Создание кластера для расчетов на Gaussian 16

[kirill1111]

Здравствуйте! Хочется попробовать собрать из нескольких имеющихся компов кластер на линуксе и поставить на него Gaussian 16. Интересно было бы проверить насколько это ускорит вычисления. Однако никакой информации о том, как решить эту задачу нет, а документация к программе данный вопрос никак не освещает. Может быть кто-то уже занимался подобным или видел какую-то методичку/инструкцию, которая может помочь с этим? Заранее спасибо.

[Гесс]

В описании программы не будет описания архитектуры кластера.
Если в общих чертах - одна мастернода и несколько расчетных. Openmpi для распараллеливания.
Архитектуру малых кластеров быстро не найду, большое например вот, вдруг оно вам поможет.
https://wiki.bwhpc.de/e/BwUniCluster2.0 ... chitecture

[kirill1111]

Спасибо за ответ.

Если в общих чертах - одна мастернода и несколько расчетных.

Как устроен кластер мне в общих чертах понятно. Нужно взять минимум 2 компьютера, соединить их по связи Fast Ethernet, а дальше начинаются вопросы. Например не очень понятно по какому протоколу реализовывается связь узлов, не понятно как подружить компы между собой и не понятно как туда запихнуть Gaussian 16.

Openmpi для распараллеливания.

Как я понимаю Openmpi используется для реализации распараллеливания программ, которые не предусматривают этого изначально (позволят использовать узлы кластера как дополнительные ядра процессора). Gaussian 16 же должен справляться с этой задачей сам, по крайней мере в документации написано что это реализовано, и при расчете можно указать названия узлов кластера и число ядер процессоров на них, которые будут использованы для расчета. Таким образом главный вопрос стоит в том, как поставить на несколько компов Gaussian 16 и объяснить ему, что это кластер.

[mizuchi]

Гауссиан параллелизуется не MPI, а Linda, которая продается отдельно.