+++Как открыть файл с LC-MS - (XCalibur.raw)

[zenner61]

Доброго времени суток коллеги!
Вопрос для знакомых с ACD LABS и АМДИС. Мне на почту прислали файл со спектром LC-MS с расширением raw. Не знаю, почему не открывается в сих программах файл с расширением .raw (XCalibur.raw)
В AMDIS этот спектр открыть не удалось, мне передали его распечатку, но там был показан масс-спектр того пика, который мне не нужен. А масс-спектры всех пиков можно просмотреть только в ACD LABS, но в ней этот файл или не открывается, или я не там открываю или в папку с файлом нужно добавить еще какой-то пустой файл.

Простите за сложный вопрос. Не особо надеюсь, что-кто нибудь сможет что-то посоветовать, в любом случае - спасибо за внимание.

[antabu]

Ответа я не знаю, но посоветую вложить в сообщение файл в виде .zip архива.

[SkydiVAR]

Попробуйте вот это: http://mzmine.sourceforge.net/docs.shtml
Программа свободная, наши масс-спектрометристы говорят, что открывает все форматы, в том числе и проприетарные. Сам - пока не пробовал.

[Deminolog]

XCalibur лучше и открывать, чтобы не искажать интенсивности пиков. Вам все подряд оттуда надо или что-то конкретно? Ежели конкретно - кидайте файл и скажите, что Вас интересует, выдерну. Если пиков 100500 и нужны все - это тяжелее)))
mzmine действительно прикольная программа, но не всегда корректно читает...
По софту для МС есть вообще прикольный сайт:
http://www.ms-utils.org/wiki/pmwiki.php ... ftwareList

[zenner61]

Всем огромное спасибо!
Я поставил Mass++ плюс MSFilerider Termo - помогло

Код: Выделить всё

http://www.researchgate.net/post/Xcalibur-raw_files