Центр тяжести

[Danaida]

Здравствуйте, уважаемые химики. Меня интересует вопрос о центре тяжести молекулы. У меня есть исходная и конечная геометрия молекулы. Скажите, пожалуйста, как проверить, происходит ли при изменении геометрии смещение центра тяжести?

[uchebnik fiziki]

Рассчитать его координаты для исходной и конечной геометрии, предварительно выровняв их по всем атомам

[Danaida]

Спасибо большое. У меня еще один вопрос, допустим, если центр тяжести сместился, то тогда я перехожу в систему координат, связанную с ним; поскольку геометрия изменилась, произошло смещение атомов, тогда как найти вектор смещения? (вычесть из соответствующих конечных координат начальные, что маловероятно).
Посоветуйте, пожалуйста, литературу о том, как можно отделить вращательные и поступательные вклады

[uchebnik fiziki]

как найти вектор смещения? (вычесть из соответствующих конечных координат начальные, что маловероятно).

А как ещё? Вопрос только в том, вектор смещения чего вы хотите найти.

[Danaida]

Вектор смещения атомов относительно исходной геометрии

[uchebnik fiziki]

Считаете для каждого атома по отдельности.

[ИСН]

Вопрос бессмысленный. Ведь нет такого понятия "смещение центра тяжести при реакции". Смотрите, молекула может стоять на месте, а может куда-то лететь. В зависимости от этого, центр тяжести может сместиться на любую величину в любом направлении, а может не сместиться вовсе. Каким образом это характеризует реакцию, которая (допустим) в это время происходит с молекулой? Да никаким.

[uchebnik fiziki]

Про реакцию речи не идёт: разговор об оптимизации, как подсказывает телепатия.

[ИСН]

Ну, оптимизацию. Ну, читай у меня вместо "реакция" - "изменение геометрии". Один чёрт же.

[uchebnik fiziki]

Тебе придумать ситуацию, в которой это актуально? Да не вопрос. Предположим, у нас молекулы вращаются вокруг центра масс. Если у нас разные положения центра масс оптимизированной и неоптимизированной молекулы, будут разные результаты вращения. Другой вопрос, что если молекула близко к минимуму, то и пофиг, а если сильное смещение, то далеко. Но в каких-то экзотических случаях типа длинных алканов или больших циклов может быть важно.

[ИСН]

Придумать я и сам могу. Допустим, молекула висит на стенке (на платиновой грани 110), и важно расстояние от центра масс до этой стенки.
Но это всё-таки узкий и специфический класс задач, и ничто в изначальной формулировке на него не намекает.

[uchebnik fiziki]

Изначальная формулировка намекает на учебный характер задачи...

[ИСН]

В каковом случае особенно верен мой первый коммент насчёт бессмысленности.

[Danaida]

Вообще, одна из вспомогательных задач состоит в разложении вектора смещения по нормальным координатам. Нужно учесть условие ортогональности векторов нормальных колебаний. Но как это сделать, если у меня есть исходная и конечная геометрия? Например, я могу через имеющиеся координаты перейти к масс-взвешенным координатам, чтобы отделить трансляцию и вращение. После этого построить матрицу кинематических коэффициентов и матрицу силовых постоянных. Помогите, пожалуйста, и где об этом почитать

[ИСН]

Смотрите, вот тут уже есть слова "отделить трансляцию". А это что значит?

[Danaida]

Имеется ввиду, что этот вектор смещения раскладывается на сумму смещений по 3N-6 нормальным координатам + произвольное вращение, зависящее от 3-х параметров + сдвиг (трансляция - поступательные степени свободы)

[ИСН]

"Этот" - это мы всё ещё про вектор смещения центра тяжести?

[Danaida]

Здесь уже имеется ввиду вектор смещения геометрии по сравнению с начальной

[ИСН]

А. Ну тогда да, он раскладывается на всё вот это, что Вы сказали. А вопрос в чём?

[Danaida]

Нужна конкретная формула, которую непросто вывести, не могу найти на что опереться, чтобы было понятно