Оптимизация комплексов в UK GAMESS

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Kirchern
Сообщения: 76
Зарегистрирован: Ср янв 16, 2008 9:56 am

Оптимизация комплексов в UK GAMESS

Сообщение Kirchern » Вт ноя 08, 2011 6:48 pm

Пытаюсь оптимизировать комплекс определенного соединения с молекулой растворителя, но выходит ошибка: недостаточно координат. Как я понимаю, у GAMESSа есть ограничения по расстояниям. Больше ван-дер-вальсовских радиусов он не создает координат. Так как с этим быть? Подскажите пожалуйста!

АлександрI
Сообщения: 378
Зарегистрирован: Ср мар 23, 2011 5:09 pm

Re: Оптимизация комплексов в UK GAMESS

Сообщение АлександрI » Вт ноя 08, 2011 8:20 pm

UK GAMESS
Это что, у вас лицензионный Chem(Bio)Office?
Не так давно я имел несчастье пользоваться оттуда модулем что-то типа Сhem3D...
Я вам не завидую

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Оптимизация комплексов в UK GAMESS

Сообщение sanya1024 » Ср ноя 09, 2011 12:45 am

Наверное, все-таки US GAMESS.
Нужно задать $ZMAT DLC=.TRUE. AUTO=.TRUE. NONVDW(1)=пара атомов, где один -- из молекулы, второй -- из растворителя $END
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 31 гость