GAUSSIAN программа

вопросы строения молекул и квантовой химии
Йилка_Новогодня
Сообщения: 15
Зарегистрирован: Чт май 27, 2010 7:58 pm

GAUSSIAN программа

Сообщение Йилка_Новогодня » Ср окт 13, 2010 12:20 am

Спасибо.
Последний раз редактировалось Йилка_Новогодня Чт фев 04, 2016 7:46 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Droog_Andrey » Ср окт 13, 2010 6:30 pm

Посчитать энергии заслонённой и заторможенной конформаций и вычислить разницу...

Как находить конформации - см. в соседней теме: viewtopic.php?f=11&t=54931
2^74207281-1 is prime!

Йилка_Новогодня
Сообщения: 15
Зарегистрирован: Чт май 27, 2010 7:58 pm

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Йилка_Новогодня » Пт окт 15, 2010 8:43 pm

Спасибо.

Аватара пользователя
Love
Сообщения: 186
Зарегистрирован: Сб дек 17, 2005 8:27 am

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Love » Чт окт 21, 2010 12:07 pm

Добрый день.
Несколько вопросов по программе Gaussian. Создавать отдельную тему, наверно, не имеет смысла.

Проблема состоит в том, что при расчете периодичной структуры (B3LYP, 6-31, k=3) выводится ошибка:
-------------------- ATTENTION--------------------
Total charge is not ZERO --- -0.002902253251
-------------------- ATTENTION--------------------

There is a problem with the total charge.

Объясните пожалуйста, из-за чего данная ошибка может возникать и как с ней бороться?
Если бы составляющие тела человека разбить на многообразные химические элементы, их бы общая стоимость составила бы 22,80 доллара США.

ХИМИЯ НЕ КРУГОМ НАС, А ВНУТРИ НАС.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Droog_Andrey » Чт окт 21, 2010 7:42 pm

Обычно из-за диффузных функций или из-за небольшого CellRange.
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Love
Сообщения: 186
Зарегистрирован: Сб дек 17, 2005 8:27 am

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Love » Пт окт 22, 2010 10:18 am

И как с ней бороться?
К сожалению, знаю гауссиан плохо. Столкнулась первый раз.
Если бы составляющие тела человека разбить на многообразные химические элементы, их бы общая стоимость составила бы 22,80 доллара США.

ХИМИЯ НЕ КРУГОМ НАС, А ВНУТРИ НАС.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Droog_Andrey » Чт окт 28, 2010 11:04 am

А что именно рассчитываете?
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Love
Сообщения: 186
Зарегистрирован: Сб дек 17, 2005 8:27 am

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Love » Пт окт 29, 2010 2:48 pm

Цепочка атомов углерода, карбин. Все это дело периодично по одной оси.
В B3LYP расчет выдает ошибку с зарядом.
Если бы составляющие тела человека разбить на многообразные химические элементы, их бы общая стоимость составила бы 22,80 доллара США.

ХИМИЯ НЕ КРУГОМ НАС, А ВНУТРИ НАС.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение VTur » Пт окт 29, 2010 3:00 pm

Если Малликеновский заряд, то наверно из-за какого-нибудь произвола при разделении орбиталей? Часть орбиталей одного атома может залезть в чужую ячейку к чужому атому.
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Droog_Andrey » Пт окт 29, 2010 8:41 pm

VTur, не малликеновский.

Love, про расчёты карбина см. тут: viewtopic.php?f=10&t=38989
2^74207281-1 is prime!

Neitrino
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Пт май 08, 2009 10:40 am
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Neitrino » Вс ноя 07, 2010 12:36 pm

Уменя такой вопрос.
Я считаю молекулу ацетилена DFT/rb3lyp/6-31G(d,p) M=1.
1. Почему программа выдает The largest alpha MO coefficient is 0.1511D+02?
2. Это связано с выбранным базисом?
3. И как это исправить?

Заранее благодарю.
Химия, как женщина, требует стопроцентного внимания.

o-oxhem
Сообщения: 425
Зарегистрирован: Вт июл 08, 2008 10:33 pm

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение o-oxhem » Вс ноя 07, 2010 5:17 pm

Neitrino писал(а):Уменя такой вопрос.
Я считаю молекулу ацетилена DFT/rb3lyp/6-31G(d,p) M=1.
1. Почему программа выдает The largest alpha MO coefficient is 0.1511D+02?
Это только предупреждение. Ничего не надо исправлять.

Neitrino
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Пт май 08, 2009 10:40 am
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Neitrino » Ср дек 08, 2010 2:21 pm

На форуме достаточное количество людей, которые работали и продолжают работать на программе Gaussian. Поэтому хочу предложить оказание помощи для молодых ученых, занимающих квантовохимическими расчетами, и делится своими опытами в работе с этой программой. Например, такие как я. Помощь заключается в следующем:

1. Какую комбинацию ключевых слов использовать для выполнения определенных задач. Так как не все ключевые слова можно использовать вместе.
2. Выбор базиса(функционал и др.) для разных классов соединений или в зависимости от элементов периодической системы. Например, я знаю, что гибридный функционал B3LYP дает маленькую погрешность для соединений из элементов 2 периода, для комплексных соединений - большую.
3. Ну и что-то в этом духе.
Химия, как женщина, требует стопроцентного внимания.

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Yurii » Ср дек 08, 2010 3:59 pm

Neitrino писал(а):хочу предложить оказание помощи для молодых ученых, занимающих квантовохимическими расчетами, и делится своими опытами в работе с этой программой.
Мне кажется, что в свете вопроса, на который Вам ответил o-oxhem, Вам самому необходима эта помощь. А помощь молодым ученым прежде всего необходима материальная, чтобы этот самый gaussian приобрести. Я бы на Вашем месте их порадовал бы следующим сообщением: в инете появилась сетевая версия Gaussian 09W Rev. A.02 SMP.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Neitrino
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Пт май 08, 2009 10:40 am
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Neitrino » Ср дек 08, 2010 4:55 pm

Какая разница между версиями A и B?
Химия, как женщина, требует стопроцентного внимания.

Neitrino
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Пт май 08, 2009 10:40 am
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Neitrino » Ср дек 08, 2010 4:57 pm

Yurii писал(а):
Neitrino писал(а):хочу предложить оказание помощи для молодых ученых, занимающих квантовохимическими расчетами, и делится своими опытами в работе с этой программой.
Мне кажется, что в свете вопроса, на который Вам ответил o-oxhem, Вам самому необходима эта помощь. А помощь молодым ученым прежде всего необходима материальная, чтобы этот самый gaussian приобрести. Я бы на Вашем месте их порадовал бы следующим сообщением: в инете появилась сетевая версия Gaussian 09W Rev. A.02 SMP.
Кто спрашивает, тот рискует остаться дураком на 5 минут, который не спрашивает - на всю жизнь. :D Далее я указал, что мне нужна помощь в этом. И подчеркивать это я не вижу смысла. :)
Химия, как женщина, требует стопроцентного внимания.

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Yurii » Ср дек 08, 2010 11:09 pm

Neitrino писал(а):Какая разница между версиями A и B?
http://www.gaussian.com/g_tech/rel_notes.pdf
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение VTur » Сб дек 18, 2010 4:53 pm

Yurii писал(а): в инете появилась сетевая версия Gaussian 09W Rev. A.02 SMP.
Сколько она может адресовать оперативной памяти?
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Yurii » Вс дек 19, 2010 11:01 pm

VTur писал(а):
Yurii писал(а): в инете появилась сетевая версия Gaussian 09W Rev. A.02 SMP.
Сколько она может адресовать оперативной памяти?
Не в курсе: меня под винды гауссиан не интересует.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Neitrino
Сообщения: 118
Зарегистрирован: Пт май 08, 2009 10:40 am
Контактная информация:

Re: GAUSSIAN программа

Сообщение Neitrino » Сб фев 05, 2011 1:45 pm

Подскажите, пожалуйста, как вводить внутреннюю координату при расчетах IRC или ключевые слова?
Химия, как женщина, требует стопроцентного внимания.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 9 гостей