Визуализация выходных файлов ORCA

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Kirchern
Сообщения: 76
Зарегистрирован: Ср янв 16, 2008 9:56 am

Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение Kirchern » Ср фев 24, 2010 6:18 am

Подскажите, как можно посмотреть шаги и изменения энергии при оптимизации геометрии в программе ORCA, в мануале написано, что можно с помощью Molekel, однако как это сделать для меня не понятно.

o-oxhem
Сообщения: 425
Зарегистрирован: Вт июл 08, 2008 10:33 pm

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение o-oxhem » Ср фев 24, 2010 1:23 pm

Рекомендую ChemCraft или gMolden. Возможно
QMForge Version 2.1 (10/25/07)
* Name change to QMForge
* ORCA support
* Switch to supporting numpy 1.0.2 and openbabel 2.1.1

Kirchern
Сообщения: 76
Зарегистрирован: Ср янв 16, 2008 9:56 am

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение Kirchern » Чт фев 25, 2010 6:17 am

В том и проблема, что просто так ни ChemCraft ни gMolden их не открывают, возможно нужна предварительная перекодировка?
QMForge сейчас попробую

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение amge » Чт фев 25, 2010 8:04 am

molden (у меня) открывает. Специально проверил.
molden 4.7, ORCA 2.6, linux

Вспоминаю, вроде действительно молдену на виндах нужна перекодировка s/\r\n/\n/

alxyppv
Сообщения: 560
Зарегистрирован: Сб апр 07, 2007 11:23 am

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение alxyppv » Чт фев 25, 2010 11:30 am

Kirchern писал(а):В том и проблема, что просто так ни ChemCraft ни gMolden их не открывают, возможно нужна предварительная перекодировка?
QMForge сейчас попробую
Chemcarft (version 1.6 build 315) открывал предпоследнюю версию Орки (2.6.35), но самую последнюю (2.7) уже нет. Видимо надо писать разработчикам Chemcrafta, они достаточно оперативны. Ну и если Вам не принципиально, какая версия Орки, то можно перейти на 2.6.35...
А.П.

kbob
Сообщения: 2008
Зарегистрирован: Сб окт 17, 2009 9:48 am

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение kbob » Сб янв 19, 2013 7:06 pm

Kirchern писал(а):Подскажите, как можно посмотреть шаги и изменения энергии при оптимизации геометрии в программе ORCA, в мануале написано, что можно с помощью Molekel, однако как это сделать для меня не понятно.
А скачать/установить Molekel удалось? В какой операционной системе работаете?
http://molekel.cscs.ch/wiki/pmwiki.php/ ... loadBinary
Последний раз редактировалось kbob Вс янв 20, 2013 3:00 pm, всего редактировалось 1 раз.
If you are not part of the solution, you are part of the precipitate.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение sanya1024 » Сб янв 19, 2013 11:30 pm

ChemCraft давно нормально работает с Оркой
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

kbob
Сообщения: 2008
Зарегистрирован: Сб окт 17, 2009 9:48 am

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение kbob » Вс янв 20, 2013 8:24 am

У меня в Kubuntu Linux и Molekel заработал.
If you are not part of the solution, you are part of the precipitate.

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение EvgeniX » Вс янв 20, 2013 12:02 pm

ChemCraft в Linux тоже нормально работает. За исключение того, что нет нескольких функций, которые есть в Windows версии. Например, нет создания анимации.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Визуализация выходных файлов ORCA

Сообщение Shorku » Вс янв 20, 2013 5:23 pm

EvgeniX писал(а):ChemCraft в Linux тоже нормально работает. За исключение того, что нет нескольких функций, которые есть в Windows версии. Например, нет создания анимации.
под линуксом и виндовая версия работает сносно, притормаживает только иногда.
Make quantum chemistry, not war

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Bing [Bot] и 3 гостя