@ SPRESI reactions base

Ответить
mishka
Сообщения: 5704
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Сообщение mishka » Вс фев 10, 2008 3:35 am

Первые 6 баз (файлы rdf из SPRESI_01.db-SPRESI_06.db) успешно вводятся-присоединяются в Chemfinder, а вот седьмой rdf уже полностью не присоединяется. Полагал что сбой в компе произошел - повторил присоединение всех 7 баз заново - результат тот же (времени столько убил!!!). Ввел в Chemfinder только 7 базу - вводится нормально. Попытался после 6 баз присоединить еще раз первую - тоже полностью не присоединяется. Короче в Chemfinder, по-видимому, тоже ограничение есть на размер файла используемой базы. При достижении файлов с расширенеим .mdb (возможно и .mst) примерно 2GB введение новых данных невозможно.
Level используемого мною Chemfinder - Ultra 11.0.
Или есть все-таки возможность обойти и эту заковыку???

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Чт фев 14, 2008 9:49 pm

В exchange 8-ая часть базы реакций (175000 реакций SPRESI_ID: 1340001-1515000).

Neptunyi
Сообщения: 171
Зарегистрирован: Вс окт 28, 2007 1:13 pm
Контактная информация:

Сообщение Neptunyi » Сб фев 16, 2008 1:24 pm

SPRESI 4 не сохранился у кого-нибудь чтобы залить?
Аналитика - начало всей химии!

sidhar
Сообщения: 441
Зарегистрирован: Вс ноя 19, 2006 8:52 pm

Сообщение sidhar » Сб фев 16, 2008 2:47 pm

Neptunyi писал(а):SPRESI 4 не сохранился у кого-нибудь чтобы залить?
http://rapidshare.com/files/92310703/SPRESI_04.rar.html

Neptunyi
Сообщения: 171
Зарегистрирован: Вс окт 28, 2007 1:13 pm
Контактная информация:

Сообщение Neptunyi » Сб фев 16, 2008 4:07 pm

sidhar, большое тебе спасибо!
Аналитика - начало всей химии!

sidhar
Сообщения: 441
Зарегистрирован: Вс ноя 19, 2006 8:52 pm

Сообщение sidhar » Сб фев 16, 2008 4:37 pm

Neptunyi писал(а):sidhar, большое тебе спасибо!
Всегда пожалуйста :)

Аватара пользователя
native
Сообщения: 715
Зарегистрирован: Чт ноя 22, 2007 8:49 am

Сообщение native » Сб фев 16, 2008 5:36 pm

Интересно - базы 1974-2005,
Уже выложил Ivan 8 баз, ссылки в 8-й заканчиваются примерно на 1988 году, даже если считать, что за последующие годы количество публикаций в год останется постоянным, то еще по идее есть 1988-1974=14 лет = 8 баз
2005-1988=17лет, т.е. 17/14*8=10 баз.
Но т.к. количество публикаций в год естественно стремительно растет, то это будет еще около 15 баз, не меньше...
Ivan ты справишься? Может чем помочь??? :wink:

Wolf1
Сообщения: 348
Зарегистрирован: Пт дек 16, 2005 8:51 am

Сообщение Wolf1 » Пн фев 18, 2008 8:57 am

mishka писал(а):Первые 6 баз (файлы rdf из SPRESI_01.db-SPRESI_06.db) успешно вводятся-присоединяются в Chemfinder, а вот седьмой rdf уже полностью не присоединяется. Полагал что сбой в компе произошел - повторил присоединение всех 7 баз заново - результат тот же (времени столько убил!!!). Ввел в Chemfinder только 7 базу - вводится нормально. Попытался после 6 баз присоединить еще раз первую - тоже полностью не присоединяется. Короче в Chemfinder, по-видимому, тоже ограничение есть на размер файла используемой базы. При достижении файлов с расширенеим .mdb (возможно и .mst) примерно 2GB введение новых данных невозможно.
Level используемого мною Chemfinder - Ultra 11.0.
Или есть все-таки возможность обойти и эту заковыку???
У меня первые 7 баз объединились (всего 1313379 записей).

Dom
Сообщения: 95
Зарегистрирован: Пт авг 03, 2007 3:55 pm

Сообщение Dom » Вт фев 19, 2008 12:26 am

Почти уверен что проблема больших файлов это проблема ваших файловых систем. FAT32, который стоит у многих пользователей, не поддерживает файлы размером более 2Гб. Так что рекомендую переходить на NTFS. Там таких проблем возникать не будет.

Сделать это можно как средствами самой винды, так и с помощью сторонних программ.

Dom
Сообщения: 95
Зарегистрирован: Пт авг 03, 2007 3:55 pm

Сообщение Dom » Вт фев 19, 2008 12:36 am

Хотел найти как в винде менять тип файловой системы. Не могу найти нужный пункт меню. Наверно уже поздно и сказывается усталость.
Но программы типа PartitionMagic это точно должны уметь делать.

Аватара пользователя
Ivan110
Сообщения: 4640
Зарегистрирован: Чт мар 22, 2007 12:26 am

Сообщение Ivan110 » Вт фев 19, 2008 12:52 am

Определите правильно поля - размер базы резко уменьшится:

RegNo - Integer
Author - Text
Citation - Text
Title - Memo
Condition - Text
Yield - Integer

FAT32 может поддерживать файлы более 2 Гб (при видеомантаже на Windows Me файлы были
поболее чем 2 Гб и ничего - всё работало)

Dom
Сообщения: 95
Зарегистрирован: Пт авг 03, 2007 3:55 pm

Сообщение Dom » Вт фев 19, 2008 10:00 am

Да, точно, каюсь. Для ФАТ32 предел 4Гб. Это у ФАТ16 2Гб.

Wolf1
Сообщения: 348
Зарегистрирован: Пт дек 16, 2005 8:51 am

Сообщение Wolf1 » Вт фев 19, 2008 10:02 am

У меня NTFS.

mishka
Сообщения: 5704
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Сообщение mishka » Вт фев 19, 2008 8:08 pm

Wolf1 писал(а):
У меня первые 7 баз объединились (всего 1313379 записей).
А какой размер mdb файла в объединенной базе (1-7)?

Аватара пользователя
ИСН
Робин Гуд
Сообщения: 8532
Зарегистрирован: Пт окт 10, 2003 5:32 pm
Контактная информация:

Сообщение ИСН » Вт фев 19, 2008 9:06 pm

ИМХО Винда не будет сама под собой пересобачивать файловую систему с FAT(whatever) на NTFS - надо хард свинтить и временно подрубить на другую машину.

Аватара пользователя
Biginelli
Сообщения: 6011
Зарегистрирован: Сб окт 29, 2005 11:15 pm

Сообщение Biginelli » Ср фев 20, 2008 12:17 am

ИМХО Винда не будет сама под собой пересобачивать файловую систему с FAT(whatever) на NTFS
Будет. Лично проверял.

Wolf1
Сообщения: 348
Зарегистрирован: Пт дек 16, 2005 8:51 am

Сообщение Wolf1 » Ср фев 20, 2008 7:57 am

mishka писал(а):
Wolf1 писал(а):
У меня первые 7 баз объединились (всего 1313379 записей).
А какой размер mdb файла в объединенной базе (1-7)?
Вечером посмотрю! А сколько записей в твою влезало?


Конвертировать в NTFS можно очень легко в Partition Magic.

Wolf1
Сообщения: 348
Зарегистрирован: Пт дек 16, 2005 8:51 am

Сообщение Wolf1 » Ср фев 20, 2008 6:00 pm

mdb (604925952 байт), mst (2734479476 байт)
Всего - 3527034 килобайт

mishka
Сообщения: 5704
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Сообщение mishka » Чт фев 21, 2008 2:57 am

объединенная база 1-6 в Chemfi*der11
число записей исходя из надписи в правом нижнем углу of 1128381 db 1128381
размер файлов
.mdb 1.91 ГБ (2,053,394,432 байт)
.mst 1.73 ГБ (1,865,248,324 байт)
.msx 69.9 МБ (73,346,139 байт)
все 3 вместе 3.71 ГБ (3,991,988,895 байт)

только база 7 в Chemfi*der11
надпись в правом нижнем углу of 184998 db 184998
размер файлов
.mdb 336 МБ (352,530,432 байт)
.mst 311 МБ (326,543,657 байт)
.msx 11.4 МБ (12,026,829 байт)
все 3 вместе 659 МБ (691,100,918 байт)

(недо)объединенная база 1-7 в Chemfi*der11
надпись в правом нижнем углу of 1179170 db 1179170
размер файлов
.mdb 1.99 ГБ (2,147,479,552 байт) (здесь наверное и есть проблема)
.mst 1.86 ГБ (2,006,409,182 байт)
.msx 75.1 МБ (78,761,549 байт)
все 3 вместе 3.94 ГБ (4,232,650,283 байт)

начиная с записи 50702 (по данным .log файла) происходят ошибки и, по-видимому, все что после этого не присоединяется:
$>...Record 50701, starting at line 6629125
$>#Cleared unnecessary label-hydrogen count from atoms 9,12,44,47
$>...Record 50701, starting at line 6629125
$>#Deleting unnecessary hydrogen atoms 17,18
$>...Record 50702, starting at line 6629284
$>#Cleared unnecessary label-hydrogen count from atoms 7,10
$>...Record 50702, starting at line 6629284
$>Ошибочный аргумент.
Field = Structure
$>...Record 50702, starting at line 6629284
$>#Deleting unnecessary hydrogen atoms 17,18
$>...Record 50703, starting at line 6629434
$>#Cleared unnecessary label-hydrogen count from atoms 7,10
$>...Record 50703, starting at line 6629434
$>Ошибочный аргумент.


Файловая система NTFS, на диске пустого места после всего этого еще 4.13 ГБ (может места мало? но сколько надо? -освободил места до 4.47 ГБ (пару сотен мегабайт) и к этой 1-7 базе попытался присоединить еще раз 7-ю, но уже с 1-ой записи по данным .log файла идут ошибки и ничего не присоединяется.)

типы полей при импортировании:
Изображение
Последний раз редактировалось mishka Чт фев 21, 2008 7:45 pm, всего редактировалось 1 раз.

Ответить

Вернуться в «Полезные материалы от участников форума»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: derevyaha2 и 17 гостей