Молекулярный переходник

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2046
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Молекулярный переходник

Сообщение amge » Ср май 02, 2012 1:17 pm

Тетратретбутилтетраэдран - это да, на нем превосходно видно, почему это T и чем отличается от Td. А с С[С(О)Me]4 у меня что-то не получается ничего более симметричного, чем D2 :).

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13068
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Молекулярный переходник

Сообщение Гесс » Ср май 02, 2012 2:06 pm

Так я не про кетон, а про соответствующий спирт С(СН(ОН)Ме)4
С ним, думается мне, все должно быть хорошо.

Внесена правка ибо дурак.
Последний раз редактировалось Гесс Ср май 02, 2012 6:09 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2046
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Молекулярный переходник

Сообщение amge » Ср май 02, 2012 3:15 pm

Да я тоже не про кетон, ошибся, извиняюсь. Если Т, то ось С3 должна пройти по связи С-СНОНМе, но при повороте на 120 гр. фрагмент СНОНМе сам в себя никак не перейдет.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13068
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Молекулярный переходник

Сообщение Гесс » Ср май 02, 2012 6:09 pm

Гм. Правда. Туплю. Значит нужен С3 симметричный низкомолекулярный фрагмент, не обладающий плоскостями симметрии. Че-то ничего меньше D3-трисгомокубана в голову не приходит. На основаннии этого каркаса уже Т-симметричную молекулу делали.

Код: Выделить всё

http://ac.els-cdn.com/S0040402001875943/1-s2.0-S0040402001875943-main.pdf?_tid=7e44f5fa36918fb3af4feede6499ee6a&acdnat=1335971421_7034df3c8fb02ac6e813dcaf2a871327
Synthesis of (+)-1,3,5,7 -tetrakis[2-(1S,3S,5R,6S,8R,10R)-D3-trishomocubanylbuta-1,3-diynyl]adamantane : The first optically active organic molecule with t symmetry and of known absolute configuration - именно ее я собирался послать.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13068
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Молекулярный переходник

Сообщение Гесс » Ср май 02, 2012 7:48 pm

Кстати да, вспомнил. Закончились рассчеты перекошенного пиридина. Была взята молекула в которой метил заменил на ацетиленид, придал С2v симметрию и наклонил ароматическое кольцо. Симметрия вероятно Сs, но не проверял. При оптимизации конкретных геометрий сошелся ненаклоненный и наклоненный на 5 градусов. 10 градусник не сошелся. Modredundant заданный с углом 5 градусов и 5 шагами выдал только одну цифру и набор нулей (я это воспринимаю как несошедшиеся рассчеты). Симметрия у сошедшихся рассчетов пропала (по мнению гауссиана, хотя смотрится по прежнему прилично). Самое занимательное что сошедшиеся рассчеты дали нимаг 0. Непонятно, здорово, но скорее всего я на эту тему забью. Fun закончился.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13068
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Молекулярный переходник

Сообщение Гесс » Чт май 03, 2012 1:29 am

Как говорится "неспалось" и решил я написать пару мыслей про Т-молекулу (чисто теоретических). :235:
Молекула С[CH(OH)Me]4 вполне справедливо забракована Amge ибо фрагмент CH(OH)Me не имеет оси третьего порядка.
Зато ее имеет второй фрагмент: С[CH(OH)Me]3 (чисто теоретически может иметь если вдруг все группы повернутся на нужные углы).
Значит Т симметричной молекулой без единого цикла будет С{C[CH(OH)Me]3}4.
Молекулку удалось даже нарисовать, вместо гидроксилов поставлены атомы фтора, но думается мне в реальном мире внутреннее отталкивание порвет такой "древлян" в клочья.
Alifatic.mol
С другой стороны это наверное первая ациклическая хиральная молекула имеющая в одной конформации точечную группу Т. И не такая и большая: С29Н48F12.
Окромя всего прочего, вот народ роет чисто по С3 симметрии
Няша.pdf
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Молекулярный переходник

Сообщение VTur » Чт май 24, 2012 9:47 am

Гесс, если Вы считаете напряжение цикла, то других циклических молекул, кроме Вашей, в реакции быть не должно, даже если они и считаются ненапряженными (их добавляют, если вывернуться иначе никак, но цифра будет плохой)
Если Вы считаете энергию невалентных взаимодействий, то других молекул с невалентными взаимодействиями в реакции быть не должно
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13068
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Молекулярный переходник

Сообщение Гесс » Чт май 24, 2012 10:51 am

1) что есть молекула с невалентными взаимодействиями?
2) я смотрел статьи с полизамещенными бензолами их дробили с помощью бензолов на толуолы
Считать же пиридин через имин и этилен, как я это нашел еще в одной статье мне показалось очень странным.
Можно еще описать пиридин как 5/6 бензола+пытаться задать азот но мне это казалось странным.
Счас уже не кажется, я об этом недумаю :-)))

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Молекулярный переходник

Сообщение VTur » Чт май 24, 2012 3:04 pm

Гесс писал(а):1) что есть молекула с невалентными взаимодействиями?
Это такая же условность, как и энергия напряжения цикла. Берете молекулу без циклов, считаете ее каким-то аддитивным методом, сравниваете с экспериментом, получаете значительное отклонение, верите эксперимету, объявляете
, что в молекуле есть существенные невалентные взаимодействия, находите поправку, добавляете поправку к исходному расчету, получаете хорошее согласие с экспериментом.
После отстоя требуйте долива

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Молекулярный переходник

Сообщение VTur » Чт май 24, 2012 3:06 pm

Гесс писал(а):2) я смотрел статьи с полизамещенными бензолами их дробили с помощью бензолов на толуолы
Так и находят невалентные взаимодействия.
После отстоя требуйте долива

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 16 гостей