Расчёты переходных металлов на DFT

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 1388
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Vit Nhoc » Сб фев 03, 2018 12:34 pm

Здравствуйте,
Я, честно говоря, не могу вспомнить, задавал ли я уже подобный вопрос.
Я считал кластеры никеля и оксида никеля на DFT (PBE). Пытаюсь сочинить статью. Просьба оценить, насколько корректным будет следующий фрагмент статьи:

При расчёте переходных металлов возникают очень серьёзные трудности, связанные с наличием нескольких низколежащих электронных состояний и разных мультиплетных состояний. В связи с этим, для всех систем проводилось несколько расчётов с различными мультиплетностями, и состояние с наименьшей энергией рассматривалось как “истинное” состояние данной системы. Для более надёжного нахождения электронной волновой функции использовалась опция “#SCF(XQC)” в программе Gaussian: с этой опцией вначале проводится традиционная процедура поиска электронного состояния традиционным методом само-согласованного поля, а если найти волновую функцию не удаётся, запускается метод quadratically convergent SCF. Что ещё более важно, все расчёты проводились с помощью опции “#Stable(opt)”: этот вариант расчёта находил наиболее стабильное электронное состояние, и далее с найденной волновой функцией проводилась оптимизация геометрии (опция “#Guess(read) opt)”. В некоторых случаях первоначальная процедура ССП или QC находила возбуждённое электронное состояние, и в дальнейшем процедура “#Stable(opt)” рассчитывала электронное состояние со значительно меньшей энергией, для которого далее проводилась оптимизация геометрии.
"Ты должен сделать добро из зла, потому что больше его сделать не из чего". АБ Стругацкие.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Гесс » Сб фев 03, 2018 3:53 pm

К первым 4 строкам:
Почему вы считаете что эти системы вообще можно корректно описать single-reference (одноконфиграционными) методами типа DFT?
Ко всему остальному:
ИМХО это довольно технические детали которые можно вынести в Supplementary и не обсуждать их в результатах/методах.

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 1388
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Vit Nhoc » Сб фев 03, 2018 5:07 pm

Почему вы считаете что эти системы вообще можно корректно описать single-reference (одноконфиграционными) методами типа DFT?
Я напишу как-то так, что мы полагаем, что даже полукачественная точность расчёта может быть полезной для наших задач.
"Ты должен сделать добро из зла, потому что больше его сделать не из чего". АБ Стругацкие.

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 189
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Lantano » Сб фев 03, 2018 10:54 pm

Простите, а "полукачественная точность" - это что? И для каких задач она может быть полезна?
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 1388
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Vit Nhoc » Сб фев 03, 2018 10:59 pm

Lantano писал(а):
Сб фев 03, 2018 10:54 pm
Простите, а "полукачественная точность" - это что? И для каких задач она может быть полезна?
Ну, например, какие комплексы оксида никеля образуют с CO монодентантную связь, а какие бидентантную.
"Ты должен сделать добро из зла, потому что больше его сделать не из чего". АБ Стругацкие.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Гесс » Вс фев 04, 2018 12:41 pm

Если там существенный мультиреференс то синглреференс может не давать настоящих трендов, давать артефакты, врать с геометрией и вообще показывать среднюю цену на рубероид в системе ориона. Так что имхо надо либо доказывать что его нет либо хотябы убедительно показывать хорошее совпадение с экспериментом

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 189
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Lantano » Вс фев 04, 2018 10:47 pm

С Гессом согласен. Считаете не те состояния, которые нужно, и получаете не те результаты, которые хотите.
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

mizuchi
Сообщения: 97
Зарегистрирован: Ср фев 23, 2011 5:10 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение mizuchi » Пн фев 05, 2018 10:36 pm

Бросайте этот ваш несчастный Гауссиан, он ничего не умеет.
https://doi.org/10.1103/PhysRevB.60.10763

iChem
Сообщения: 29
Зарегистрирован: Вт авг 30, 2011 10:57 am

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение iChem » Вт фев 06, 2018 12:08 am

Гесс писал(а):
Вс фев 04, 2018 12:41 pm
Если там существенный мультиреференс то синглреференс может не давать настоящих трендов, давать артефакты, врать с геометрией и вообще показывать среднюю цену на рубероид в системе ориона. Так что имхо надо либо доказывать что его нет либо хотябы убедительно показывать хорошее совпадение с экспериментом
Если вы имеете ввиду что электронная плотность мультиреференсных состояний не описывается однодетерминантной функцией, то лучше прям так и говорите, а то мешанина получается (речь идет о DFT же)...
Но ведь это же не так в общем случае? (т.е. можно придумать мультиреференсный случай с однодетерминантной плотностью)

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Гесс » Вт фев 06, 2018 1:58 am

iChem
Мультиреференсное ДФТ прокачано весьма слабо. Есть конечно DFT/MRCI, но последние лет 5-10 его кажется не развивают. Впрочем с помощью основанного на ДФТ Fractional Occupation Number Weighted Electron Density (FOD) (Орка) можно быстренько и проверить насколько все плохо.
Мультиреференсные состояния... однодетерминантная плотность... Не вгоняйте меня в теорию, я в ней терюсь, пугаюсь и бьюсь головой об пол, а это больно.
Я мультиреференс вообще стараюсь обходить бочком (и не брать системы где я его ожидаю, такие вот у меня самоограничения), а если не получается то стараюсь от него отбиться традиционными CAS методами.

mizuchi
Ну PlaneWave для компактных металлов да и для оксидов это конечно правильно, но этож совсем все не такое как на наших милых орбитальках. Да и VASP с наскоку не выучишь. Я вот уже несколько месяцев вокруг него скачу и боюсь представить сколько мне открытий чудных он готовит.

Аватара пользователя
madschumacher
Сообщения: 892
Зарегистрирован: Ср авг 05, 2015 4:30 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение madschumacher » Ср фев 07, 2018 8:13 am

iChem писал(а):
Вт фев 06, 2018 12:08 am
Но ведь это же не так в общем случае? (т.е. можно придумать мультиреференсный случай с однодетерминантной плотностью)
Электронная плотность к определителям Слейтера имеет отношение чуть менее, чем никакое. :wink:
Ну а мультиреференсный случай, описываемый одним определителем Слейтера, имхо, оксюморон.
И да узрел Охламон, что сие есть круть несусветная!

iChem
Сообщения: 29
Зарегистрирован: Вт авг 30, 2011 10:57 am

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение iChem » Ср фев 07, 2018 10:20 am

madschumacher писал(а):
Ср фев 07, 2018 8:13 am
iChem писал(а):
Вт фев 06, 2018 12:08 am
Но ведь это же не так в общем случае? (т.е. можно придумать мультиреференсный случай с однодетерминантной плотностью)
Электронная плотность к определителям Слейтера имеет отношение чуть менее, чем никакое. :wink:
Ну а мультиреференсный случай, описываемый одним определителем Слейтера, имхо, оксюморон.
Да что вы. Кон-Шем, конечно, не через детерминант расписывается. Ссылку на вики давать надо?

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение EvgeniX » Ср фев 07, 2018 11:58 am

В приличном обществе на вики не ссылаются.

Аватара пользователя
madschumacher
Сообщения: 892
Зарегистрирован: Ср авг 05, 2015 4:30 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение madschumacher » Ср фев 07, 2018 10:49 pm

iChem писал(а):
Ср фев 07, 2018 10:20 am
Да что вы. Кон-Шем, конечно, не через детерминант расписывается. Ссылку на вики давать надо?
Расписывание через определитель Слейтера (имхо) -- это самый убогий вид. Конечно, никто не может запретить Вам брать в качестве "пробной" функции тот же определитель. Но это только костыль, не более того. Имхо, наиболее "кошерный" вывод построен на аналогии с элементами диагонализованной матрицы плотности (т.е. собственными функциями оператора плотности, когда собственные значения -- это заселённости), тогда орбитали Кона-Шэма приобретают смысл, схожий с натуральными орбиталями.
Т.е. вся соль заключается в том, чтобы взять
Изображение
(при варьировании то функционала энергии по эл.плотности, спасибо 2й теореме Х-К, нигде не торчит волновая функция, а значит и определитель).
Но это на мой личный вкус. :very_shuffle:
(кст, пробная волновая функция в виде определителя Слейтера неявным образом является слабой версией этого вывода, т.к. для неё как раз таки известны эти с.ф. и с.з. в явном виде).
И да узрел Охламон, что сие есть круть несусветная!

iChem
Сообщения: 29
Зарегистрирован: Вт авг 30, 2011 10:57 am

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение iChem » Ср фев 07, 2018 11:02 pm

madschumacher писал(а):
Ср фев 07, 2018 10:49 pm
iChem писал(а):
Ср фев 07, 2018 10:20 am
Да что вы. Кон-Шем, конечно, не через детерминант расписывается. Ссылку на вики давать надо?
Расписывание через определитель Слейтера (имхо) -- это самый убогий вид. Конечно, никто не может запретить Вам брать в качестве "пробной" функции тот же определитель. Но это только костыль, не более того. Имхо, наиболее "кошерный" вывод построен на аналогии с элементами диагонализованной матрицы плотности (т.е. собственные функции оператора плотности, а собственные значения -- это заселённости), тогда орбитали Кона-Шэма приобретают смысл, схожий с натуральными орбиталями.
Т.е. вся соль заключается в том, чтобы взять
Изображение
(при варьировании то функционала энергии по эл.плотности, спасибо 2й теореме Х-К, нигде не торчит волновая функция, а значит и определитель).
Но это на мой личный вкус. :very_shuffle:
(кст, пробная волновая функция в виде определителя Слейтера неявным образом является слабой версией этого вывода, т.к. для неё как раз таки известны эти с.ф. и с.з.).
Ну значит детерминанты имеют отношение к плотности -- это хорошо. Про единственную причину появления метода Кон-Шема мы говорить не будем, это уже не имеет дела к теме сообщения.

Такой вот интересный вопрос (повторяюсь) -- можно ли электронную плотность волновой функции мультиреференсного состояния записать в виде одного детерминанта (или двух детерминантов для спин-unrestricted плотности) Кон-Шемовских орбиталей?

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение Гесс » Чт фев 08, 2018 12:16 am

Мне думается что нет, но это скорее интуитивно чем осознанно.

Аватара пользователя
madschumacher
Сообщения: 892
Зарегистрирован: Ср авг 05, 2015 4:30 pm

Re: Расчёты переходных металлов на DFT

Сообщение madschumacher » Чт фев 08, 2018 8:06 am

iChem писал(а):
Ср фев 07, 2018 11:02 pm
Ну значит детерминанты имеют отношение к плотности -- это хорошо.
Т.е. Вы не поняли, о чём я писал? :roll:
iChem писал(а):
Ср фев 07, 2018 11:02 pm
Про единственную причину появления метода Кон-Шема мы говорить не будем, это уже не имеет дела к теме сообщения.
Вы Сами подняли этот вопрос, но он, действительно, не очень важен.
iChem писал(а):
Ср фев 07, 2018 11:02 pm
Такой вот интересный вопрос (повторяюсь) -- можно ли электронную плотность волновой функции мультиреференсного состояния записать в виде одного детерминанта (или двух детерминантов для спин-unrestricted плотности) Кон-Шемовских орбиталей?
Слово "детерминант" выкиньте уже наконец! :evil: Кон-Шэмовские орбитали связаны с плотностью, а то, что из них лепят детерминанты Слейтера -- это не совсем корректно. Но, вообще, мультиреференс, имхо, связан чаще всего с вырожденными (или почти вырожденными) электронными состояниями. Как мы все помним, теоремы К-Ш в стандартном виде сформулированы для невырожденных электронных состояний, но у них есть расширение в т.ч. и на вырожденные электронные состояния. И там в 1й теореме строится биекция между подпространством в пространстве волновых функций (размерности равной степени вырожденности состояния) и некоторой областью в пространстве электронных плотностей. Так что если состояния вырожденные, то там будет не одна единственно возможная электронная плотность, минимизирующая функционал энергии.
Поподробнее про это можно почитать в книжке Eberhard Engel and Reiner M. Dreizler "Density Functional Theory An Advanced Course".
И да узрел Охламон, что сие есть круть несусветная!

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 4 гостя