BSSE и Gamess (US)

[David Beckham]

Господа! Подскажите пожалуйста чайнику, можно ли рассчитать BSSE в Gamess (US), насколько я знаю в Gaussian'е есть такая процедура, а вот в Gamess не знаю. Если не трудно, приведите пожалуйста пример в виде input-файла (например для димера воды).

[VTur]

На хрена это вообще надо? Ошибка корреляции всё покрывает.

[EvgeniX]

При достаточно большом базисе, ошибка BSSE крайне мала.

[Darth Vasya]

Размерность базиса и BSSE - немного разные оперы. Например, в базисе плоских волн даже при одной базисной функции BSSE нулевая А в атом-центрированных базисах ненулевая, но тоже мало зависит от размерности.

[David Beckham]

Еще несколько вопросов от чайника. Wingamess и Gamess US это одно и тоже или нет? Это правда, что Wingamess не может использовать больше одного ядра в расчетах? А вообще я бы с радостью использовал PC Gamess, да вот возникли проблемы с EFP. Input-file одинакового содержания был запущен в PC Gamess и Wingamess:
$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=OPTIMIZE DFTTYP=B3LYP MAXIT=100 ICHARG=-1 MULT=1 COORD=CART $END
$SYSTEM TIMLIM=525600 MEMORY=1000000 $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 NFFUNC=1 DIFFSP=.TRUE. DIFFS=.TRUE. $END
$SCF DIRSCF=.TRUE. $END
$STATPT OPTTOL=0.0001 NSTEP=20 $END
$DATA
Title
C1
S 16.0 -0.21651 -0.22517 0.00000
O 8.0 0.79792 0.30652 -0.93657
O 8.0 -0.45259 0.57572 1.28352
O 8.0 -1.74729 -0.31173 -0.86418
O 8.0 0.27553 -1.85069 0.46170
H 1.0 0.33850 -1.91728 1.55788
$END
$EFRAG
COORD=CART
FRAGNAME=H2ODFT
O1 -3.19487 0.51133 -1.88848
H2 -3.61512 -0.33382 -1.88848
H3 -2.45399 0.44589 -1.30737
$END

Так вот в случае Wingamess проблем никаких, а вот в случае PC Gamess возникает вот такая ошибка:
(фрагмент *.out):
READING $EFRAG GROUP
COORD=CART POSITION=OPTIMIZE POLMETHD=FRGSCF
READING COORDINATES OF FRAGMENT 1 NAMED H2ODFT
1 FRAGMENTS ARE USED IN THIS CALCULATION

SEARCHING FOR FRAGMENT $H2ODFT
$H2ODFTNOT FOUND, PLEASE CHECK FOR ERRORS

В чем здесь фишка? Объясните чайнику пожалуйста.

[lucky-ph]

Советую почитать мануалы по PCGAMESS и GAMESS (мануал последней версии PCGAMESS очень сильно отличается от того, что раньше содержалось в архиве с пакетом). Если Вам так необходимо использовать GAMESS на нескольких процессорах - переходите на линукс. GAMESS там отлично компилируется из исходников и запускается в параллельном режиме без проблем. А про высокопроизводительные вычисления под Windows уже давно все забыли .

[David Beckham]

Спасибо. На самом деле так будет лучше. Посоветуйте пожалуйста какой дистрибутив linux лучше всего подойдет.

[lucky-ph]

Лично я использую Fedora.

[YuraM]

да, Fedora is the best!

[amge]

Традиционный совет: лучший дистрибутив тот, который использует хороший знакомый гуру. А если такого знакомого нет, то, по большому счету, всё равно: Fedora, Ubuntu, OpenSuse.
Замечу только, что изрядная пропатченность внутренностей linux в некоторых дистрибутивах (в той же Федоре) может вылиться в проблемы при сборке программ или при использовании не полностью статических бинарников.

[Nelepostb]

Подскажите пожалуйста как в Gamess посчитать BSSE для отдельной связи? Например, в молекуле Н2О?

[sanya1024]

Повторю свой ответ. BSSE для отдельной связи -- совершенно искусственная конструкция, особого смысла не имеет. Пошаговый процесс я описала тут: http://www.qchem.ru/f/kvantovo-khimiche ... bo-analiz/