Проблема в создании входного файла Гауссиан
Проблема в создании входного файла Гауссиан
Уважаемые форумчане, здравствуйте!
Мне нужно посчитать поверхность потенциальной энергии в программе Гауссиан.
Но я не знаю, как мне задать входной файл. Я просто этого не умею, и нет человека который мог бы мне помоч! Все исследование встало из-за этого:( Мне нужен только один пример показать на моей частице и я все пойму!
Спасибо.
Мне нужно посчитать поверхность потенциальной энергии в программе Гауссиан.
Но я не знаю, как мне задать входной файл. Я просто этого не умею, и нет человека который мог бы мне помоч! Все исследование встало из-за этого:( Мне нужен только один пример показать на моей частице и я все пойму!
Спасибо.
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Частицу в студию.
и какое именно сечение ППЭ Вам нужно? Что сканировать-то?
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
o-oxhem, спасибо, что откликнулись!
Мне, нужно сканировать поверхность потенциальной энергии относительно изменения связи Zn - O
Мне, нужно сканировать поверхность потенциальной энергии относительно изменения связи Zn - O
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Приложено. Комментарии в файле перед применением следует удалить.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Спасибо огромное за помошь!
Там происходит сближени?
Там происходит сближени?
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Нет, это увеличение расстояния. (а если наоборот смотреть - от конца к началу расчета, то сближение)
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Понятно.
Спасибо!
Спасибо!
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Расчет не получается, ошибка!
И как записать, чтобы было сближение?
И как записать, чтобы было сближение?
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Загадка. У меня получается.
Отрицательное приращение не предусмотрено.
Отрицательное приращение не предусмотрено.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
-
АлександрI
- Сообщения: 378
- Зарегистрирован: Ср мар 23, 2011 5:09 pm
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
На самом деле связь О-Zn координационная (электроны кислорода - на d-орбитали Zn). Её длина - константа, определяемая природой этой пары атомов (читайте теорию кристаллического поля).
А суть процесса - в конкуренции атома азота с карбоксильным кислородом за протон: в Ваших условиях азот постепенно приближает к себе протон (усиление связи) и ослабление связи азот-Zn. Этот процесс Вам и надо изучать квантовохимически.
Такие процессы сплошь и рядом в химии комплексных соединений. Неужели у Вас вблизи нет химика, который бы указал бы Вам на очевидное заблуждение?
А суть процесса - в конкуренции атома азота с карбоксильным кислородом за протон: в Ваших условиях азот постепенно приближает к себе протон (усиление связи) и ослабление связи азот-Zn. Этот процесс Вам и надо изучать квантовохимически.
Такие процессы сплошь и рядом в химии комплексных соединений. Неужели у Вас вблизи нет химика, который бы указал бы Вам на очевидное заблуждение?
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
o-oxhem, спасибо, все получилось!
А как задать, так, чтобы азот приближал к себе протон (усиливалась связь), а связь N--Zn ослабевала?
Спасибо!
А как задать, так, чтобы азот приближал к себе протон (усиливалась связь), а связь N--Zn ослабевала?
Спасибо!
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
попробуйте так.
В постах желательно, чтобы Вы указывали номера атомов.
"Усиливается/ослаблется" - при пострении файла имеет смысл оперировать чисто геометрическими терминами (увел./умен. расстояние). Усиление/ослабление - это уже после расчета энергии.
В постах желательно, чтобы Вы указывали номера атомов.
"Усиливается/ослаблется" - при пострении файла имеет смысл оперировать чисто геометрическими терминами (увел./умен. расстояние). Усиление/ослабление - это уже после расчета энергии.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Между атомам 5 и атомом 64 увеличивается расстояние, а между атомом 64 и атомом 2 уменьшается расстояние!
o-oxhem, если Вас не затруднит сделайте, пожалуйста, такой входной файл, только с такими же комментариями, что и в первый раз! Они очень понятны!
Спасибо!
o-oxhem, если Вас не затруднит сделайте, пожалуйста, такой входной файл, только с такими же комментариями, что и в первый раз! Они очень понятны!
Спасибо!
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Нужно уточнение:AlexKsen писал(а):Между атомам 5 и атомом 64 увеличивается расстояние, а между атомом 64 и атомом 2 уменьшается расстояние!
Это результат расчета? Или именно это хотелось бы увидеть?
Попробуйте так.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Для построения поверхности потенциальной энергии лучше b01 не использовать: когда нарушаются условия замыкания цикла, он иногда глючит.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.
Re: Проблема в создании входного файла Гауссиан
Спасибо Всем за ответы!
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 69 гостей