian vs Dalton
Gaussian vs Dalton
Расчитывая одну и туже оптимизированною по геометрии молекулу в этих программах на одном уровне расчета (GIAO/HF/6-311+G*)обнаружил различающиеся результаты (0,5%). Различия в базисах или алгоритмах расчета? Как правильно описать эту ситуацию при написании статьи?
-
Darth Vasya
- Сообщения: 426
- Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm
Re: Gaussian vs Dalton
"Agreement to within 0.5%"
А от чего проценты?
Плохо зная грамматику, сложные конструкции должны употребляться с осторожностью.
Re: Gaussian vs Dalton
это относительная оценка различия результатов расчета из разных программ, это несильно важно. Важно то, что они существенно различаются и ими нельзя одинаково пользоваться.Darth Vasya писал(а):"Agreement to within 0.5%"А от чего проценты?
Пытаюсь понять почему это различие вообще появилось. Можт базисы 6-311+Г* различаются в этих программах?
-
Darth Vasya
- Сообщения: 426
- Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm
Re: Gaussian vs Dalton
Что именно различается-то? 0.5% чего? Одно дело - длины связей, другое - какой-нибудь там дипольный момент. Различие в 0.5% точно существенное?
А различаться результаты могут по сотням причин: различные входные параметры расчёта (критерии сходимости оптимизации электронной структуры/геометрии и т.д.), различные алгоритмы (численное интегрирование, линейная алгебра и т.д.), детали реализации (a+b не всегда равно b+a и т.д.) - всё что угодно. Так что уточните, пожалуйста, что именно у вас не совпало, лучше прямо с числами и входными файлами. Как говорится, местные телепаты сейчас все в отпуске
Кстати, опыт показывает, что результаты, полученные в гауссиане, порой оказываются откровенным мусором...
А различаться результаты могут по сотням причин: различные входные параметры расчёта (критерии сходимости оптимизации электронной структуры/геометрии и т.д.), различные алгоритмы (численное интегрирование, линейная алгебра и т.д.), детали реализации (a+b не всегда равно b+a и т.д.) - всё что угодно. Так что уточните, пожалуйста, что именно у вас не совпало, лучше прямо с числами и входными файлами. Как говорится, местные телепаты сейчас все в отпуске
Кстати, опыт показывает, что результаты, полученные в гауссиане, порой оказываются откровенным мусором...
Плохо зная грамматику, сложные конструкции должны употребляться с осторожностью.
Re: Gaussian vs Dalton
Ага, существенное различие! В расчет запускаю одинаковую структуру заранее оптимизированнуюDarth Vasya писал(а):... Различие в 0.5% точно существенное? ...
сторонним методом. Заказываю один и тотже уровень расчета. Попозже постараюсь что-нть конкретное показать, сейчас нет возможности.
Re: Gaussian vs Dalton
От Вас спрашивают, во-первых, условия сходимости итерационных процедур. Во-вторых, величины отсечек интегралов. В разных программах они разные. Базисы, по определению, одинаковы.
После отстоя требуйте долива
Re: Gaussian vs Dalton
Не всегда. Тут тоже возможно различие в некоторых случаях. Например, используются сферические гармоники или нет.VTur писал(а): Базисы, по определению, одинаковы.
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."
Re: Gaussian vs Dalton
Это да, но при этом измениться количество базисных функций. И поэтому в декартовых функциях энергия, обычно, ниже.Lantano писал(а):Не всегда. Тут тоже возможно различие в некоторых случаях. Например, используются сферические гармоники или нет.VTur писал(а): Базисы, по определению, одинаковы.
После отстоя требуйте долива
Re: Gaussian vs Dalton
Спасибо за подсказку, где искать. В итоге, различия оказались гораздо выше, чем писал раньше. Считаю по дефолту для реда соединений.VTur писал(а):От Вас спрашивают, во-первых, условия сходимости итерационных процедур. Во-вторых, величины отсечек интегралов. В разных программах они разные. Базисы, по определению, одинаковы.
Вот к примеру, GIAO/DFT/b3lyp/6-311+G*. Строю зависимость эксперимент/теория. Получаю в случае Дальтона наклон 1.27, R^2=0.89, а в случае Гауссиана наклон 0.85, R^2=0.64
Re: Gaussian vs Dalton
Если Вы считаете хим. сдвиги, то результаты, мягко говоря, не очень хорошие. У меня типичные значения: наклон 1.04 для Н, 1.01 для С; R^2 0.998 ("Природа", DFT/PBE/L2). Не исключено, что выбранные Вами фунуционал/базис не годятся для этой задачи. Не знаю как в гауссиане, но в дальтоне для расчета констант магнитного экранирования есть специализированные базисы (IGLO II, III, IV) и функционалы (KT1, KT2, KT3). Попробуйте их.radius писал(а):Вот к примеру, GIAO/DFT/b3lyp/6-311+G*. Строю зависимость эксперимент/теория. Получаю в случае Дальтона наклон 1.27, R^2=0.89, а в случае Гауссиана наклон 0.85, R^2=0.64
Re: Gaussian vs Dalton
Ага, неочень-то подходит DFT/b3lyp/6-311+G*, это лишь для примера насколько програмы дают различное значение.amge писал(а):...Не исключено, что выбранные Вами фунуционал/базис не годятся для этой задачи...
А считаю химсдвиги для фтора. Спасибо за совет! Сегодня же попробую эти функционалы.
Re: Gaussian vs Dalton
Думаю, что хим. сдвигов фтора нужен особый подход. Я особо не разбирался, но могу сказать, что обычные методы, превосходно работающие для С и Н, на фторе давали неудовлетворительные результаты. Советую сначала почитать, как рекомендуют считать хим. сдвиги фтора.
Re: Gaussian vs Dalton
да, есть несколько статей, в которых авторы получают очень хорошие результаты на своих модельных соединениях, но уже на моих объектах их уровень расчета дает плохой результат. Остается самому перебирать, что получше. Кстати, есть подозрение, что причина вовсе не во фторе, а в N, O, Cl, Br, которые тоже есть в моих соединениях.amge писал(а):... Советую сначала почитать, как рекомендуют считать хим. сдвиги фтора.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 20 гостей