Помогите пожалуйста проанализировать .out-файл firefly. Нужны коэффициенты разложения МО ЛКАО и матрица плотности, а я не могу их найти. Входной файл:
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 $END
$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=ENERGY MAXIT=30 MULT=1 MPLEVL=2 $END
$DATA
H2O
C1
OXYGEN 8.0 0.980999531 3.370618750 0.248775741
HYDROGEN 1.0 1.094340796 2.652393291 0.897744495
HYDROGEN 1.0 1.592878500 3.230231013 -0.496710596
$END
На выходе получается структурированный файл, в котором информация о результатах расчета разбита по группам (например:
------------
EIGENVECTORS
------------
Нужной мне группы почему-то не нахожу.
Помогите с анализом .out-файла firefly
-
viktor_1984
- Сообщения: 7
- Зарегистрирован: Пн апр 23, 2012 9:21 pm
Re: Помогите с анализом .out-файла firefly
Это то, что Вам нужно.viktor_1984 писал(а): ------------
EIGENVECTORS
------------
Матрицу плотности по дефолту FireFly не выводит. Но вообще говоря, иметь дело со столбцами цифр стОит только тогда, когда Вам надо использовать эти цифры в качестве ввода для каких-то последующих операций. Поэтому советую пользоваться визуализаторами: Molden, jmol, ChemCraft (последний особенно рекомендую, поскольку он в бОльшей степени заточен под работу с FireFly. ChemCraft слегка платный, но для пользователей из б. СССР плата чисто символическая, и есть бесплатная лайт-версия.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
-
viktor_1984
- Сообщения: 7
- Зарегистрирован: Пн апр 23, 2012 9:21 pm
Re: Помогите с анализом .out-файла firefly
sanya1024 писал(а): ------------
EIGENVECTORS
------------
Это то, что Вам нужно.
Как мне показалось, в этой группе выводятся значения энергий (собственных чисел) и соответствующие значения АО (собственных функций). Не понимаю, как из этой информации можно выкусить матрицу плотности
sanya1024 писал(а): Матрицу плотности по дефолту FireFly не выводит.
Это, наверное ответ на предыдущий вопрос. Тогда что нужно сделать, чтобы firefly вывел матрицу плотности?
Спасибо за совет. Я пользуюсь, только в данном случае задача учебная, и нужна для того, чтобы разобраться, что и откуда берет визуализатор.sanya1024 писал(а): ... советую пользоваться визуализаторами: Molden, jmol, ChemCraft (последний особенно рекомендую, поскольку он в бОльшей степени заточен под работу с FireFly)
Re: Помогите с анализом .out-файла firefly
Что значит "соответствующие значения АО (собственных функций)"? Выводятся действительно значения энергий (собственных чисел) и коэффициенты разложения МО по базисным функциям. Т.е., как раз собственные вектора (eigenvectors) в виде их разложения по базису.viktor_1984 писал(а): Как мне показалось, в этой группе выводятся значения энергий (собственных чисел) и соответствующие значения АО (собственных функций). Не понимаю, как из этой информации можно выкусить матрицу плотности
$CONTRL NPRINT=9 $END
Тогда что нужно сделать, чтобы firefly вывел матрицу плотности?
И готовьтесь изучать выдачу необозримых размеров
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
-
viktor_1984
- Сообщения: 7
- Зарегистрирован: Пн апр 23, 2012 9:21 pm
Re: Помогите с анализом .out-файла firefly
Большое спасибо! Теперь понятно
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 13 гостей