преждевременное завершение работы GAMESS-US
преждевременное завершение работы GAMESS-US
Добрый день, коллеги!
Нужна Ваша помощь. Столкнулись с проблемой: при расчете радикала и катион-радикала вылетает ошибка (файлы прилагаю). Молекулы считает нормально. Используем GAMESS-US, компилировал с библиотеками Intel, Linux Mint. Подскажите, пожалуйста, решение этой проблемы.
Спасибо.
Нужна Ваша помощь. Столкнулись с проблемой: при расчете радикала и катион-радикала вылетает ошибка (файлы прилагаю). Молекулы считает нормально. Используем GAMESS-US, компилировал с библиотеками Intel, Linux Mint. Подскажите, пожалуйста, решение этой проблемы.
Спасибо.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Попробуйте убрать карту hess=guess
После отстоя требуйте долива
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Не помогло...
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Пишет то же самое? Тогда геометрия слишком кривая
После отстоя требуйте долива
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Прежде чем писать "кривая геометрия", было бы неплохо открыть файлы и посмотреть. Нормальная геометрия.
ТС, Вы забыли задать оптимизацию во внутренних координатах: $contrl nzvar=<любое ненулевое число> и $ZMAT DLC=.t. AUTO=.t. $END
Есть и еще огрехи, не имеющие прямого отношения к этой проблеме, но чреватые другими проблемами. Например, в $contrl надо бы добавить ispher=1 -- использование сферических d функций вместо декартовых (придется пересчитывать всю серию -- это равносильно смене базиса). Впрочем, базис тоже не повредит сменить: Вы уверены, что Вам нужен базис с d функциями на C и O, но без p функций на H?
ТС, Вы забыли задать оптимизацию во внутренних координатах: $contrl nzvar=<любое ненулевое число> и $ZMAT DLC=.t. AUTO=.t. $END
Есть и еще огрехи, не имеющие прямого отношения к этой проблеме, но чреватые другими проблемами. Например, в $contrl надо бы добавить ispher=1 -- использование сферических d функций вместо декартовых (придется пересчитывать всю серию -- это равносильно смене базиса). Впрочем, базис тоже не повредит сменить: Вы уверены, что Вам нужен базис с d функциями на C и O, но без p функций на H?
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Ну, аще. Специалист пришел ...
После отстоя требуйте долива
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Спасибо. Попробую.sanya1024 писал(а):Прежде чем писать "кривая геометрия", было бы неплохо открыть файлы и посмотреть. Нормальная геометрия.
ТС, Вы забыли задать оптимизацию во внутренних координатах: $contrl nzvar=<любое ненулевое число> и $ZMAT DLC=.t. AUTO=.t. $END
Насчет базиса: такой посоветовал мне коллега, а он ссылается на статью со схожим объектом. Задача простая-определить потенциал ионизации ряда родственных структур. А какой базис на Ваш взгляд лучше для данной задачи?sanya1024 писал(а):Есть и еще огрехи, не имеющие прямого отношения к этой проблеме, но чреватые другими проблемами. Например, в $contrl надо бы добавить ispher=1 -- использование сферических d функций вместо декартовых (придется пересчитывать всю серию -- это равносильно смене базиса). Впрочем, базис тоже не повредит сменить: Вы уверены, что Вам нужен базис с d функциями на C и O, но без p функций на H?
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Вообще-то, sanya права, с виду геометрия хорошая. Я ее даже на всякий случай заоптимизировал Природой - сошлась за несколько шагов, почти не изменившись. Действительно хорошая, причина ошибки явно не в ней.VTur писал(а):Ну, аще. Специалист пришел ...
Молекула плоская. Может, оптимизация с Cs поможет?
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Больше 6 собственных чисел гессиана близки к 0. Можно сменить метод расчета начального гессиана, можно расчитать начальный гессиан честно, можно чуть изменить геометрию. Автор сам решит, что проще.
Расчет в декартовых функциях лучше описывает валентные электроны. Это можно посмотреть по частотам - сравнить расчет с 5d 7f и 6d 10 f базисными функциями - в хороших сетках декартов базис лучше воспроизводит колебания водородов
[ Post made via Android ]
Расчет в декартовых функциях лучше описывает валентные электроны. Это можно посмотреть по частотам - сравнить расчет с 5d 7f и 6d 10 f базисными функциями - в хороших сетках декартов базис лучше воспроизводит колебания водородов
[ Post made via Android ]

После отстоя требуйте долива
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Хамите.VTur писал(а):Ну, аще. Специалист пришел ...
Мой совет вполне рабочий: оптимизация в автоматически сгенерированных внутренних координатах сошлась за 5 шагов (аттач).
Что касается базиса... Чтобы лучше описать валентные электроны, нужно брать адекватный базис. Например, трехэкспонентный (хотя бы 6-311G(d,p)). p функции на водородах тоже, как ни странно, нужны -- хотя бы потому, что там возможно образование внутримолекулярной водородной связи (между двумя OH группами на фениле). Сейчас проверяю, насколько раздуется/сдуется задача при добавке p функций на водороды и при замене декартовых d функций на сферические.
Да, еще одну полезную вещь забыли: $SCF dirscf=.t. $END
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Ну что: 6-31G(d) декартовы d функции -- 277 функций в базисе
6-31G(d,p) декартовы d функции -- 310 функций в базисе (тут уже dirscf оказалось критично)
6-31G(d,p) сферические d функции -- 293 функции.
Итого: с добавкой p функций и выкидыванием лишних d базис расширился, причем расширился в правильную сторону (не за счет избыточных и линейно зависимых поляризационных функций на углеродах, а за счет недостающих поляризационных функций на водородах).
VTur, а Ваш любимый Гауссиан всегда по дефолту использует сферические функции (проверьте сами). Да и большинство других программ тоже. Поэтому лучше всегда включать сферические функции, чтобы сравнение с другими расчетами было корректно.
6-31G(d,p) декартовы d функции -- 310 функций в базисе (тут уже dirscf оказалось критично)
6-31G(d,p) сферические d функции -- 293 функции.
Итого: с добавкой p функций и выкидыванием лишних d базис расширился, причем расширился в правильную сторону (не за счет избыточных и линейно зависимых поляризационных функций на углеродах, а за счет недостающих поляризационных функций на водородах).
VTur, а Ваш любимый Гауссиан всегда по дефолту использует сферические функции (проверьте сами). Да и большинство других программ тоже. Поэтому лучше всегда включать сферические функции, чтобы сравнение с другими расчетами было корректно.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
А вот и выдачи с добавкой p функций и со сферическими d (аттач).
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Огромное спасибо, sanya1024! Вы очень помогли.
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Да, я всегда пишу в нем 6d 10fsanya1024 писал(а):VTur, а Ваш любимый Гауссиан всегда по дефолту использует сферические функции (проверьте сами). Да и большинство других программ тоже. Поэтому лучше всегда включать сферические функции, чтобы сравнение с другими расчетами было корректно.
И в ГАМЕССЕ тоже пишу в явном виде ISPHER=.
Что бы потом, возвратившись к расчету, не просматривать весь вывод,а сориентироваться по первой странице выдачи.
После отстоя требуйте долива
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Добрый день!
Снова столкнулся с проблемой, не хочет считать нормально, обрывается. Файлы во вложении. Подскажите, пожалуйста, что делать.
Спасибо.
Снова столкнулся с проблемой, не хочет считать нормально, обрывается. Файлы во вложении. Подскажите, пожалуйста, что делать.
Спасибо.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
У Вас осциллирует роцедура SCF. Нужно изменить условия сходимости.
После отстоя требуйте долива
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Подскажите, пожалуйста, как изменить условия сходимости?
Re: преждевременное завершение работы GAMESS-US
Итак, Вы считаете нейтральный радикал. Вы уверены, что Вам нужен именно UHF, а не более легкий вариант ROHF? Кстати, поставьте inttyp=hondo вместо pople.
Настройки сходимости SCF находятся в группе $SCF, смотрите мануал. Но то, что у Вас получилось, никакими настройками $SCF не лечится.
Настройки сходимости SCF находятся в группе $SCF, смотрите мануал. Но то, что у Вас получилось, никакими настройками $SCF не лечится.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 10 гостей