краун-эфиры для удаления натрия и калия

вопросы современной биологической химии, молекулярной биологии, химической энзимологии и смежных наук
biochem, molbio, chemical enzymology and related discussions for professionals
Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение chemist » Ср май 16, 2012 11:58 am

EvgeniyChup, мы пошли по кругу:
EvgeniyChup писал(а):Тут уж как avatar решит, и кстати если в комплексе с крауном заряд иона как был положителен то так и останется, то можно подобрать буфер когда заряд белка отрицателен и делить электрофорезом,
Краунированный катион металла находится в комплексе с белком, поэтому двигаться будет весь комплекс, это мы уже проходили :D
EvgeniyChup писал(а):можно делить на аффинном сорбенте вымыть комплекс катиона с крауном и потом снимать белок...
Чтобы создать афинный сорбент, надо знать строение белка и иметь его чистым, а сначала надо бы его проанализировать - идём к началу :arrow:
EvgeniyChup писал(а):А поповоду не знает с каким белком работает, то тут вопрос из чего выделяет,
Сомневаюсь, что современная наука "пощупала" все имеющиеся на планете белки, их же триллионы, куда не ткни - всё новые и новые, а может и не новые? :issue: . Отличить можно надёжным анализом типа МС, но мешают катионы, т.е. опять мы попали в начало задачи :issue:
EvgeniyChup писал(а):плюс я думаю для начала можно и с катионным комплексом поработать, все равно придется и гидролиз делать и последовательность определять...
Поработали, поняли, что для масс-спектрометрии комплексы с металлами не годятся, т.е. нужно металлы удилить, опять попадаем в начало :lol:

Уф-ф-ф... :wink: :D :lol:
I D E A = A u

Аватара пользователя
EvgeniyChup
Сообщения: 503
Зарегистрирован: Ср дек 02, 2009 10:21 am
Контактная информация:

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение EvgeniyChup » Ср май 16, 2012 2:25 pm

а типа, гидролиз классический ферментами трипсином, потом карбоксипептидазой, и определение последовательности по методу Эдмана???
Если парус теряет ветер, он становится обыкновенной тканью.

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение chemist » Ср май 16, 2012 2:39 pm

EvgeniyChup писал(а):а типа, гидролиз классический ферментами трипсином, потом карбоксипептидазой, и определение последовательности по методу Эдмана???
Типа, сначала топикстартер хочет проанализировать LC-MS'ом белковую смесь без заморочек (имеет на это право! :mrgreen: ). А потом всё как обычно, - начиная с раз(вы)деления нужной фракции будет делать биохимик со своими сефадексами и пептидазами под чутким руководством Эдмана :very_shuffle: :lol: :D
Но деньги вперёд анализ сначала :idea:
I D E A = A u

Аватара пользователя
EvgeniyChup
Сообщения: 503
Зарегистрирован: Ср дек 02, 2009 10:21 am
Контактная информация:

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение EvgeniyChup » Ср май 16, 2012 2:52 pm

:arrow:
ОФФ топп пошел
читаем литературку ст. 93... и лучше всег оперед MC делать 2-D гель электрофорез
Если парус теряет ветер, он становится обыкновенной тканью.

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение chemist » Ср май 16, 2012 3:40 pm

EvgeniyChup писал(а)::arrow:
ОФФ топп пошел
читаем литературку ст. 93... и лучше всег оперед MC делать 2-D гель электрофорез
Да хоть 4-D в виртуальной реальности! :lol: . Сам принцип электрофореза никак не влияет на распадаемость комплексов белок - ион металла :very_shuffle:
В главе PREPARATION OF THE PROTEIN SAMPLE FOR IDENTIFICATION этой книги ничего не сказано о том, как быть, если такая оказия случилась :( . Т.е. по умолчанию подразумевается, что никаких ионов металлов анализируемые белки не содержат или их биохимик как-то выцарапал до того как. Как? :shock:
I D E A = A u

Аватара пользователя
EvgeniyChup
Сообщения: 503
Зарегистрирован: Ср дек 02, 2009 10:21 am
Контактная информация:

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение EvgeniyChup » Ср май 16, 2012 4:00 pm

Тогда Эдман, а масс спектрометр не поможет опять же оказия :skull: да и смесюку форез возьмет; а анализаторы белков сейчас норм работают, так что биохимики рулят...
Если парус теряет ветер, он становится обыкновенной тканью.

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение chemist » Ср май 16, 2012 4:05 pm

EvgeniyChup писал(а):Тогда Эдман, а масс спектрометр не поможет опять же оказия :skull: да и смесюку форез возьмет; а анализаторы белков сейчас норм работают, так что биохимики рулят...
Ага рулят, если на руле ничего лишнего не весит :lol:
Смесюку-то форез возьмёт и благополучно принесёт к финишу, да только... в виде комплекса белка с проклятым катионом! :mrgreen: :lol: :lol:
I D E A = A u

Аватара пользователя
EvgeniyChup
Сообщения: 503
Зарегистрирован: Ср дек 02, 2009 10:21 am
Контактная информация:

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение EvgeniyChup » Ср май 16, 2012 4:16 pm

И на секвенатор после предварительного гидролиза ферментами и бромцианом
А лучше после разделения фракций отправить на осмос.Да и кстати насколько устойчив комплекс? были ли попытки измерить константу стойкости? можно удалить ион используя известный белок который образует более стойкие комплексы с ионами Na+; K+ и сместиь равновесие... или использовать Na/K ATPазу.
Если парус теряет ветер, он становится обыкновенной тканью.

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: краун-эфиры для удаления натрия и калия

Сообщение chemist » Ср май 16, 2012 4:38 pm

EvgeniyChup писал(а):И на секвенатор после предварительного гидролиза ферментами и бромцианом
Смесюгу-то? И что это будет, 3,5 землекопа аминокислоты на другую аминокислоту? :issue:
EvgeniyChup писал(а):А лучше после разделения фракций отправить на осмос.
И угробить, осмос - злой дядька для нежных белков :twisted: :issue:
EvgeniyChup писал(а):можно удалить ион используя известный белок который образует более стойкие комплексы с ионами Na+; K+ и сместиь равновесие... или использовать Na/K ATPазу.
Т.е. забить мешающие гвозди микроскопом к е.м. :up: :lol: :D . И как потом отделять остатки микроскопа из стены привнесенные белки из целевого? :dontknow:
Крауны и криптанды, всё-таки, подешевле будут и отделаться от них легче :shuffle:
I D E A = A u

Ответить

Вернуться в «биохимия и молекулярная биология / biochemistry and molecular biology»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 21 гость