Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить

Какой графический стиль вы бы предпочли?

Белый фон, жёлтые атомы углерода (как было раньше)
12
27%
Белый фон, розовые атомы углерода
1
2%
Белый фон, серые атомы углерода
13
30%
Чёрный фон, желтые атомы углерода
6
14%
Чёрный фон, розовые атомы углерода (как стало сейчас)
3
7%
Чёрный фон, серые атомы углерода
6
14%
Всё равно
3
7%
Другое
0
Голосов нет
 
Всего голосов: 44

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 736
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Vit Nhoc » Чт апр 18, 2019 11:49 pm

alexp51
Насчёт счёт-фактуры не совсем ясно.
Если вы будете заказывать программу через Bluesnap, вы сможете скачать с сайта и распечатать Proforma Invoice, потом Final Invoice. Я боюсь, у вас в Беларуси это не одобрят уже потому, что написано там всё не по русски а на языке мировой буржуазии)

alexp51
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Пт янв 01, 2016 2:51 am

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение alexp51 » Пт апр 19, 2019 1:02 am

То есть от российской фирмы или индивидуального (частного ) предпринимателя вы выставить инвойс не можете? На языке русской буржуазии? Если нет то мы попросим наших коллоборантов находящихся в стане мировой буржуазии чтобы они проплатили через Bluesnap . Такой вариант будет нормальным?

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 736
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Vit Nhoc » Пт апр 19, 2019 2:51 am

alexp51 писал(а):
Пт апр 19, 2019 1:02 am
То есть от российской фирмы или индивидуального (частного ) предпринимателя вы выставить инвойс не можете? На языке русской буржуазии? Если нет то мы попросим наших коллоборантов находящихся в стане мировой буржуазии чтобы они проплатили через Bluesnap . Такой вариант будет нормальным?
Да, последний вариант мне видится единственным. В России сейчас нет продажи Chemcraft через какую-либо фирму.
Или пишите комментарии к моим блогам, как я писал выше. Ещё можно принять участие в работе моей группе Вконтакте, посвящённой обмену музыкой:

https://vk.com/club165849379

alexp51
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Пт янв 01, 2016 2:51 am

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение alexp51 » Пт апр 19, 2019 1:22 pm

OK! Спасибо, будем пробовать, если что не получится - сообщу.
А по поводу блогов - обязательно буду посещать в любом случае.
Ежели чего умное в голову придет - прокомментирую.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 12150
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Гесс » Пн май 20, 2019 12:32 pm

Ниже прилагается гауссиановский файл с периодическими векторами, картинки его в гаусвью и в кемкрафте. Кемкрафт однозначно неправильно идентифицирует последний вектор, делая его ортогональным первым двум и давая в роли его длины длину по оси z.
Если же переделать гауссиановский файл в POSCAR VASPa то вектор уже идентифицируется корректно. Build 548
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

alexp51
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Пт янв 01, 2016 2:51 am

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение alexp51 » Ср май 29, 2019 11:59 pm

alexp51 писал(а):
Пт апр 19, 2019 1:22 pm
OK! Спасибо, будем пробовать, если что не получится - сообщу.
А по поводу блогов - обязательно буду посещать в любом случае.
Ежели чего умное в голову придет - прокомментирую.
Здравствуйте ! Скажите пожалуйста , а в течение какого срока мы получим пароль после платежа? Дело в том что мы из Минска перевели деньги на BLUESNAP 28.05.2019 , но пока не получили никакого ответа. Может быть для подтверждения платежа мне сбросить Вам в личку или на почту скан платежного поручения? Или это лишнее?

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 736
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Vit Nhoc » Чт май 30, 2019 9:04 pm

alexp51 писал(а):
Ср май 29, 2019 11:59 pm
alexp51 писал(а):
Пт апр 19, 2019 1:22 pm
OK! Спасибо, будем пробовать, если что не получится - сообщу.
А по поводу блогов - обязательно буду посещать в любом случае.
Ежели чего умное в голову придет - прокомментирую.
Здравствуйте ! Скажите пожалуйста , а в течение какого срока мы получим пароль после платежа? Дело в том что мы из Минска перевели деньги на BLUESNAP 28.05.2019 , но пока не получили никакого ответа. Может быть для подтверждения платежа мне сбросить Вам в личку или на почту скан платежного поручения? Или это лишнее?
Давайте если завтра (в пятницу), от Bluesnap ничего не придёт, вы напишете мне email (см. сайт программы) и буду разбираться.
Я боюсь, опять у них какая-то проблема.
А ещё я сейчас часто бываю по несколько дней далеко от дома, и мне сложно читать почту, так что могу тормозить с ответом.

alexp51
Сообщения: 33
Зарегистрирован: Пт янв 01, 2016 2:51 am

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение alexp51 » Пт май 31, 2019 12:19 pm

Спасибо большое! Все получили!

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1005
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Shorku » Чт июн 27, 2019 5:40 pm

Chemcraft последней версии некорректно открывает лог ORCA с оптимизацией связанными кластерами
Мы не любим успокоительные иллюзии и сказки на ночь.Мы любим газовые атаки и механические марши железных солдат.Однажды,когда после ежедневной предательской работы на этот мир вы ляжете в свои мягкие кроватки,мы пожелаем вам страшной ночи и атомной войны.

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 736
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Vit Nhoc » Чт июн 27, 2019 9:14 pm

Shorku писал(а):
Чт июн 27, 2019 5:40 pm
Chemcraft последней версии некорректно открывает лог ORCA с оптимизацией связанными кластерами
Пришлите эти файлы ORCA сюда, пожалуйста (на email):

https://www.chemcraftprog.com/contacts.html

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 12150
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Гесс » Ср июл 10, 2019 3:49 pm

Chemcraft некорректно отображает неортогональные cube файлы (генерируются например скриптом chg2cube.pl).
VMD отображает корректно.
Ничего малого размера у меня под рукой нет, имеющиеся 80+Мб файлы на почту не пролезут.
Неортогональность прописана в начале куба в строках начинающихся с 140, 100 и 420
CUBE FILE CONVERTED FROM VASP format
OUTTER LOOP: X, MIDDLE LOOP: Y, INNER LOOP: Z
200 0.000000 0.000000 0.000000
140 0.170996 0.000000 0.000000
100 -0.027492 0.177705 0.000000
420 -0.024645 -0.001107 0.172921
21 0.000000 5.789021 2.707338 36.163699
21 0.000000 17.933964 7.188703 30.111723

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 736
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Vit Nhoc » Ср июл 10, 2019 5:02 pm

Тут вопрос, насколько вообще нужны эти неортогональные файлы. Мне придётся довольно много кодить чтобы их поддерживать, поскольку изоповерхности на данный момент строятся по сугубо декартовой, если можно так сказать, сетке (ортогональной).

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1477
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение surius » Вт окт 15, 2019 10:38 am

Shorku писал(а):
Чт июн 27, 2019 5:40 pm
Chemcraft последней версии некорректно открывает лог ORCA с оптимизацией связанными кластерами
У меня даже оптимизация DFT для больших систем не показывается. Вообще ничего не показывается, даже начальную геометрию не рисует.
A в каплкластерах рисует начальную, но игнрирует все шаги оптимизации.
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 736
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Vit Nhoc » Вт окт 15, 2019 3:02 pm

surius писал(а):
Вт окт 15, 2019 10:38 am
Shorku писал(а):
Чт июн 27, 2019 5:40 pm
Chemcraft последней версии некорректно открывает лог ORCA с оптимизацией связанными кластерами
У меня даже оптимизация DFT для больших систем не показывается. Вообще ничего не показывается, даже начальную геометрию не рисует.
A в каплкластерах рисует начальную, но игнрирует все шаги оптимизации.
Пожалуйста тоже пришлите проблемный файл на support[одомашненный волк]chemcraftprog.com.
Я в течение примерно четырёх месяцев выложу обновлённую версию программы, пока не торопясь её буду доделывать.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 12150
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Гесс » Вт окт 29, 2019 5:25 pm

Chemcraft некорректно отоброжает расположение атомов в POSCAR файлах VASP в которых используются fractional coordinates на неортогональных решетках. build 562b
Файл прилагаю (.txt добавлено искуственно). Настоящие расстояния между атомами меди равны между собой и близки к 2.585
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

alex7851
Сообщения: 92
Зарегистрирован: Сб сен 04, 2010 11:22 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение alex7851 » Пт ноя 08, 2019 10:48 am

Можно ли сделать так, чтобы автоматически какой-либо атом не считался связанным с остальными (не отрисовывалась палочка-связь)?
Например, в ферроцене железо постоянно нарисовано связанным с четырьмя и только четырьмя произвольными углеродами, приходится вручную это выделять и нажимать ctrl+b. Если одна структура, то еще куда не шло, но я делаю картинки орбиталей по 15-20 штук и постоянно железо опять рисуется связанным.

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 736
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Vit Nhoc » Сб ноя 09, 2019 6:37 pm

alex7851 писал(а):
Пт ноя 08, 2019 10:48 am
Можно ли сделать так, чтобы автоматически какой-либо атом не считался связанным с остальными (не отрисовывалась палочка-связь)?
Например, в ферроцене железо постоянно нарисовано связанным с четырьмя и только четырьмя произвольными углеродами, приходится вручную это выделять и нажимать ctrl+b. Если одна структура, то еще куда не шло, но я делаю картинки орбиталей по 15-20 штук и постоянно железо опять рисуется связанным.
Можно подумать об этом. Это должна быть маленькая опция в меню, а может ещё лучше подменю. Например так: Edit/Operations with selected atoms/Unbond all selected atoms. Наверно в следующей версии я это сделаю. Можете предложить ещё такие доработки?

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 1843
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение amge » Вт ноя 12, 2019 6:19 am

Если в настройках есть возможность изменять ковалентные радиусы, то можно занулить радиус железа...

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 736
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение Vit Nhoc » Вт ноя 12, 2019 10:42 am

amge писал(а):
Вт ноя 12, 2019 6:19 am
Если в настройках есть возможность изменять ковалентные радиусы, то можно занулить радиус железа...
Да, эта опция тоже есть: Tools/Chemcraft incorrectly identifies.../ далее кликнуть на знак ! справа от связи C-Fe и развыделить галочки. Только важно не сохранять эти временные настройки.

alex7851
Сообщения: 92
Зарегистрирован: Сб сен 04, 2010 11:22 pm

Re: Вопросы по совершенствованию программы Chemcraft

Сообщение alex7851 » Вт ноя 19, 2019 10:24 am

Vit Nhoc писал(а):
Вт ноя 12, 2019 10:42 am
amge писал(а):
Вт ноя 12, 2019 6:19 am
Если в настройках есть возможность изменять ковалентные радиусы, то можно занулить радиус железа...
Да, эта опция тоже есть: Tools/Chemcraft incorrectly identifies.../ далее кликнуть на знак ! справа от связи C-Fe и развыделить галочки. Только важно не сохранять эти временные настройки.
О, спасибо, это то, что надо! Но кто бы мог подумать, что эти настройки будут за этим пунктом. Я думал, там будет типа формы обратной связи, чтобы отправить неправильно определенную молекулу и никогда не нажимал на него. :lol:

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 5 гостей