Компьютеризация ретросинтеза

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Ответить
Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Компьютеризация ретросинтеза

Сообщение pH<7 » Вт янв 16, 2007 3:54 am

Что-нибудь новое слышно в области разработки программ для ретросинтеза?
Carpe diem

Marxist

Сообщение Marxist » Вт янв 16, 2007 11:46 am

На симбиосисе буквально на днях открылся веб-интерфейс
http://www.simbiosys.ca/archem/index.html
Если не боишься, что твои молекулы синтезируют раньше тебя -- дерзай.
А в целом работа идёт в разных местах.

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Вт янв 16, 2007 5:03 pm

Не могу найти веб-интерфейс, вижу только "дайте попробовать" :?
Carpe diem

Marxist

Сообщение Marxist » Вт янв 16, 2007 5:11 pm

Там вроде бы если зарегиться, можно попробовать. Впрочем, я не щупал, просто мне сегодня рекламное письмо пришло :)

Alexei
Сообщения: 70
Зарегистрирован: Пн янв 08, 2007 10:43 pm

Re: Компьютеризация ретросинтеза

Сообщение Alexei » Вт янв 16, 2007 9:02 pm

pH<7 писал(а):Что-нибудь новое слышно в области разработки программ для ретросинтеза?
Я помню пару лет назад один немец докладывался о прогрессе. Интересно что его программа называлась "VODKA". Утверждал что вещь крутая, типа можно самому выбрать использовать ли металоорганику или перециклические реакции и все привязано к исходникам из каталогов. По его словам дело тормозится нежеланием химиков (ведущих химиков) отдать такой кайф как посидеть и покумекать над молекулой какой-то железяке.

StYV
Сообщения: 3080
Зарегистрирован: Пн окт 24, 2005 11:43 pm

Сообщение StYV » Вт янв 16, 2007 10:24 pm

После регистрации на сайте было сказано ждать в течение 2 дней и возможно будет счастье огромное!
С уважением StYV.

Marxist

Re: Компьютеризация ретросинтеза

Сообщение Marxist » Ср янв 17, 2007 11:44 am

Alexei писал(а):Интересно что его программа называлась "VODKA".
Не VODKA, a WODCA. А немец тот был известный Ёхан Гастайгер.

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Сообщение chemist » Ср янв 17, 2007 11:57 am

StYV писал(а):После регистрации на сайте было сказано ждать в течение 2 дней и возможно будет счастье огромное!
С уважением StYV.
Счастья не ждите. Я ввел с десяток структур от балды (с сайта Асинексов) - в результате ни одного результата (пути синтеза не найдены). Так, игрушка...
По-видимому эта проблема для программирования посложнее шахмат будет, т.к. в стратегии синтезов гораздо больше "фигур" и "правил" по которым они "ходят".
I D E A = A u

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: Компьютеризация ретросинтеза

Сообщение chemist » Ср янв 17, 2007 12:00 pm

Marxist писал(а):
Alexei писал(а):Интересно что его программа называлась "VODKA".
Не VODKA, a WODCA. А немец тот был известный Ёхан Гастайгер.
Интересно, он продолжает это дело или "завязал", там на страничке написано: Last change: 2000-06-28.
I D E A = A u

Marxist

Re: Компьютеризация ретросинтеза

Сообщение Marxist » Ср янв 17, 2007 12:07 pm

chemist писал(а):Интересно, он продолжает это дело или "завязал", там на страничке написано: Last change: 2000-06-28.
Вообще он щас в длительном процессе ухода на пенсию. Разработка программ вроде продолжается... может, это дата изменения странички? вот более новая версия. Написано, что разработка прекращена в 2005.

Аватара пользователя
ИСН
Робин Гуд
Сообщения: 8532
Зарегистрирован: Пт окт 10, 2003 5:32 pm
Контактная информация:

Сообщение ИСН » Ср янв 17, 2007 12:26 pm

chemist писал(а):По-видимому эта проблема для программирования посложнее шахмат будет, т.к. в стратегии синтезов гораздо больше "фигур" и "правил" по которым они "ходят".
Золотые слова! Так и есть. Так и будет.

Marxist

немного вдогонку

Сообщение Marxist » Ср янв 24, 2007 11:29 am

Скажу несколько слов в защиту компьютерного ретросинтеза. Это действительно достаточно сложная задача, и решение её представляет больший интерес для программистов, чем для химиков. Основная сложность даже не в поиске подходящих трансформов или исходных реагентов, а в выборе оптимального решения. Таким образом, эта задача представляет собой один из видов искусственного интеллекта, причём далеко не самый сложный.
А конкретная польза от программы, приивязанной к хорошей базе реакций, может быть в том, что ни один химик не может знать всех реакций. А программа, автоматически ищущая нужную реакцию в базе, может подать хорошую идею.

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 12 гостей