ZMM программа: поиск конформаций, сходимость

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
dmitriys
Сообщения: 36
Зарегистрирован: Пт июл 09, 2021 3:16 pm

ZMM программа: поиск конформаций, сходимость

Сообщение dmitriys » Сб июл 10, 2021 1:59 pm

Здравствуйте!
Кому нибудь приходилось иметь дело с программой ZMM?
Оптимизирую свой pdb файл, поиск минимума.
Потом будет поиск конформаций.
Выдает на 30 итерации Uphill energy.
Кто нибудь знает ключи и параметры для лучшей сходимости?

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13055
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: ZMM программа: поиск конформаций, сходимость

Сообщение Гесс » Сб июл 10, 2021 2:13 pm

А это точно программа а не метод из громакса? (zero-multiple summation method).
Впрочем в обоих случаях тут шансы получить совет на тему молмех-МД невелики. Если это часть громакса - то лучше спрашивать их форум, там Лемкул должен все знать.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 18 гостей